Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2N5SDH3

Protein Details
Accession A0A2N5SDH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-436LTTTPKTSTVKRKKKQRLQTWDKMLKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
422-423KK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018983  U3_snoRNA-assocProt_15_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09384  UTP15_C  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MDFVKLQVLQHPRLTRSNAERSEGRYWRDFKNPVFVKSYAPISHITFSPKVPHRYCISSGTKIQIYSPKTLRVVKTISRFQLPARCSDIKPDGKLVVSSDDSGLIQVFDLNSRAILRTFREIKQPVHVVRFSPTSTNVLTCSDDSTVRLYDLATSKTIRTFMGHTDYVRAGDFTGPNLILSGSYDGQLKLWDDRMDENGGLAWSLNHEHPIEKILIHPTSTLAISAGGPVANVWDILGGNGSKQPLISLSNHQKTITSLCWARGPCSSDFDEGSQSTRRLLSGGLDGLVKVYDISTGSYKVRHTIKYSSPILSMAVSPDDSLLVVGCTDGSLSMRKRPKSSNEIALNKSLNAQKLSSAINQGSDPTAKETEIVWGRQEAHLIEEMAGAGMESAPEETANEHHDAHTTGILTTTPKTSTVKRKKKQRLQTWDKMLKAFRYGDALDSVLSSTVPPNTTFSLIRELMHRDGLHQALSGRDEVSLAPILRLISRHITDPRWFNIASDVLNCIINLYRAVLGKSQTIDALISAISFRISDELKLHSTLFAVNGQLEMILSGYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.54
3 0.56
4 0.62
5 0.58
6 0.58
7 0.58
8 0.57
9 0.62
10 0.59
11 0.56
12 0.53
13 0.54
14 0.54
15 0.59
16 0.6
17 0.53
18 0.58
19 0.58
20 0.54
21 0.55
22 0.51
23 0.46
24 0.44
25 0.47
26 0.37
27 0.34
28 0.34
29 0.31
30 0.33
31 0.3
32 0.33
33 0.28
34 0.29
35 0.36
36 0.41
37 0.47
38 0.47
39 0.51
40 0.5
41 0.54
42 0.55
43 0.55
44 0.53
45 0.5
46 0.51
47 0.51
48 0.48
49 0.43
50 0.44
51 0.42
52 0.39
53 0.41
54 0.41
55 0.41
56 0.43
57 0.49
58 0.47
59 0.46
60 0.49
61 0.48
62 0.52
63 0.54
64 0.53
65 0.5
66 0.5
67 0.48
68 0.5
69 0.44
70 0.41
71 0.41
72 0.42
73 0.38
74 0.44
75 0.49
76 0.47
77 0.48
78 0.46
79 0.41
80 0.37
81 0.38
82 0.32
83 0.27
84 0.23
85 0.21
86 0.18
87 0.16
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.09
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.15
104 0.22
105 0.27
106 0.29
107 0.37
108 0.41
109 0.41
110 0.46
111 0.51
112 0.47
113 0.48
114 0.47
115 0.39
116 0.38
117 0.39
118 0.33
119 0.28
120 0.26
121 0.23
122 0.23
123 0.22
124 0.2
125 0.19
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.17
133 0.15
134 0.13
135 0.13
136 0.11
137 0.14
138 0.16
139 0.17
140 0.16
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.2
145 0.16
146 0.15
147 0.16
148 0.17
149 0.22
150 0.23
151 0.21
152 0.24
153 0.24
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.17
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.06
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.09
234 0.11
235 0.17
236 0.26
237 0.3
238 0.31
239 0.31
240 0.3
241 0.28
242 0.3
243 0.23
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.2
248 0.2
249 0.2
250 0.2
251 0.22
252 0.19
253 0.22
254 0.22
255 0.19
256 0.2
257 0.19
258 0.18
259 0.15
260 0.17
261 0.15
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.05
282 0.06
283 0.08
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.16
288 0.19
289 0.2
290 0.23
291 0.27
292 0.3
293 0.36
294 0.38
295 0.34
296 0.31
297 0.29
298 0.26
299 0.21
300 0.17
301 0.1
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.08
319 0.1
320 0.17
321 0.24
322 0.27
323 0.31
324 0.36
325 0.43
326 0.47
327 0.51
328 0.53
329 0.56
330 0.59
331 0.57
332 0.55
333 0.48
334 0.4
335 0.39
336 0.32
337 0.26
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.18
342 0.2
343 0.18
344 0.18
345 0.16
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.17
358 0.2
359 0.2
360 0.17
361 0.18
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.14
366 0.13
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.05
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.09
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.11
401 0.13
402 0.16
403 0.23
404 0.34
405 0.44
406 0.54
407 0.6
408 0.71
409 0.8
410 0.87
411 0.91
412 0.9
413 0.9
414 0.89
415 0.91
416 0.91
417 0.87
418 0.79
419 0.73
420 0.66
421 0.57
422 0.52
423 0.43
424 0.33
425 0.31
426 0.28
427 0.25
428 0.23
429 0.21
430 0.16
431 0.14
432 0.13
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.07
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.14
441 0.16
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.24
446 0.24
447 0.24
448 0.24
449 0.27
450 0.26
451 0.3
452 0.28
453 0.23
454 0.26
455 0.27
456 0.24
457 0.2
458 0.19
459 0.17
460 0.18
461 0.18
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.13
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.14
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.19
476 0.2
477 0.25
478 0.29
479 0.33
480 0.38
481 0.43
482 0.42
483 0.4
484 0.39
485 0.34
486 0.34
487 0.32
488 0.27
489 0.23
490 0.22
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.12
499 0.14
500 0.15
501 0.17
502 0.19
503 0.19
504 0.22
505 0.23
506 0.22
507 0.19
508 0.19
509 0.17
510 0.14
511 0.13
512 0.09
513 0.08
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.06
518 0.07
519 0.09
520 0.11
521 0.13
522 0.15
523 0.2
524 0.22
525 0.24
526 0.24
527 0.21
528 0.21
529 0.2
530 0.19
531 0.17
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.13
536 0.12
537 0.1
538 0.08