FuNGI

A0A2N5RX27

Protein Details

Accession

A0A2N5RX27

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-417	GKPGMARKIVKKKKPTLDDW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
101-119	ARGGRGRGRGGADRGGRGR
400-411	PGMARKIVKKKK

Subcellular Location(s)

mito 19.5, cyto_mito 12.166, cyto_nucl 4.333, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRGTRGRGRGRAREASAEVIQNEAVLDPILSQLTNVSVQPTPAGEAGLASSSVGGIAGEPGASKPAASKFKPRMVKRVVKTEPDVDPNEGDKSSGAASARGGRGRGRGGADRGGRGRPEIVMTASGAFAMGPAEASVRRTAQGPSRSGMRRIDNSLAAGTDDRSKPERSGLSTPWDGGPSEMLELYSDIDEDGSDARDDNDAPDDDHRAKVADLNDITLEHSMAPLSLPWDPKRIAEREKLIHARNLKLAKLAQAKVKKEASAHLQDCKPPSRESTHHHSAAAACSSSSSSNPHSISSKVEHLDDKDENIKRDVKLKKDQLDELSNVGKQFTRGKKAVHRAANSGSEGTPSGRTEGGERGMYIFQFPRVFPQFREAGNGGSSSVAEAGGSGSVGEGKPGMARKIVKKKKPTLDDWLGWGKGGKRTECMGVPPGTPDDAPPVQGQIGELVIRRSGRVQMVIADVAYDVLPGAQPTFHQEIAVIDPSPLSHLRAMFVLGSTNHKFIVAPDVSSLLKREQSLKASSGIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.76
2	0.72
3	0.64
4	0.6
5	0.54
6	0.49
7	0.4
8	0.33
9	0.29
10	0.22
11	0.2
12	0.14
13	0.11
14	0.07
15	0.07
16	0.05
17	0.07
18	0.08
19	0.07
20	0.07
21	0.07
22	0.1
23	0.11
24	0.11
25	0.13
26	0.13
27	0.14
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.14
32	0.14
33	0.1
34	0.1
35	0.1
36	0.1
37	0.09
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.05
43	0.04
44	0.03
45	0.04
46	0.04
47	0.04
48	0.05
49	0.05
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.1
54	0.18
55	0.26
56	0.29
57	0.39
58	0.45
59	0.54
60	0.64
61	0.65
62	0.67
63	0.69
64	0.76
65	0.72
66	0.75
67	0.72
68	0.69
69	0.69
70	0.65
71	0.59
72	0.56
73	0.53
74	0.44
75	0.4
76	0.36
77	0.34
78	0.28
79	0.24
80	0.17
81	0.16
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.11
86	0.13
87	0.18
88	0.21
89	0.22
90	0.22
91	0.22
92	0.26
93	0.27
94	0.29
95	0.27
96	0.29
97	0.31
98	0.36
99	0.37
100	0.38
101	0.38
102	0.37
103	0.34
104	0.31
105	0.28
106	0.22
107	0.22
108	0.18
109	0.17
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.12
114	0.11
115	0.08
116	0.07
117	0.05
118	0.05
119	0.04
120	0.03
121	0.03
122	0.05
123	0.06
124	0.08
125	0.09
126	0.1
127	0.11
128	0.12
129	0.15
130	0.22
131	0.28
132	0.28
133	0.28
134	0.35
135	0.37
136	0.4
137	0.43
138	0.4
139	0.38
140	0.4
141	0.42
142	0.35
143	0.33
144	0.3
145	0.24
146	0.2
147	0.16
148	0.13
149	0.15
150	0.15
151	0.17
152	0.19
153	0.21
154	0.21
155	0.26
156	0.28
157	0.27
158	0.31
159	0.31
160	0.34
161	0.33
162	0.33
163	0.29
164	0.27
165	0.22
166	0.17
167	0.15
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.07
172	0.06
173	0.07
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.1
190	0.09
191	0.1
192	0.11
193	0.14
194	0.15
195	0.15
196	0.15
197	0.13
198	0.12
199	0.15
200	0.15
201	0.16
202	0.15
203	0.15
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.12
208	0.11
209	0.06
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.08
217	0.11
218	0.12
219	0.16
220	0.16
221	0.19
222	0.24
223	0.27
224	0.29
225	0.31
226	0.35
227	0.34
228	0.4
229	0.43
230	0.39
231	0.39
232	0.37
233	0.34
234	0.34
235	0.34
236	0.28
237	0.25
238	0.24
239	0.26
240	0.29
241	0.29
242	0.29
243	0.34
244	0.35
245	0.38
246	0.38
247	0.33
248	0.28
249	0.29
250	0.28
251	0.3
252	0.3
253	0.3
254	0.3
255	0.31
256	0.33
257	0.35
258	0.31
259	0.25
260	0.26
261	0.27
262	0.3
263	0.33
264	0.39
265	0.41
266	0.4
267	0.39
268	0.37
269	0.32
270	0.29
271	0.25
272	0.16
273	0.09
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.16
281	0.16
282	0.17
283	0.18
284	0.19
285	0.21
286	0.21
287	0.22
288	0.19
289	0.19
290	0.2
291	0.19
292	0.23
293	0.21
294	0.2
295	0.24
296	0.25
297	0.25
298	0.27
299	0.29
300	0.26
301	0.34
302	0.37
303	0.36
304	0.43
305	0.48
306	0.52
307	0.52
308	0.54
309	0.5
310	0.49
311	0.43
312	0.37
313	0.32
314	0.26
315	0.22
316	0.2
317	0.15
318	0.14
319	0.21
320	0.24
321	0.29
322	0.3
323	0.35
324	0.42
325	0.51
326	0.58
327	0.56
328	0.53
329	0.5
330	0.51
331	0.5
332	0.42
333	0.34
334	0.26
335	0.2
336	0.18
337	0.16
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.15
345	0.17
346	0.15
347	0.15
348	0.15
349	0.16
350	0.15
351	0.15
352	0.13
353	0.14
354	0.15
355	0.15
356	0.2
357	0.25
358	0.27
359	0.26
360	0.3
361	0.31
362	0.29
363	0.35
364	0.29
365	0.24
366	0.23
367	0.23
368	0.18
369	0.14
370	0.14
371	0.08
372	0.08
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.03
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.08
387	0.11
388	0.12
389	0.15
390	0.21
391	0.3
392	0.41
393	0.51
394	0.57
395	0.64
396	0.73
397	0.78
398	0.81
399	0.77
400	0.76
401	0.75
402	0.68
403	0.63
404	0.6
405	0.5
406	0.42
407	0.39
408	0.32
409	0.3
410	0.33
411	0.29
412	0.26
413	0.28
414	0.32
415	0.31
416	0.31
417	0.31
418	0.28
419	0.27
420	0.26
421	0.26
422	0.23
423	0.22
424	0.19
425	0.2
426	0.19
427	0.2
428	0.18
429	0.18
430	0.17
431	0.17
432	0.17
433	0.11
434	0.11
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.13
439	0.13
440	0.14
441	0.15
442	0.19
443	0.2
444	0.21
445	0.21
446	0.21
447	0.23
448	0.23
449	0.2
450	0.16
451	0.13
452	0.12
453	0.11
454	0.08
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.13
463	0.17
464	0.17
465	0.17
466	0.17
467	0.18
468	0.23
469	0.25
470	0.19
471	0.14
472	0.14
473	0.15
474	0.18
475	0.17
476	0.15
477	0.16
478	0.16
479	0.18
480	0.18
481	0.2
482	0.16
483	0.16
484	0.17
485	0.15
486	0.21
487	0.23
488	0.24
489	0.22
490	0.22
491	0.22
492	0.19
493	0.28
494	0.22
495	0.2
496	0.19
497	0.22
498	0.23
499	0.24
500	0.25
501	0.2
502	0.23
503	0.24
504	0.29
505	0.32
506	0.37
507	0.41
508	0.4

A0A2N5RX27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer