Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NYC1

Protein Details
Accession J3NYC1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-372VTEKAYPPPEVKKKEKKVKNKGTRHPGAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
353-369VKKKEKKVKNKGTRHPG
Subcellular Location(s) cyto 18.5, cyto_nucl 13.166, cyto_mito 10.499, cyto_pero 10.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006437  P:tyrosyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MASLTKEERLALINENLEEALNMEIIEEILAQGRDPKIYWGSATTGRPHVGYFVPALKLAQFLAAGCELTILLADIHGFLDNLKAPIEIVEYRAEYYKFVIQAMLRAVGVPTEKLRFVLGSSYQKSAPFIMDVYKLASLTSEHDARRAGAEVVKQSNNAPLSGLLYPLLQALDEEYLGADAQFGGTDQRKIFTLAKEVLPKIGYKPRAHMMNPMIPGLQGTKMSSSDPDSKIDLLDSAEAVTKKLRKAEAVPKVPEGNGILAFVEFVLLPASKLKLGHPEFRVERERDGLEPLVYDNIEKIRQDYREDVLSPQLLKPAVTKGLLELMAPIQAEFQASKEWQEVTEKAYPPPEVKKKEKKVKNKGTRHPGAGGTATLPERPKEAAAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.13
7 0.1
8 0.07
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.07
17 0.08
18 0.08
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.16
23 0.2
24 0.2
25 0.21
26 0.22
27 0.2
28 0.23
29 0.28
30 0.31
31 0.31
32 0.32
33 0.32
34 0.31
35 0.29
36 0.28
37 0.22
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.13
48 0.09
49 0.08
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.13
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.15
80 0.17
81 0.17
82 0.15
83 0.16
84 0.18
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.15
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.12
104 0.11
105 0.14
106 0.17
107 0.23
108 0.25
109 0.27
110 0.28
111 0.28
112 0.28
113 0.25
114 0.21
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.16
129 0.15
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.14
136 0.12
137 0.14
138 0.16
139 0.2
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.22
144 0.21
145 0.19
146 0.15
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.03
171 0.05
172 0.06
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.13
178 0.16
179 0.14
180 0.18
181 0.18
182 0.2
183 0.23
184 0.23
185 0.21
186 0.19
187 0.19
188 0.18
189 0.22
190 0.26
191 0.23
192 0.26
193 0.29
194 0.33
195 0.33
196 0.36
197 0.34
198 0.33
199 0.33
200 0.3
201 0.26
202 0.21
203 0.21
204 0.16
205 0.13
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.14
213 0.19
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.2
220 0.16
221 0.1
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.2
232 0.21
233 0.21
234 0.27
235 0.37
236 0.43
237 0.47
238 0.48
239 0.46
240 0.46
241 0.44
242 0.38
243 0.3
244 0.22
245 0.15
246 0.13
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.11
262 0.19
263 0.23
264 0.3
265 0.31
266 0.38
267 0.38
268 0.44
269 0.5
270 0.42
271 0.4
272 0.37
273 0.37
274 0.3
275 0.32
276 0.27
277 0.2
278 0.19
279 0.17
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.16
288 0.2
289 0.22
290 0.26
291 0.28
292 0.28
293 0.3
294 0.31
295 0.3
296 0.29
297 0.29
298 0.27
299 0.24
300 0.24
301 0.21
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.21
306 0.2
307 0.19
308 0.17
309 0.2
310 0.2
311 0.18
312 0.15
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.12
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.22
329 0.22
330 0.23
331 0.3
332 0.3
333 0.31
334 0.34
335 0.35
336 0.35
337 0.44
338 0.48
339 0.49
340 0.58
341 0.67
342 0.74
343 0.82
344 0.88
345 0.89
346 0.9
347 0.93
348 0.93
349 0.93
350 0.93
351 0.93
352 0.91
353 0.85
354 0.78
355 0.69
356 0.62
357 0.53
358 0.44
359 0.34
360 0.3
361 0.26
362 0.25
363 0.25
364 0.22
365 0.23
366 0.23