Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NTR9

Protein Details
Accession J3NTR9    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-295GRSATKRENSSRKGEPRRPLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-292KGEPR
Subcellular Location(s) mito 9, extr 6, cyto 4, E.R. 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041412  Xrn1_helical  
Gene Ontology GO:0004540  F:RNA nuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF18332  XRN1_D1  
PF17846  XRN_M  
Amino Acid Sequences MTYVGRVGNHFKEKQDPLASMLLDAMSLRASIEGHGDDEDKGDGRQGEDDTEATTIRPEGRYQDARPPRIIVDGGTGGMTADPRMDDKPFRDPITPASPENSQVTASGLNADMNFKLGQPFKPFEQLMGVLPDPSKKIVPTRRLLDAMATKNDFFADDEKARNGFGVAFNLDFLYGLTDGAFLNKSALAGFPSFATLLYLAILGFHSVDVFQQESRNESMVVTLSGTEAKAAVTSAKMKLGQRCHVGYPFLQEAMVVRVSDELFDYVLDAKWEYLGRSATKRENSSRKGEPRRPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.45
4 0.41
5 0.43
6 0.39
7 0.31
8 0.28
9 0.19
10 0.15
11 0.13
12 0.1
13 0.06
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.06
18 0.06
19 0.09
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.13
26 0.14
27 0.12
28 0.11
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.12
45 0.13
46 0.16
47 0.24
48 0.29
49 0.31
50 0.4
51 0.47
52 0.49
53 0.5
54 0.48
55 0.41
56 0.38
57 0.36
58 0.26
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.14
63 0.12
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.08
72 0.11
73 0.14
74 0.16
75 0.24
76 0.28
77 0.3
78 0.3
79 0.3
80 0.33
81 0.38
82 0.38
83 0.3
84 0.29
85 0.27
86 0.28
87 0.29
88 0.24
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.11
104 0.12
105 0.15
106 0.18
107 0.2
108 0.2
109 0.25
110 0.25
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.16
115 0.17
116 0.16
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.09
124 0.17
125 0.23
126 0.3
127 0.34
128 0.36
129 0.38
130 0.39
131 0.38
132 0.33
133 0.32
134 0.27
135 0.24
136 0.22
137 0.19
138 0.18
139 0.18
140 0.15
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.1
200 0.11
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.08
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.11
222 0.12
223 0.15
224 0.19
225 0.23
226 0.3
227 0.36
228 0.4
229 0.43
230 0.44
231 0.45
232 0.44
233 0.42
234 0.37
235 0.36
236 0.32
237 0.26
238 0.23
239 0.19
240 0.17
241 0.18
242 0.19
243 0.12
244 0.1
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.15
262 0.19
263 0.22
264 0.27
265 0.34
266 0.39
267 0.46
268 0.52
269 0.59
270 0.65
271 0.66
272 0.69
273 0.73
274 0.75
275 0.79