Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5VBA3

Protein Details
Accession A0A2N5VBA3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61DGTLHRYKLSKEKNQQPPKLEQSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MFSFSPFHHSSSSQTLNGHPTALLLHPTGDTLFIGTSDGTLHRYKLSKEKNQQPPKLEQSLIKLTTQGNQLTASAGIDSLHFIKEINALVVLSAANISLYDITHWKLQLNSSKWTKSLASSATLQTNILHQLNQQLIPNSNYPPQAENNSDQIPILFSILAVPCKRRLVLFSWKDGQWLDPKEINLPHQVRSLTFPTPLNLFLGYSTGDYATIKLTIPYNSHQPIIHQISEPFPSPISHLITRAITDSPSPIPNSSTPPPKVNSLSSLAFKTTSGLVTLGLTGQAKVVKNSVIRLGSPTHEVIGIKDQIITFFNQNGQLTRSQTLQQHPGLNSIPSSIIYPTPPSETIVKQPYLISLLSSTTTNQSTSSLIIHSIPTLSHLQTIPFPPTQDAHKPYSTANSSSSSPSGKKPSLEPAFQPRPSQHHHPHLLTSSPNSSLIFLIAPQSNQPENSFQYQLECLQMKPWPIQIQQLIELGEYEEALGLMDGLDETHLPNKAVLLKKLNALCGVIDFSKYKYDRAIDTFISLSINPAKVVALYPQEISGTFAKRREEWEQLFGGRRAENYRSTPLIIGPHPPVSEPAHHPHRSRPGSDVGSLPRSGFSHHAANTLVDDDRRSVLSGPSAAPTKGKTADPTLTKTTTDDKGQDDVHFRSSVEVLIRYLTDRRQQVNRAFGATQDRQGLKEEEGGQGGEGKQAVEDLQPSETIFQLEDRPISEIETRAELVQVAKVIDTSLFKSYLVLRPTMLGPLCRLPNWCEVEQVEGLLMEAKRYHELLDLYHGKGQHAKALKLLKKMAMNEEDVQAQIEPTVRYLQKLGSTHLSLILESSKWVFSLCQEQEEEEEGGSTAGCSLGLVKAALEIFVADLSAVESLPKHKIVAFLESLKSPTPIRLYLEFVVRSQKDQDPFFHEQLIQIYVVEFKRLRGLGQLERAQGIYQKLLDHLQDSTSYSSNWVLGRLPPDDMYEARALALGNVGQHDTALRIYVERLGDLGAAEEYCKRVYDKTSGADGSIFLCLLKICLRPTLPEMMSGAGHHKEVKELETKSDGVEEEKGDSGRGGFLGSERLLEAGLELMAQHGHKIADVDELVLLVPPLVPLARLGLFFRRAVAARAPRLRRQRILVSCLAARDLSLATARAALEQRRVKVDQRRLCTGCGKRLGNSVIAVHPP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.37
3 0.4
4 0.39
5 0.35
6 0.26
7 0.21
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.14
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.09
25 0.1
26 0.13
27 0.14
28 0.16
29 0.2
30 0.24
31 0.28
32 0.37
33 0.46
34 0.53
35 0.62
36 0.71
37 0.77
38 0.84
39 0.87
40 0.83
41 0.82
42 0.8
43 0.76
44 0.69
45 0.61
46 0.58
47 0.6
48 0.56
49 0.47
50 0.42
51 0.36
52 0.38
53 0.4
54 0.34
55 0.26
56 0.25
57 0.24
58 0.22
59 0.22
60 0.17
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.07
80 0.06
81 0.05
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.08
88 0.1
89 0.12
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.2
94 0.26
95 0.34
96 0.35
97 0.42
98 0.46
99 0.48
100 0.46
101 0.48
102 0.43
103 0.37
104 0.39
105 0.33
106 0.29
107 0.3
108 0.33
109 0.32
110 0.31
111 0.28
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.22
116 0.19
117 0.17
118 0.22
119 0.25
120 0.27
121 0.27
122 0.25
123 0.27
124 0.29
125 0.31
126 0.29
127 0.3
128 0.3
129 0.29
130 0.29
131 0.31
132 0.33
133 0.35
134 0.35
135 0.36
136 0.35
137 0.34
138 0.3
139 0.26
140 0.22
141 0.18
142 0.16
143 0.1
144 0.08
145 0.11
146 0.13
147 0.18
148 0.18
149 0.21
150 0.24
151 0.27
152 0.28
153 0.25
154 0.27
155 0.28
156 0.38
157 0.4
158 0.43
159 0.46
160 0.45
161 0.46
162 0.43
163 0.4
164 0.37
165 0.35
166 0.33
167 0.31
168 0.32
169 0.35
170 0.37
171 0.37
172 0.38
173 0.37
174 0.34
175 0.35
176 0.36
177 0.31
178 0.34
179 0.35
180 0.27
181 0.28
182 0.27
183 0.24
184 0.25
185 0.25
186 0.21
187 0.17
188 0.15
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.12
203 0.14
204 0.17
205 0.19
206 0.26
207 0.27
208 0.29
209 0.27
210 0.27
211 0.33
212 0.36
213 0.35
214 0.29
215 0.28
216 0.29
217 0.31
218 0.31
219 0.23
220 0.18
221 0.16
222 0.17
223 0.2
224 0.22
225 0.22
226 0.21
227 0.23
228 0.23
229 0.23
230 0.23
231 0.19
232 0.15
233 0.14
234 0.15
235 0.16
236 0.18
237 0.19
238 0.18
239 0.2
240 0.22
241 0.27
242 0.3
243 0.36
244 0.37
245 0.39
246 0.41
247 0.43
248 0.44
249 0.4
250 0.38
251 0.34
252 0.33
253 0.31
254 0.31
255 0.27
256 0.24
257 0.21
258 0.19
259 0.15
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.19
278 0.23
279 0.2
280 0.2
281 0.22
282 0.22
283 0.2
284 0.22
285 0.21
286 0.16
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.19
291 0.18
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.17
298 0.13
299 0.13
300 0.15
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.26
311 0.3
312 0.33
313 0.34
314 0.36
315 0.35
316 0.37
317 0.34
318 0.3
319 0.26
320 0.2
321 0.17
322 0.12
323 0.13
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.19
333 0.19
334 0.25
335 0.28
336 0.28
337 0.25
338 0.25
339 0.24
340 0.23
341 0.21
342 0.15
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.08
363 0.1
364 0.12
365 0.11
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.18
371 0.19
372 0.18
373 0.18
374 0.17
375 0.18
376 0.22
377 0.27
378 0.29
379 0.3
380 0.3
381 0.31
382 0.3
383 0.35
384 0.33
385 0.27
386 0.25
387 0.23
388 0.23
389 0.24
390 0.25
391 0.21
392 0.21
393 0.23
394 0.28
395 0.27
396 0.27
397 0.28
398 0.36
399 0.38
400 0.38
401 0.37
402 0.4
403 0.46
404 0.46
405 0.46
406 0.39
407 0.4
408 0.43
409 0.49
410 0.47
411 0.48
412 0.52
413 0.51
414 0.51
415 0.47
416 0.43
417 0.35
418 0.3
419 0.23
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.15
424 0.13
425 0.12
426 0.09
427 0.08
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.13
433 0.13
434 0.14
435 0.15
436 0.15
437 0.17
438 0.2
439 0.21
440 0.17
441 0.18
442 0.19
443 0.18
444 0.18
445 0.17
446 0.13
447 0.14
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.19
452 0.19
453 0.2
454 0.24
455 0.24
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.2
460 0.16
461 0.15
462 0.11
463 0.09
464 0.07
465 0.05
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.02
474 0.02
475 0.02
476 0.03
477 0.03
478 0.06
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.14
484 0.16
485 0.19
486 0.21
487 0.22
488 0.26
489 0.28
490 0.27
491 0.22
492 0.2
493 0.17
494 0.13
495 0.13
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.16
501 0.16
502 0.16
503 0.17
504 0.19
505 0.2
506 0.23
507 0.25
508 0.19
509 0.2
510 0.19
511 0.17
512 0.16
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.12
530 0.12
531 0.13
532 0.14
533 0.17
534 0.18
535 0.19
536 0.23
537 0.25
538 0.29
539 0.28
540 0.29
541 0.28
542 0.29
543 0.3
544 0.27
545 0.24
546 0.18
547 0.17
548 0.17
549 0.18
550 0.2
551 0.2
552 0.22
553 0.21
554 0.22
555 0.21
556 0.19
557 0.19
558 0.16
559 0.16
560 0.15
561 0.16
562 0.15
563 0.15
564 0.16
565 0.15
566 0.17
567 0.18
568 0.22
569 0.29
570 0.32
571 0.33
572 0.36
573 0.44
574 0.44
575 0.42
576 0.38
577 0.36
578 0.34
579 0.34
580 0.32
581 0.24
582 0.24
583 0.23
584 0.2
585 0.15
586 0.13
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.16
591 0.16
592 0.17
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.15
597 0.12
598 0.08
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.1
609 0.1
610 0.11
611 0.11
612 0.11
613 0.11
614 0.13
615 0.14
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.21
620 0.23
621 0.26
622 0.27
623 0.25
624 0.25
625 0.25
626 0.25
627 0.23
628 0.23
629 0.21
630 0.19
631 0.21
632 0.22
633 0.22
634 0.22
635 0.21
636 0.21
637 0.19
638 0.17
639 0.16
640 0.15
641 0.14
642 0.12
643 0.11
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.09
648 0.1
649 0.12
650 0.16
651 0.2
652 0.23
653 0.27
654 0.34
655 0.37
656 0.42
657 0.4
658 0.37
659 0.33
660 0.31
661 0.33
662 0.28
663 0.26
664 0.24
665 0.24
666 0.22
667 0.25
668 0.24
669 0.18
670 0.21
671 0.2
672 0.17
673 0.17
674 0.16
675 0.13
676 0.13
677 0.13
678 0.09
679 0.08
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.07
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.08
696 0.09
697 0.09
698 0.09
699 0.11
700 0.1
701 0.12
702 0.13
703 0.12
704 0.12
705 0.13
706 0.13
707 0.11
708 0.11
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.14
725 0.18
726 0.19
727 0.18
728 0.16
729 0.17
730 0.17
731 0.2
732 0.17
733 0.12
734 0.13
735 0.16
736 0.17
737 0.17
738 0.19
739 0.18
740 0.25
741 0.3
742 0.28
743 0.26
744 0.25
745 0.28
746 0.26
747 0.23
748 0.15
749 0.1
750 0.09
751 0.11
752 0.1
753 0.07
754 0.08
755 0.09
756 0.11
757 0.11
758 0.12
759 0.11
760 0.12
761 0.12
762 0.19
763 0.21
764 0.21
765 0.23
766 0.22
767 0.2
768 0.24
769 0.24
770 0.22
771 0.23
772 0.22
773 0.25
774 0.34
775 0.37
776 0.38
777 0.39
778 0.38
779 0.38
780 0.39
781 0.4
782 0.33
783 0.33
784 0.29
785 0.28
786 0.25
787 0.21
788 0.2
789 0.14
790 0.11
791 0.09
792 0.09
793 0.08
794 0.09
795 0.15
796 0.14
797 0.15
798 0.16
799 0.17
800 0.21
801 0.22
802 0.23
803 0.22
804 0.23
805 0.22
806 0.24
807 0.22
808 0.17
809 0.16
810 0.15
811 0.1
812 0.1
813 0.11
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.18
820 0.18
821 0.2
822 0.2
823 0.21
824 0.22
825 0.25
826 0.23
827 0.14
828 0.13
829 0.1
830 0.1
831 0.09
832 0.07
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.03
837 0.04
838 0.04
839 0.05
840 0.05
841 0.05
842 0.06
843 0.07
844 0.07
845 0.06
846 0.05
847 0.05
848 0.05
849 0.05
850 0.03
851 0.03
852 0.04
853 0.04
854 0.04
855 0.04
856 0.05
857 0.07
858 0.1
859 0.11
860 0.11
861 0.12
862 0.17
863 0.18
864 0.23
865 0.23
866 0.24
867 0.25
868 0.25
869 0.26
870 0.22
871 0.22
872 0.18
873 0.18
874 0.18
875 0.19
876 0.22
877 0.23
878 0.27
879 0.27
880 0.32
881 0.29
882 0.27
883 0.33
884 0.29
885 0.29
886 0.29
887 0.32
888 0.32
889 0.33
890 0.36
891 0.36
892 0.41
893 0.41
894 0.39
895 0.34
896 0.3
897 0.3
898 0.28
899 0.2
900 0.13
901 0.12
902 0.15
903 0.14
904 0.17
905 0.16
906 0.15
907 0.2
908 0.21
909 0.21
910 0.22
911 0.27
912 0.29
913 0.36
914 0.4
915 0.35
916 0.36
917 0.36
918 0.31
919 0.29
920 0.25
921 0.19
922 0.16
923 0.15
924 0.16
925 0.18
926 0.18
927 0.16
928 0.15
929 0.14
930 0.14
931 0.16
932 0.17
933 0.16
934 0.15
935 0.15
936 0.16
937 0.17
938 0.16
939 0.15
940 0.14
941 0.16
942 0.2
943 0.19
944 0.2
945 0.18
946 0.2
947 0.21
948 0.2
949 0.21
950 0.18
951 0.17
952 0.15
953 0.15
954 0.13
955 0.11
956 0.12
957 0.08
958 0.08
959 0.09
960 0.09
961 0.08
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.13
971 0.13
972 0.12
973 0.12
974 0.11
975 0.11
976 0.1
977 0.1
978 0.07
979 0.07
980 0.07
981 0.08
982 0.1
983 0.1
984 0.11
985 0.12
986 0.15
987 0.19
988 0.25
989 0.29
990 0.31
991 0.36
992 0.35
993 0.34
994 0.32
995 0.28
996 0.22
997 0.18
998 0.14
999 0.08
1000 0.08
1001 0.07
1002 0.09
1003 0.12
1004 0.14
1005 0.15
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.24
1009 0.27
1010 0.34
1011 0.3
1012 0.29
1013 0.29
1014 0.25
1015 0.25
1016 0.23
1017 0.24
1018 0.17
1019 0.18
1020 0.18
1021 0.17
1022 0.2
1023 0.21
1024 0.24
1025 0.27
1026 0.27
1027 0.3
1028 0.31
1029 0.32
1030 0.28
1031 0.29
1032 0.26
1033 0.21
1034 0.22
1035 0.19
1036 0.18
1037 0.2
1038 0.2
1039 0.17
1040 0.17
1041 0.15
1042 0.13
1043 0.12
1044 0.1
1045 0.08
1046 0.09
1047 0.13
1048 0.13
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.12
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.1
1055 0.06
1056 0.06
1057 0.05
1058 0.05
1059 0.05
1060 0.07
1061 0.07
1062 0.07
1063 0.08
1064 0.09
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.11
1068 0.14
1069 0.14
1070 0.14
1071 0.12
1072 0.12
1073 0.12
1074 0.11
1075 0.1
1076 0.05
1077 0.05
1078 0.04
1079 0.05
1080 0.05
1081 0.06
1082 0.06
1083 0.1
1084 0.11
1085 0.12
1086 0.15
1087 0.2
1088 0.23
1089 0.23
1090 0.24
1091 0.25
1092 0.24
1093 0.27
1094 0.33
1095 0.36
1096 0.42
1097 0.51
1098 0.56
1099 0.6
1100 0.7
1101 0.75
1102 0.73
1103 0.72
1104 0.73
1105 0.71
1106 0.72
1107 0.68
1108 0.62
1109 0.56
1110 0.5
1111 0.44
1112 0.34
1113 0.26
1114 0.21
1115 0.16
1116 0.14
1117 0.13
1118 0.13
1119 0.12
1120 0.14
1121 0.14
1122 0.16
1123 0.21
1124 0.22
1125 0.3
1126 0.35
1127 0.38
1128 0.42
1129 0.46
1130 0.5
1131 0.56
1132 0.63
1133 0.63
1134 0.64
1135 0.7
1136 0.66
1137 0.67
1138 0.69
1139 0.66
1140 0.65
1141 0.65
1142 0.61
1143 0.54
1144 0.59
1145 0.57
1146 0.51
1147 0.46
1148 0.4