FuNGI

A0A2N5W0Y1

Protein Details

Accession

A0A2N5W0Y1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-101	TSTSNKKRPYVSCKGGKHNPD	Hydrophilic
1250-1269	LPTGSRGKTKASKESRRHSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 7, mito_nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MKLEAALAEISTIGVNVMQELVSVTIMEKITEKRPALMERLLGDIDTLKNPFLLIAKLRQIANHDQVKKIKDGGHSTALATSTSNKKRPYVSCKGGKHNPDAPHDESRCWTLHPELRNTNKKAANYATTTAQSRDAADGQAEQYAYNTSCTSSGKESVILDSGASQHMFNSLKYFVDSEPTVIYIVTGSGRENASLMATRKGTARLMMRDNTIITLTDSLYVPNLATNLVSFAQLIKEKADIVAESGMMMITLNGCHTVCVDTSKNLFELVGLKTEHHTALTVTTRTENVFNKWHKRMGHASAARVQAAIDENIPKSMTTCDTCQRGKMTKLPFKGYFNPAEKSMDIIHGDLVGPISPATNGGARYFLTLVDQHTGFININLLAEKADATKAIVEYRTYFEKQTGNPIKKIVTDGGGEFCNKVLGDILKEAGIQHNVSPPYTPQHNGIAERANRTIIEMTRCLMLQANMAAKWWGEAVVTAASTTNCLPSLAKSRASPLQLLLKIKPNPHALRPFGCRAWALKPKVNREEKFDSIAWDGTFVGYTNDMSSYRIFRHVDQKIIHTRQVQFDESVFPHCKALCKSLGVAPRREDDSLPIFQSDSILPYDEEEQVDSSHNLPEEQQGENSQEPSSEELPSGRRWVYVQDFQPEKHIESNINAQNIIQGGRTRRQACFMTSIIDPKSHNMAMSSPERQHWIEAELKEVNNMRKHQVWIERLRVPADRPIASTWAYRRKLGPDNQVVEYKARICAQGFRQTYGVNFELKYAPTGKAASLRLLLSFAVNSSLQIHQLDVRSAFLTCPLQDTVTLLPPQGYRCPNGTVFELRKAIYGLKQALLVWYKRLSEFLETIGFRASTSDPCVFSRPELQGKPATWIYAHVDDLVIISSDPLVLKTEFEHEFNIKYLGAAEFLLGMNINRTATGLHVHQMQYIERKLIEYGLDQSPPASCPLNPKGHLKKATEAERCELVNLGINYRAIVGSLNYLSVLTRPDISHAVSVLSQHLEAPGIQHLRAAEQVFRYLSGTKQVGLVFTKAPSLAISAYVDSDWGNCPDTRRSATGFVILTGDQVLSWKATRQATVSLSSTEAEYKALSDLGREITWLTNLISELSLNYSPSNIPVNVDNQGAIDLARSEISQNGFRTKHMDIRLHFVRELITSKLIKLRYVRTDRNCADFLTKPTGRATIRRSLSAINVTAPETSASRLRTQSNPACQIISPVTDLAVKRSRGNTSYLARQDATGNQSARERPQASLPTGSRGKTKASKESRRHSS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.05
3	0.06
4	0.06
5	0.06
6	0.06
7	0.07
8	0.07
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.11
13	0.12
14	0.12
15	0.15
16	0.18
17	0.23
18	0.31
19	0.32
20	0.32
21	0.37
22	0.41
23	0.43
24	0.43
25	0.42
26	0.35
27	0.37
28	0.33
29	0.27
30	0.23
31	0.21
32	0.19
33	0.19
34	0.19
35	0.15
36	0.15
37	0.15
38	0.16
39	0.15
40	0.17
41	0.18
42	0.23
43	0.29
44	0.33
45	0.34
46	0.35
47	0.39
48	0.42
49	0.47
50	0.5
51	0.47
52	0.5
53	0.56
54	0.57
55	0.55
56	0.52
57	0.48
58	0.46
59	0.5
60	0.48
61	0.48
62	0.45
63	0.43
64	0.4
65	0.36
66	0.29
67	0.22
68	0.23
69	0.27
70	0.34
71	0.4
72	0.41
73	0.45
74	0.53
75	0.61
76	0.65
77	0.65
78	0.67
79	0.7
80	0.75
81	0.8
82	0.81
83	0.78
84	0.76
85	0.73
86	0.7
87	0.67
88	0.66
89	0.62
90	0.63
91	0.59
92	0.54
93	0.48
94	0.46
95	0.4
96	0.35
97	0.32
98	0.3
99	0.34
100	0.38
101	0.44
102	0.49
103	0.58
104	0.66
105	0.68
106	0.69
107	0.68
108	0.63
109	0.61
110	0.57
111	0.53
112	0.48
113	0.46
114	0.41
115	0.39
116	0.4
117	0.35
118	0.33
119	0.28
120	0.25
121	0.26
122	0.23
123	0.2
124	0.19
125	0.19
126	0.16
127	0.18
128	0.16
129	0.13
130	0.12
131	0.14
132	0.14
133	0.14
134	0.14
135	0.12
136	0.14
137	0.16
138	0.19
139	0.2
140	0.22
141	0.22
142	0.24
143	0.24
144	0.24
145	0.24
146	0.21
147	0.16
148	0.14
149	0.14
150	0.13
151	0.13
152	0.11
153	0.1
154	0.15
155	0.16
156	0.15
157	0.18
158	0.17
159	0.17
160	0.18
161	0.2
162	0.15
163	0.19
164	0.19
165	0.17
166	0.17
167	0.17
168	0.16
169	0.13
170	0.13
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.16
183	0.17
184	0.18
185	0.19
186	0.2
187	0.22
188	0.24
189	0.24
190	0.24
191	0.28
192	0.3
193	0.35
194	0.37
195	0.37
196	0.36
197	0.35
198	0.31
199	0.26
200	0.2
201	0.16
202	0.15
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.08
219	0.08
220	0.12
221	0.14
222	0.15
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.15
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.09
233	0.09
234	0.08
235	0.06
236	0.06
237	0.04
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.07
245	0.09
246	0.09
247	0.14
248	0.15
249	0.17
250	0.19
251	0.21
252	0.2
253	0.19
254	0.18
255	0.14
256	0.16
257	0.14
258	0.16
259	0.15
260	0.15
261	0.16
262	0.18
263	0.18
264	0.14
265	0.14
266	0.1
267	0.14
268	0.18
269	0.17
270	0.16
271	0.18
272	0.18
273	0.19
274	0.24
275	0.22
276	0.22
277	0.3
278	0.37
279	0.44
280	0.47
281	0.51
282	0.48
283	0.51
284	0.54
285	0.51
286	0.54
287	0.49
288	0.48
289	0.48
290	0.49
291	0.43
292	0.35
293	0.29
294	0.21
295	0.2
296	0.17
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.15
301	0.15
302	0.13
303	0.12
304	0.13
305	0.15
306	0.15
307	0.18
308	0.23
309	0.29
310	0.3
311	0.32
312	0.36
313	0.38
314	0.39
315	0.43
316	0.48
317	0.49
318	0.53
319	0.57
320	0.55
321	0.55
322	0.57
323	0.55
324	0.54
325	0.5
326	0.47
327	0.42
328	0.41
329	0.36
330	0.31
331	0.27
332	0.22
333	0.19
334	0.17
335	0.15
336	0.12
337	0.12
338	0.1
339	0.09
340	0.06
341	0.06
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.06
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.12
353	0.12
354	0.11
355	0.1
356	0.11
357	0.12
358	0.14
359	0.13
360	0.12
361	0.12
362	0.14
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.08
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.08
378	0.08
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.15
384	0.2
385	0.2
386	0.19
387	0.21
388	0.24
389	0.24
390	0.33
391	0.4
392	0.39
393	0.4
394	0.41
395	0.39
396	0.36
397	0.38
398	0.28
399	0.2
400	0.18
401	0.17
402	0.17
403	0.17
404	0.16
405	0.14
406	0.12
407	0.11
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.08
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.15
423	0.15
424	0.15
425	0.16
426	0.15
427	0.18
428	0.2
429	0.2
430	0.18
431	0.23
432	0.25
433	0.26
434	0.27
435	0.29
436	0.29
437	0.3
438	0.29
439	0.24
440	0.21
441	0.21
442	0.22
443	0.17
444	0.19
445	0.16
446	0.16
447	0.16
448	0.16
449	0.15
450	0.13
451	0.11
452	0.09
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.1
459	0.09
460	0.08
461	0.06
462	0.04
463	0.04
464	0.05
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.06
469	0.06
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.07
475	0.07
476	0.09
477	0.17
478	0.19
479	0.21
480	0.2
481	0.24
482	0.27
483	0.29
484	0.27
485	0.21
486	0.26
487	0.27
488	0.29
489	0.28
490	0.31
491	0.33
492	0.34
493	0.37
494	0.38
495	0.38
496	0.41
497	0.45
498	0.41
499	0.42
500	0.45
501	0.43
502	0.36
503	0.34
504	0.29
505	0.25
506	0.3
507	0.33
508	0.33
509	0.33
510	0.38
511	0.45
512	0.53
513	0.6
514	0.54
515	0.54
516	0.56
517	0.53
518	0.52
519	0.45
520	0.38
521	0.3
522	0.3
523	0.22
524	0.16
525	0.14
526	0.1
527	0.09
528	0.07
529	0.06
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.06
534	0.06
535	0.08
536	0.09
537	0.1
538	0.11
539	0.16
540	0.17
541	0.18
542	0.27
543	0.28
544	0.32
545	0.31
546	0.36
547	0.4
548	0.41
549	0.42
550	0.37
551	0.37
552	0.37
553	0.39
554	0.34
555	0.26
556	0.24
557	0.24
558	0.2
559	0.23
560	0.2
561	0.17
562	0.17
563	0.17
564	0.2
565	0.18
566	0.21
567	0.18
568	0.18
569	0.18
570	0.22
571	0.28
572	0.27
573	0.28
574	0.27
575	0.27
576	0.28
577	0.28
578	0.23
579	0.2
580	0.21
581	0.2
582	0.18
583	0.16
584	0.15
585	0.14
586	0.14
587	0.11
588	0.09
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.1
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.08
602	0.09
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.11
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.14
612	0.14
613	0.14
614	0.12
615	0.1
616	0.1
617	0.12
618	0.12
619	0.1
620	0.1
621	0.1
622	0.12
623	0.13
624	0.15
625	0.12
626	0.11
627	0.11
628	0.15
629	0.18
630	0.21
631	0.23
632	0.26
633	0.27
634	0.27
635	0.32
636	0.29
637	0.26
638	0.23
639	0.22
640	0.16
641	0.17
642	0.24
643	0.22
644	0.22
645	0.2
646	0.18
647	0.18
648	0.17
649	0.16
650	0.09
651	0.09
652	0.11
653	0.15
654	0.21
655	0.23
656	0.22
657	0.26
658	0.27
659	0.26
660	0.28
661	0.24
662	0.21
663	0.19
664	0.22
665	0.18
666	0.19
667	0.17
668	0.15
669	0.18
670	0.15
671	0.15
672	0.12
673	0.13
674	0.14
675	0.17
676	0.19
677	0.16
678	0.17
679	0.2
680	0.2
681	0.19
682	0.16
683	0.16
684	0.19
685	0.18
686	0.2
687	0.19
688	0.18
689	0.2
690	0.22
691	0.24
692	0.23
693	0.25
694	0.24
695	0.25
696	0.26
697	0.29
698	0.33
699	0.36
700	0.37
701	0.41
702	0.41
703	0.4
704	0.4
705	0.37
706	0.31
707	0.29
708	0.28
709	0.23
710	0.21
711	0.21
712	0.21
713	0.21
714	0.22
715	0.22
716	0.28
717	0.29
718	0.29
719	0.3
720	0.33
721	0.39
722	0.43
723	0.47
724	0.44
725	0.46
726	0.47
727	0.47
728	0.42
729	0.36
730	0.31
731	0.23
732	0.18
733	0.15
734	0.14
735	0.13
736	0.17
737	0.21
738	0.29
739	0.29
740	0.28
741	0.28
742	0.27
743	0.27
744	0.26
745	0.23
746	0.16
747	0.15
748	0.15
749	0.15
750	0.15
751	0.16
752	0.14
753	0.13
754	0.13
755	0.14
756	0.13
757	0.16
758	0.17
759	0.17
760	0.16
761	0.16
762	0.14
763	0.14
764	0.14
765	0.09
766	0.08
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.07
771	0.08
772	0.09
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.11
780	0.12
781	0.11
782	0.11
783	0.1
784	0.1
785	0.11
786	0.1
787	0.12
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.13
792	0.12
793	0.14
794	0.15
795	0.12
796	0.13
797	0.14
798	0.16
799	0.2
800	0.2
801	0.19
802	0.21
803	0.24
804	0.24
805	0.25
806	0.25
807	0.26
808	0.27
809	0.29
810	0.28
811	0.25
812	0.24
813	0.23
814	0.22
815	0.18
816	0.21
817	0.18
818	0.17
819	0.17
820	0.17
821	0.19
822	0.21
823	0.19
824	0.17
825	0.17
826	0.18
827	0.17
828	0.19
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.16
833	0.19
834	0.18
835	0.18
836	0.18
837	0.16
838	0.13
839	0.14
840	0.14
841	0.11
842	0.15
843	0.17
844	0.17
845	0.19
846	0.22
847	0.2
848	0.21
849	0.25
850	0.25
851	0.3
852	0.29
853	0.31
854	0.33
855	0.33
856	0.36
857	0.31
858	0.27
859	0.2
860	0.21
861	0.22
862	0.19
863	0.19
864	0.14
865	0.14
866	0.13
867	0.13
868	0.11
869	0.07
870	0.05
871	0.04
872	0.04
873	0.05
874	0.05
875	0.05
876	0.07
877	0.07
878	0.08
879	0.08
880	0.13
881	0.14
882	0.15
883	0.18
884	0.17
885	0.18
886	0.18
887	0.18
888	0.14
889	0.12
890	0.12
891	0.1
892	0.09
893	0.08
894	0.07
895	0.07
896	0.07
897	0.07
898	0.06
899	0.06
900	0.06
901	0.07
902	0.07
903	0.06
904	0.06
905	0.06
906	0.07
907	0.09
908	0.09
909	0.1
910	0.14
911	0.15
912	0.17
913	0.18
914	0.19
915	0.22
916	0.23
917	0.22
918	0.18
919	0.19
920	0.17
921	0.17
922	0.16
923	0.12
924	0.15
925	0.16
926	0.16
927	0.15
928	0.15
929	0.15
930	0.15
931	0.15
932	0.12
933	0.11
934	0.18
935	0.26
936	0.33
937	0.35
938	0.44
939	0.5
940	0.57
941	0.63
942	0.58
943	0.58
944	0.58
945	0.65
946	0.62
947	0.57
948	0.51
949	0.47
950	0.44
951	0.38
952	0.3
953	0.21
954	0.21
955	0.18
956	0.16
957	0.15
958	0.15
959	0.14
960	0.14
961	0.14
962	0.08
963	0.08
964	0.07
965	0.08
966	0.09
967	0.08
968	0.08
969	0.08
970	0.08
971	0.09
972	0.1
973	0.08
974	0.1
975	0.1
976	0.13
977	0.15
978	0.16
979	0.16
980	0.15
981	0.15
982	0.13
983	0.14
984	0.13
985	0.12
986	0.11
987	0.1
988	0.1
989	0.09
990	0.09
991	0.09
992	0.13
993	0.14
994	0.14
995	0.15
996	0.15
997	0.16
998	0.19
999	0.19
1000	0.16
1001	0.16
1002	0.19
1003	0.18
1004	0.18
1005	0.19
1006	0.17
1007	0.16
1008	0.2
1009	0.2
1010	0.17
1011	0.2
1012	0.2
1013	0.21
1014	0.21
1015	0.22
1016	0.17
1017	0.16
1018	0.17
1019	0.14
1020	0.14
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.1
1024	0.1
1025	0.11
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.09
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.13
1035	0.13
1036	0.17
1037	0.21
1038	0.26
1039	0.29
1040	0.3
1041	0.32
1042	0.33
1043	0.33
1044	0.35
1045	0.3
1046	0.26
1047	0.24
1048	0.2
1049	0.17
1050	0.14
1051	0.12
1052	0.07
1053	0.08
1054	0.08
1055	0.08
1056	0.09
1057	0.11
1058	0.16
1059	0.18
1060	0.2
1061	0.21
1062	0.26
1063	0.27
1064	0.3
1065	0.29
1066	0.24
1067	0.24
1068	0.23
1069	0.21
1070	0.18
1071	0.16
1072	0.13
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.12
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.12
1080	0.14
1081	0.13
1082	0.13
1083	0.13
1084	0.13
1085	0.14
1086	0.14
1087	0.12
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.12
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.13
1095	0.13
1096	0.12
1097	0.12
1098	0.13
1099	0.13
1100	0.15
1101	0.19
1102	0.15
1103	0.16
1104	0.18
1105	0.2
1106	0.21
1107	0.22
1108	0.19
1109	0.15
1110	0.15
1111	0.14
1112	0.11
1113	0.09
1114	0.07
1115	0.07
1116	0.08
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.11
1120	0.15
1121	0.2
1122	0.22
1123	0.28
1124	0.29
1125	0.3
1126	0.34
1127	0.34
1128	0.38
1129	0.4
1130	0.45
1131	0.39
1132	0.47
1133	0.52
1134	0.51
1135	0.48
1136	0.41
1137	0.35
1138	0.31
1139	0.32
1140	0.26
1141	0.26
1142	0.23
1143	0.25
1144	0.3
1145	0.3
1146	0.31
1147	0.34
1148	0.39
1149	0.44
1150	0.52
1151	0.6
1152	0.61
1153	0.71
1154	0.69
1155	0.7
1156	0.63
1157	0.55
1158	0.51
1159	0.46
1160	0.44
1161	0.43
1162	0.41
1163	0.36
1164	0.37
1165	0.42
1166	0.4
1167	0.43
1168	0.43
1169	0.43
1170	0.45
1171	0.46
1172	0.46
1173	0.42
1174	0.44
1175	0.42
1176	0.37
1177	0.3
1178	0.28
1179	0.27
1180	0.25
1181	0.23
1182	0.19
1183	0.14
1184	0.16
1185	0.18
1186	0.2
1187	0.24
1188	0.28
1189	0.32
1190	0.35
1191	0.44
1192	0.5
1193	0.55
1194	0.58
1195	0.55
1196	0.53
1197	0.48
1198	0.48
1199	0.41
1200	0.34
1201	0.26
1202	0.2
1203	0.19
1204	0.22
1205	0.22
1206	0.24
1207	0.29
1208	0.29
1209	0.32
1210	0.37
1211	0.42
1212	0.4
1213	0.45
1214	0.45
1215	0.44
1216	0.52
1217	0.51
1218	0.5
1219	0.45
1220	0.44
1221	0.42
1222	0.4
1223	0.4
1224	0.37
1225	0.33
1226	0.31
1227	0.36
1228	0.39
1229	0.41
1230	0.44
1231	0.41
1232	0.36
1233	0.44
1234	0.48
1235	0.46
1236	0.51
1237	0.48
1238	0.47
1239	0.49
1240	0.49
1241	0.47
1242	0.42
1243	0.47
1244	0.46
1245	0.52
1246	0.54
1247	0.6
1248	0.69
1249	0.74

A0A2N5W0Y1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer