Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NY46

Protein Details
Accession J3NY46    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-215REPRARSRRRGGHRYSRSRSRSRTRSRSRSGRSDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
180-228RREPRARSRRRGGHRYSRSRSRSRTRSRSRSGRSDRSDDHRRQKDNRGK
396-399RPRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MRGVDSMNPKEIKTYFDEHAGGLQYKHIEWIDDSSANLVFASESSASEALIALSAIDVADPAQLPALELLPAKPCASKPGATLQVRIAVVGDRKIKGAAERSRFYLWHPEWERQNRDDGRNGGYRSRYRDRDRDSYDKRQRDDRHNSDRSGRYDGKQGDDEGIERFDASLYDDDQEALARREPRARSRRRGGHRYSRSRSRSRTRSRSRSGRSDRSDDHRRQKDNRGKELFPDLRSRNDRSGGSGLRGRSASPARSRDGDDTVSVASSRNRDKARAIKDRLSTAAKDNRAKELFPSKMGAVGGGKAQMDQIDKVEAVSRSLSADRVTRPGTTTGASTAAGGTSIKGLAKQQQSSQGGSGTTGFSIKGRATAKELFPEKLGNAGKELFADKLEGRGRPRRKAEDSFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.3
3 0.34
4 0.35
5 0.29
6 0.32
7 0.32
8 0.28
9 0.23
10 0.24
11 0.21
12 0.2
13 0.24
14 0.2
15 0.18
16 0.18
17 0.22
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.2
22 0.2
23 0.18
24 0.17
25 0.12
26 0.08
27 0.07
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.08
37 0.08
38 0.07
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.03
44 0.03
45 0.03
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.12
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.16
62 0.2
63 0.24
64 0.24
65 0.24
66 0.31
67 0.39
68 0.39
69 0.41
70 0.36
71 0.38
72 0.36
73 0.34
74 0.25
75 0.19
76 0.2
77 0.23
78 0.26
79 0.2
80 0.21
81 0.22
82 0.22
83 0.23
84 0.3
85 0.33
86 0.36
87 0.37
88 0.41
89 0.42
90 0.42
91 0.4
92 0.42
93 0.35
94 0.38
95 0.39
96 0.41
97 0.48
98 0.57
99 0.6
100 0.5
101 0.59
102 0.54
103 0.54
104 0.55
105 0.48
106 0.44
107 0.45
108 0.45
109 0.4
110 0.41
111 0.41
112 0.43
113 0.49
114 0.52
115 0.53
116 0.6
117 0.63
118 0.66
119 0.69
120 0.72
121 0.71
122 0.74
123 0.77
124 0.75
125 0.7
126 0.7
127 0.7
128 0.7
129 0.73
130 0.71
131 0.72
132 0.7
133 0.69
134 0.68
135 0.67
136 0.6
137 0.57
138 0.5
139 0.41
140 0.44
141 0.43
142 0.38
143 0.34
144 0.31
145 0.25
146 0.22
147 0.22
148 0.15
149 0.14
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.19
169 0.22
170 0.32
171 0.41
172 0.48
173 0.54
174 0.62
175 0.7
176 0.73
177 0.8
178 0.78
179 0.78
180 0.8
181 0.81
182 0.78
183 0.79
184 0.77
185 0.75
186 0.75
187 0.74
188 0.74
189 0.74
190 0.79
191 0.79
192 0.81
193 0.82
194 0.84
195 0.8
196 0.81
197 0.79
198 0.78
199 0.72
200 0.68
201 0.63
202 0.61
203 0.64
204 0.61
205 0.63
206 0.61
207 0.62
208 0.62
209 0.69
210 0.7
211 0.69
212 0.71
213 0.67
214 0.59
215 0.56
216 0.61
217 0.54
218 0.47
219 0.46
220 0.38
221 0.4
222 0.44
223 0.45
224 0.39
225 0.39
226 0.37
227 0.33
228 0.37
229 0.3
230 0.28
231 0.28
232 0.25
233 0.24
234 0.23
235 0.2
236 0.2
237 0.22
238 0.24
239 0.27
240 0.31
241 0.31
242 0.33
243 0.35
244 0.33
245 0.32
246 0.28
247 0.22
248 0.2
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.11
254 0.14
255 0.17
256 0.23
257 0.24
258 0.26
259 0.32
260 0.39
261 0.47
262 0.52
263 0.55
264 0.55
265 0.57
266 0.57
267 0.55
268 0.5
269 0.42
270 0.4
271 0.42
272 0.41
273 0.44
274 0.43
275 0.47
276 0.45
277 0.43
278 0.41
279 0.42
280 0.38
281 0.34
282 0.35
283 0.27
284 0.28
285 0.27
286 0.23
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.16
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.13
310 0.17
311 0.18
312 0.22
313 0.24
314 0.23
315 0.24
316 0.25
317 0.25
318 0.22
319 0.21
320 0.17
321 0.17
322 0.16
323 0.14
324 0.12
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.12
334 0.19
335 0.26
336 0.28
337 0.31
338 0.39
339 0.42
340 0.43
341 0.42
342 0.36
343 0.3
344 0.28
345 0.26
346 0.17
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.1
351 0.13
352 0.12
353 0.17
354 0.19
355 0.2
356 0.25
357 0.31
358 0.33
359 0.4
360 0.43
361 0.38
362 0.37
363 0.38
364 0.33
365 0.35
366 0.36
367 0.28
368 0.28
369 0.27
370 0.26
371 0.25
372 0.26
373 0.19
374 0.16
375 0.18
376 0.16
377 0.22
378 0.26
379 0.29
380 0.35
381 0.44
382 0.52
383 0.58
384 0.67
385 0.69
386 0.73