Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NMI7

Protein Details
Accession J3NMI7    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-164DPFKAQSRRAQRSPPPKDVCHydrophilic
207-231EQPAPAKPAEPKPRRPKASKATSKVHydrophilic
348-370ASKNPSPTKLKAPKKKPRTITELHydrophilic
407-432HGHPVSRPRKPDRRRKGKQGHRQLLLBasic
716-740PSSKPATTSPKKPRGRPRKDSSVATHydrophilic
794-815VSPEASPKPRGKPKKTPPSVAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
178-194VKPAARKPPAATRRKKA
211-226PAKPAEPKPRRPKASK
332-365KKRKAIQLIGPSREASASKNPSPTKLKAPKKKPR
412-426SRPRKPDRRRKGKQG
719-734KPATTSPKKPRGRPRK
751-811APAKPRGRPKKTAATASSPKPRGRSKTSSPAASPKPRGRAKKTVSPEASPKPRGKPKKTPP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASPSRFLPSSPSRPGTYAPRSSSPDLPSVGELVARYAKQPTLRSGSNATPIPADVATSFTTASTLLRTTPAISAETQRAGAREPLITTPQKSLAEREIIEISPDVSLVVPEPVSRAEKRTKHLAAPQVAAQGSEENHDSVINIDPFKAQSRRAQRSPPPKDVCEIPQPIGQAPSKVVKPAARKPPAATRRKKAETVSRHFSPSVTEQPAPAKPAEPKPRRPKASKATSKVTAVPIPEPDPTDVEEAFCLEPALPRRSDWTPPRETATQRPSDSPCLRVSASQAPVDTQEPSTIGPGGVFETLQDTFACPLAQPPGRSHSPEKDVPPVAALKKRKAIQLIGPSREASASKNPSPTKLKAPKKKPRTITELATAAYIAPASNGAAEVAKPGSIVNYLEPEGAEHALQHGHPVSRPRKPDRRRKGKQGHRQLLLSPVSAMDQSAQQDFVFGTSSQLAQEQSPTFLKDLHQALKISSELPEDPFASPSVAGSDKGRKLWAAGARGEDGGLVDVEVIDLLNSPAFPDDPMAVVRAEMQKKMPESPSDRLEKGRSKIAPAIEIESSASDSDSEAFTAPVANTQSKSTHFSTQRHPSAPQPAWGPPESRPHMTPTVDLDEDAGDYEPPPSNQEAQQIQQLQQHDLESRQAAAPRPNFELMTDAQLASQVTKYGFKAIKRRTAMIALLDQCWVSKTGGVPAAAGSAASMSTTATMARAGSKEPSSKPATTSPKKPRGRPRKDSSVATTTSESASGAAAPAKPRGRPKKTAATASSPKPRGRSKTSSPAASPKPRGRAKKTVSPEASPKPRGKPKKTPPSVAASANSKAISASMPPPPVPARARTPTRGRKAATQSAIEIADSDDESNFSRSPHSSPEHVFSSPGAVDLSVSEDVDITLAPGSPTTATRQSEAFSFITKAVKTAPRSDDVANPSWHEKMLMYDPIVLEDLAAWLNSGQLDRVGFDGEVSSYDVKMWCESRSICCLWRVNLRGKVRKRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.55
4 0.55
5 0.54
6 0.52
7 0.54
8 0.58
9 0.6
10 0.62
11 0.56
12 0.52
13 0.46
14 0.42
15 0.36
16 0.31
17 0.27
18 0.22
19 0.18
20 0.16
21 0.19
22 0.17
23 0.18
24 0.2
25 0.23
26 0.28
27 0.32
28 0.35
29 0.38
30 0.4
31 0.43
32 0.45
33 0.45
34 0.46
35 0.45
36 0.38
37 0.32
38 0.3
39 0.29
40 0.23
41 0.2
42 0.13
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.11
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.15
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.18
61 0.22
62 0.24
63 0.25
64 0.25
65 0.24
66 0.23
67 0.24
68 0.25
69 0.23
70 0.21
71 0.21
72 0.23
73 0.28
74 0.31
75 0.31
76 0.31
77 0.35
78 0.37
79 0.36
80 0.37
81 0.36
82 0.38
83 0.36
84 0.36
85 0.33
86 0.29
87 0.29
88 0.25
89 0.2
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.24
104 0.32
105 0.38
106 0.43
107 0.51
108 0.52
109 0.54
110 0.59
111 0.62
112 0.58
113 0.54
114 0.52
115 0.47
116 0.42
117 0.36
118 0.3
119 0.23
120 0.19
121 0.18
122 0.17
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.16
129 0.16
130 0.15
131 0.16
132 0.17
133 0.18
134 0.25
135 0.27
136 0.25
137 0.31
138 0.41
139 0.5
140 0.54
141 0.62
142 0.65
143 0.73
144 0.78
145 0.8
146 0.76
147 0.69
148 0.67
149 0.62
150 0.58
151 0.56
152 0.51
153 0.43
154 0.38
155 0.37
156 0.35
157 0.35
158 0.31
159 0.23
160 0.22
161 0.25
162 0.23
163 0.24
164 0.27
165 0.28
166 0.35
167 0.43
168 0.5
169 0.52
170 0.53
171 0.55
172 0.62
173 0.67
174 0.7
175 0.7
176 0.68
177 0.72
178 0.75
179 0.76
180 0.72
181 0.72
182 0.72
183 0.71
184 0.7
185 0.62
186 0.6
187 0.56
188 0.49
189 0.43
190 0.38
191 0.37
192 0.34
193 0.32
194 0.3
195 0.35
196 0.37
197 0.35
198 0.3
199 0.26
200 0.27
201 0.36
202 0.45
203 0.49
204 0.57
205 0.65
206 0.75
207 0.8
208 0.8
209 0.8
210 0.8
211 0.83
212 0.83
213 0.79
214 0.76
215 0.71
216 0.68
217 0.62
218 0.55
219 0.46
220 0.38
221 0.33
222 0.29
223 0.27
224 0.25
225 0.23
226 0.21
227 0.2
228 0.19
229 0.2
230 0.17
231 0.16
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.07
238 0.11
239 0.16
240 0.2
241 0.18
242 0.19
243 0.24
244 0.27
245 0.35
246 0.39
247 0.42
248 0.44
249 0.45
250 0.5
251 0.5
252 0.51
253 0.52
254 0.52
255 0.51
256 0.47
257 0.5
258 0.48
259 0.53
260 0.51
261 0.45
262 0.38
263 0.35
264 0.33
265 0.3
266 0.3
267 0.28
268 0.29
269 0.27
270 0.26
271 0.23
272 0.24
273 0.24
274 0.21
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.07
297 0.08
298 0.14
299 0.17
300 0.17
301 0.19
302 0.24
303 0.27
304 0.31
305 0.34
306 0.34
307 0.37
308 0.41
309 0.41
310 0.42
311 0.41
312 0.36
313 0.34
314 0.32
315 0.3
316 0.32
317 0.33
318 0.31
319 0.37
320 0.39
321 0.41
322 0.4
323 0.39
324 0.39
325 0.45
326 0.48
327 0.45
328 0.43
329 0.4
330 0.37
331 0.35
332 0.28
333 0.21
334 0.22
335 0.25
336 0.26
337 0.33
338 0.34
339 0.39
340 0.44
341 0.44
342 0.46
343 0.5
344 0.58
345 0.61
346 0.71
347 0.76
348 0.8
349 0.86
350 0.84
351 0.8
352 0.79
353 0.74
354 0.67
355 0.61
356 0.53
357 0.45
358 0.36
359 0.29
360 0.2
361 0.15
362 0.11
363 0.06
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.1
397 0.19
398 0.23
399 0.28
400 0.36
401 0.43
402 0.53
403 0.61
404 0.71
405 0.74
406 0.8
407 0.82
408 0.86
409 0.88
410 0.88
411 0.9
412 0.9
413 0.87
414 0.79
415 0.72
416 0.61
417 0.57
418 0.47
419 0.37
420 0.25
421 0.17
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.09
441 0.09
442 0.07
443 0.1
444 0.09
445 0.11
446 0.11
447 0.12
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.15
452 0.18
453 0.18
454 0.2
455 0.2
456 0.19
457 0.2
458 0.2
459 0.15
460 0.12
461 0.11
462 0.09
463 0.1
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.09
470 0.09
471 0.07
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.09
476 0.14
477 0.15
478 0.16
479 0.17
480 0.15
481 0.15
482 0.19
483 0.21
484 0.19
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.19
489 0.18
490 0.13
491 0.09
492 0.07
493 0.05
494 0.04
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.02
500 0.02
501 0.02
502 0.02
503 0.03
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.06
516 0.09
517 0.14
518 0.15
519 0.15
520 0.16
521 0.17
522 0.19
523 0.22
524 0.21
525 0.21
526 0.25
527 0.29
528 0.32
529 0.34
530 0.34
531 0.34
532 0.37
533 0.38
534 0.35
535 0.37
536 0.32
537 0.31
538 0.33
539 0.32
540 0.29
541 0.23
542 0.24
543 0.17
544 0.17
545 0.14
546 0.11
547 0.1
548 0.08
549 0.07
550 0.05
551 0.05
552 0.06
553 0.05
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.07
561 0.09
562 0.1
563 0.1
564 0.12
565 0.14
566 0.15
567 0.2
568 0.2
569 0.26
570 0.31
571 0.33
572 0.4
573 0.48
574 0.51
575 0.48
576 0.47
577 0.43
578 0.47
579 0.45
580 0.4
581 0.33
582 0.3
583 0.32
584 0.32
585 0.3
586 0.24
587 0.32
588 0.32
589 0.32
590 0.31
591 0.31
592 0.35
593 0.33
594 0.31
595 0.26
596 0.26
597 0.24
598 0.23
599 0.18
600 0.14
601 0.13
602 0.13
603 0.09
604 0.05
605 0.05
606 0.07
607 0.08
608 0.08
609 0.1
610 0.11
611 0.13
612 0.14
613 0.2
614 0.2
615 0.2
616 0.25
617 0.25
618 0.26
619 0.27
620 0.27
621 0.23
622 0.22
623 0.22
624 0.18
625 0.17
626 0.17
627 0.13
628 0.13
629 0.13
630 0.15
631 0.17
632 0.22
633 0.24
634 0.25
635 0.28
636 0.28
637 0.27
638 0.24
639 0.25
640 0.19
641 0.19
642 0.17
643 0.14
644 0.13
645 0.14
646 0.13
647 0.11
648 0.11
649 0.08
650 0.08
651 0.1
652 0.11
653 0.17
654 0.2
655 0.24
656 0.33
657 0.38
658 0.47
659 0.47
660 0.49
661 0.44
662 0.44
663 0.41
664 0.34
665 0.33
666 0.26
667 0.24
668 0.22
669 0.19
670 0.16
671 0.15
672 0.14
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.13
677 0.16
678 0.16
679 0.15
680 0.14
681 0.14
682 0.12
683 0.11
684 0.07
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.03
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.04
694 0.05
695 0.06
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.12
700 0.16
701 0.2
702 0.21
703 0.27
704 0.3
705 0.31
706 0.33
707 0.38
708 0.46
709 0.47
710 0.56
711 0.6
712 0.66
713 0.72
714 0.78
715 0.8
716 0.81
717 0.85
718 0.86
719 0.84
720 0.84
721 0.83
722 0.8
723 0.75
724 0.7
725 0.61
726 0.53
727 0.46
728 0.35
729 0.3
730 0.25
731 0.18
732 0.12
733 0.1
734 0.08
735 0.07
736 0.08
737 0.09
738 0.1
739 0.17
740 0.19
741 0.23
742 0.34
743 0.44
744 0.5
745 0.56
746 0.62
747 0.67
748 0.7
749 0.74
750 0.69
751 0.67
752 0.66
753 0.66
754 0.68
755 0.63
756 0.59
757 0.58
758 0.61
759 0.59
760 0.61
761 0.62
762 0.6
763 0.66
764 0.69
765 0.67
766 0.62
767 0.63
768 0.64
769 0.64
770 0.64
771 0.6
772 0.64
773 0.67
774 0.73
775 0.73
776 0.74
777 0.73
778 0.74
779 0.75
780 0.75
781 0.72
782 0.67
783 0.67
784 0.66
785 0.68
786 0.65
787 0.63
788 0.62
789 0.68
790 0.74
791 0.76
792 0.77
793 0.8
794 0.84
795 0.86
796 0.84
797 0.78
798 0.76
799 0.71
800 0.64
801 0.57
802 0.5
803 0.44
804 0.39
805 0.34
806 0.25
807 0.21
808 0.18
809 0.14
810 0.13
811 0.15
812 0.18
813 0.2
814 0.2
815 0.24
816 0.25
817 0.31
818 0.31
819 0.33
820 0.35
821 0.42
822 0.48
823 0.52
824 0.61
825 0.64
826 0.7
827 0.73
828 0.67
829 0.68
830 0.7
831 0.72
832 0.66
833 0.58
834 0.5
835 0.46
836 0.43
837 0.34
838 0.26
839 0.17
840 0.14
841 0.12
842 0.11
843 0.08
844 0.09
845 0.11
846 0.13
847 0.13
848 0.12
849 0.16
850 0.17
851 0.2
852 0.26
853 0.29
854 0.31
855 0.34
856 0.39
857 0.39
858 0.38
859 0.36
860 0.28
861 0.28
862 0.23
863 0.2
864 0.15
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.14
869 0.1
870 0.1
871 0.09
872 0.09
873 0.09
874 0.09
875 0.09
876 0.05
877 0.05
878 0.06
879 0.06
880 0.06
881 0.07
882 0.08
883 0.1
884 0.15
885 0.21
886 0.22
887 0.24
888 0.25
889 0.25
890 0.26
891 0.29
892 0.25
893 0.2
894 0.2
895 0.21
896 0.24
897 0.23
898 0.22
899 0.25
900 0.31
901 0.32
902 0.39
903 0.41
904 0.4
905 0.44
906 0.45
907 0.46
908 0.45
909 0.47
910 0.41
911 0.39
912 0.39
913 0.36
914 0.34
915 0.28
916 0.22
917 0.21
918 0.25
919 0.26
920 0.24
921 0.26
922 0.26
923 0.26
924 0.27
925 0.21
926 0.16
927 0.12
928 0.11
929 0.09
930 0.08
931 0.07
932 0.06
933 0.07
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.1
938 0.1
939 0.11
940 0.12
941 0.13
942 0.12
943 0.12
944 0.12
945 0.1
946 0.11
947 0.13
948 0.13
949 0.12
950 0.14
951 0.15
952 0.16
953 0.2
954 0.2
955 0.19
956 0.24
957 0.26
958 0.3
959 0.35
960 0.37
961 0.36
962 0.41
963 0.46
964 0.44
965 0.52
966 0.53
967 0.55
968 0.61
969 0.68
970 0.71