Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PDL6

Protein Details
Accession J3PDL6    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-59AADAKLEKKAKKEKKRQERAAAEAGKBasic
66-91QNGDGEGKKKKKDKSKKRAAQADETEBasic
104-127GEEEEPAKKRKKKDIPIRAKEDDABasic
137-163EAPAAGKEEKKKKKKKSKEAQEDEEVKBasic
167-194GEAADKKAKKDKKKKKQKKEEQQQQGEEBasic
210-230GASAPTSKKERKKAKKAAAAAHydrophilic
340-362KTEGRQDKIKAKNQKLNEERARRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-61KLEKKAKKEKKRQERAAAEAGKEA
68-84GDGEGKKKKKDKSKKRA
110-123AKKRKKKDIPIRAK
140-157AAGKEEKKKKKKKSKEAQ
163-185KEAAGEAADKKAKKDKKKKKQKK
216-226SKKERKKAKKA
347-369KIKAKNQKLNEERARRVKAEREA
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MKRKAEPKASEGADLVSKKRRRDEDEDPATAAAAADAKLEKKAKKEKKRQERAAAEAGKEATAAEQNGDGEGKKKKKDKSKKRAAQADETEETEETAVPAAAEGEEEEPAKKRKKKDIPIRAKEDDAAAAAEAINGEAPAAGKEEKKKKKKKSKEAQEDEEVKEAAGEAADKKAKKDKKKKKQKKEEQQQQGEEAEDDEGATETAAAANGASAPTSKKERKKAKKAAAAAAEAEADGGEGDEAGAAAGKKVRFIVFVGNLPFTATAEAVRAHFATLRPSSVRLLTQRDDPARSRGIAFVEFDNYSAIKTCLAKMHHSEFDDGVSPARRINVELTAGGGGKTEGRQDKIKAKNQKLNEERARRVKAEREAKEKEDDQDGIHPSRRAQMNRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.36
4 0.39
5 0.43
6 0.51
7 0.57
8 0.59
9 0.65
10 0.7
11 0.72
12 0.75
13 0.71
14 0.64
15 0.55
16 0.47
17 0.39
18 0.28
19 0.18
20 0.11
21 0.08
22 0.08
23 0.1
24 0.11
25 0.16
26 0.22
27 0.25
28 0.33
29 0.44
30 0.53
31 0.63
32 0.73
33 0.79
34 0.84
35 0.93
36 0.94
37 0.93
38 0.9
39 0.86
40 0.85
41 0.78
42 0.68
43 0.6
44 0.5
45 0.39
46 0.31
47 0.24
48 0.15
49 0.14
50 0.13
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.13
58 0.22
59 0.27
60 0.34
61 0.41
62 0.49
63 0.59
64 0.71
65 0.77
66 0.8
67 0.85
68 0.87
69 0.9
70 0.91
71 0.86
72 0.84
73 0.79
74 0.75
75 0.65
76 0.58
77 0.49
78 0.39
79 0.33
80 0.24
81 0.17
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.11
96 0.18
97 0.27
98 0.32
99 0.38
100 0.48
101 0.58
102 0.68
103 0.76
104 0.81
105 0.84
106 0.87
107 0.88
108 0.81
109 0.71
110 0.61
111 0.51
112 0.4
113 0.29
114 0.2
115 0.11
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.18
131 0.28
132 0.38
133 0.49
134 0.59
135 0.68
136 0.78
137 0.87
138 0.9
139 0.91
140 0.92
141 0.93
142 0.92
143 0.87
144 0.84
145 0.78
146 0.68
147 0.58
148 0.47
149 0.35
150 0.26
151 0.2
152 0.12
153 0.07
154 0.06
155 0.04
156 0.08
157 0.11
158 0.12
159 0.13
160 0.22
161 0.29
162 0.39
163 0.5
164 0.58
165 0.66
166 0.77
167 0.87
168 0.9
169 0.95
170 0.95
171 0.95
172 0.96
173 0.95
174 0.94
175 0.9
176 0.8
177 0.7
178 0.6
179 0.48
180 0.37
181 0.27
182 0.16
183 0.09
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.07
202 0.14
203 0.21
204 0.28
205 0.38
206 0.49
207 0.59
208 0.7
209 0.78
210 0.81
211 0.82
212 0.79
213 0.76
214 0.68
215 0.59
216 0.48
217 0.38
218 0.28
219 0.2
220 0.15
221 0.09
222 0.05
223 0.04
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.17
242 0.16
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.12
250 0.11
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.11
260 0.11
261 0.15
262 0.16
263 0.18
264 0.18
265 0.2
266 0.21
267 0.21
268 0.24
269 0.23
270 0.28
271 0.27
272 0.32
273 0.37
274 0.39
275 0.41
276 0.39
277 0.4
278 0.37
279 0.36
280 0.32
281 0.27
282 0.26
283 0.23
284 0.23
285 0.19
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.18
298 0.21
299 0.25
300 0.3
301 0.35
302 0.38
303 0.38
304 0.38
305 0.33
306 0.32
307 0.3
308 0.24
309 0.21
310 0.19
311 0.18
312 0.16
313 0.19
314 0.17
315 0.17
316 0.19
317 0.2
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.18
323 0.16
324 0.13
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.16
329 0.19
330 0.23
331 0.28
332 0.33
333 0.43
334 0.51
335 0.59
336 0.63
337 0.68
338 0.73
339 0.75
340 0.81
341 0.78
342 0.79
343 0.8
344 0.79
345 0.78
346 0.79
347 0.78
348 0.71
349 0.71
350 0.69
351 0.69
352 0.7
353 0.69
354 0.68
355 0.69
356 0.69
357 0.7
358 0.65
359 0.58
360 0.53
361 0.47
362 0.4
363 0.4
364 0.42
365 0.39
366 0.41
367 0.39
368 0.34
369 0.42
370 0.47