Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5SRJ5

Protein Details
Accession A0A2N5SRJ5    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-279ETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAHydrophilic
433-456GSSLAPAKKPPKKTKKQVELTPEAHydrophilic
460-480AEEKRKKQAEQRKLQKERKLABasic
774-794QQQQQYHHHHHQQQQQHQQSQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-282KKKSRKRPLNSGEKEAMRR
414-450KKAASKKKAVERSETGSPAGSSLAPAKKPPKKTKKQV
459-480LAEEKRKKQAEQRKLQKERKLA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MVNKKKWTAPSTVNFSQLSQPSIMFRQAGIYNVTRANRSLLKRYRKEPPSLTMHLYSAGFRLAHKDSTLHAYDGEMKHWMDCIHEQKMPNELLDVLDELGVRFYDGCLIVEVHDHRSAQHSDQTQSTADQSSQNPLLPNASSSSAHQRVSNIYHLQSNSHPASASVDLPNDQVSVHRLVLTPTCETLWRDILLMNESKVAQPNRTARVSADFKWGPITEEEAIELEAAILDRTAPALCLSPSIITSRIANQMLSETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAMRRQRERQERYMHIGDESYDQPFAPTFSRIDLIKRLRTTRPVPTVPTNEPQKKWNAHDLNQEQLKGFVPQMTVAPSDLQLPSYPIHDPKNEANQASKPNEGSANQPHRPSSSGQPPIPSCTLPASTATAPAATTKKAASKKKAVERSETGSPAGSSLAPAKKPPKKTKKQVELTPEAAALAEEKRKKQAEQRKLQKERKLALAAAAKAAEAAQKAAAAAGTNGSASANKETSAAAAAAAPPPTQSGIPVPHRDHPVVQPAEYPQQRDINISVPDSISVVTSHSIPVPNQFSSSNGNHNNNNNNNNNNNNNSIPVPILSGLSNNRSPTPNATIPVPQELIGTSSSIPVPAFNHSIPVPSNHNNISVHQSIPVAAEMMTMSGTDSIPVPSAASGDMHSIPVPNLIHPQTSDQLSTSIPVLQAEQPHLWNTFPAAFSAPPPHHHQPRPSDMDIDVQHHLASQPPLLPALTSIEVPNLPVHAHPLHQPHLSQDQQQQQQQQQQYHHHHHQQQQQHQQSQQQQHTQFHGWAPN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.52
4 0.45
5 0.39
6 0.31
7 0.29
8 0.27
9 0.3
10 0.3
11 0.23
12 0.21
13 0.23
14 0.23
15 0.24
16 0.25
17 0.24
18 0.25
19 0.3
20 0.32
21 0.28
22 0.28
23 0.31
24 0.35
25 0.38
26 0.44
27 0.49
28 0.58
29 0.64
30 0.69
31 0.74
32 0.74
33 0.77
34 0.73
35 0.71
36 0.69
37 0.67
38 0.66
39 0.58
40 0.51
41 0.45
42 0.39
43 0.32
44 0.24
45 0.22
46 0.17
47 0.15
48 0.2
49 0.2
50 0.21
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.28
55 0.3
56 0.25
57 0.22
58 0.22
59 0.29
60 0.28
61 0.27
62 0.24
63 0.22
64 0.21
65 0.23
66 0.21
67 0.18
68 0.24
69 0.28
70 0.3
71 0.34
72 0.36
73 0.36
74 0.42
75 0.39
76 0.32
77 0.27
78 0.23
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.21
101 0.2
102 0.2
103 0.25
104 0.28
105 0.25
106 0.3
107 0.3
108 0.3
109 0.32
110 0.33
111 0.29
112 0.27
113 0.26
114 0.22
115 0.19
116 0.21
117 0.2
118 0.24
119 0.25
120 0.26
121 0.25
122 0.24
123 0.25
124 0.21
125 0.21
126 0.17
127 0.18
128 0.17
129 0.18
130 0.27
131 0.29
132 0.3
133 0.3
134 0.29
135 0.31
136 0.34
137 0.38
138 0.32
139 0.29
140 0.32
141 0.32
142 0.33
143 0.3
144 0.33
145 0.28
146 0.25
147 0.24
148 0.19
149 0.23
150 0.22
151 0.23
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.18
157 0.14
158 0.12
159 0.1
160 0.12
161 0.14
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.16
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.2
175 0.18
176 0.17
177 0.17
178 0.18
179 0.19
180 0.19
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.21
186 0.21
187 0.2
188 0.25
189 0.31
190 0.35
191 0.36
192 0.36
193 0.31
194 0.37
195 0.4
196 0.35
197 0.37
198 0.32
199 0.31
200 0.34
201 0.33
202 0.26
203 0.22
204 0.24
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.1
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.14
234 0.19
235 0.19
236 0.18
237 0.16
238 0.17
239 0.16
240 0.17
241 0.15
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.17
248 0.22
249 0.29
250 0.37
251 0.45
252 0.55
253 0.66
254 0.76
255 0.81
256 0.81
257 0.85
258 0.86
259 0.88
260 0.82
261 0.78
262 0.72
263 0.65
264 0.62
265 0.58
266 0.56
267 0.51
268 0.51
269 0.51
270 0.55
271 0.61
272 0.64
273 0.66
274 0.66
275 0.64
276 0.67
277 0.63
278 0.54
279 0.44
280 0.37
281 0.3
282 0.24
283 0.21
284 0.14
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.12
295 0.13
296 0.15
297 0.21
298 0.25
299 0.29
300 0.32
301 0.35
302 0.36
303 0.42
304 0.44
305 0.45
306 0.47
307 0.44
308 0.45
309 0.47
310 0.5
311 0.47
312 0.49
313 0.5
314 0.48
315 0.47
316 0.46
317 0.47
318 0.46
319 0.45
320 0.49
321 0.45
322 0.43
323 0.51
324 0.5
325 0.5
326 0.47
327 0.44
328 0.34
329 0.29
330 0.26
331 0.18
332 0.16
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.11
350 0.12
351 0.15
352 0.15
353 0.18
354 0.2
355 0.29
356 0.29
357 0.29
358 0.29
359 0.29
360 0.34
361 0.33
362 0.31
363 0.22
364 0.21
365 0.22
366 0.2
367 0.21
368 0.24
369 0.3
370 0.31
371 0.32
372 0.32
373 0.31
374 0.32
375 0.3
376 0.27
377 0.28
378 0.32
379 0.31
380 0.34
381 0.34
382 0.36
383 0.35
384 0.29
385 0.21
386 0.16
387 0.17
388 0.13
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.09
396 0.11
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.16
402 0.23
403 0.29
404 0.33
405 0.4
406 0.47
407 0.55
408 0.63
409 0.59
410 0.57
411 0.55
412 0.54
413 0.49
414 0.42
415 0.34
416 0.26
417 0.23
418 0.17
419 0.15
420 0.1
421 0.07
422 0.1
423 0.13
424 0.13
425 0.16
426 0.24
427 0.3
428 0.39
429 0.5
430 0.56
431 0.64
432 0.74
433 0.81
434 0.84
435 0.86
436 0.83
437 0.8
438 0.75
439 0.67
440 0.57
441 0.46
442 0.35
443 0.27
444 0.2
445 0.13
446 0.09
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.2
451 0.22
452 0.24
453 0.33
454 0.41
455 0.47
456 0.55
457 0.65
458 0.7
459 0.79
460 0.85
461 0.82
462 0.79
463 0.71
464 0.67
465 0.59
466 0.48
467 0.43
468 0.4
469 0.34
470 0.27
471 0.24
472 0.18
473 0.15
474 0.15
475 0.11
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.06
492 0.09
493 0.08
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.09
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.1
512 0.15
513 0.21
514 0.27
515 0.29
516 0.34
517 0.38
518 0.38
519 0.37
520 0.34
521 0.38
522 0.33
523 0.31
524 0.27
525 0.26
526 0.33
527 0.32
528 0.32
529 0.26
530 0.29
531 0.29
532 0.29
533 0.28
534 0.25
535 0.25
536 0.23
537 0.21
538 0.17
539 0.16
540 0.14
541 0.13
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.09
549 0.1
550 0.1
551 0.15
552 0.18
553 0.18
554 0.19
555 0.19
556 0.2
557 0.24
558 0.26
559 0.29
560 0.32
561 0.35
562 0.38
563 0.43
564 0.49
565 0.5
566 0.55
567 0.51
568 0.5
569 0.5
570 0.51
571 0.51
572 0.45
573 0.42
574 0.35
575 0.33
576 0.28
577 0.25
578 0.2
579 0.16
580 0.14
581 0.11
582 0.11
583 0.09
584 0.12
585 0.13
586 0.17
587 0.19
588 0.19
589 0.21
590 0.23
591 0.24
592 0.26
593 0.31
594 0.3
595 0.29
596 0.29
597 0.3
598 0.3
599 0.32
600 0.28
601 0.21
602 0.18
603 0.17
604 0.16
605 0.13
606 0.12
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.1
611 0.1
612 0.09
613 0.1
614 0.13
615 0.16
616 0.15
617 0.18
618 0.17
619 0.19
620 0.19
621 0.21
622 0.24
623 0.25
624 0.29
625 0.27
626 0.31
627 0.3
628 0.31
629 0.34
630 0.29
631 0.26
632 0.23
633 0.22
634 0.18
635 0.18
636 0.17
637 0.11
638 0.09
639 0.09
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.06
648 0.07
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.1
659 0.11
660 0.11
661 0.12
662 0.12
663 0.12
664 0.16
665 0.15
666 0.14
667 0.19
668 0.2
669 0.21
670 0.21
671 0.25
672 0.24
673 0.26
674 0.25
675 0.2
676 0.2
677 0.19
678 0.19
679 0.16
680 0.14
681 0.12
682 0.12
683 0.14
684 0.15
685 0.17
686 0.2
687 0.22
688 0.21
689 0.23
690 0.24
691 0.22
692 0.2
693 0.2
694 0.19
695 0.17
696 0.17
697 0.17
698 0.16
699 0.19
700 0.26
701 0.26
702 0.26
703 0.34
704 0.42
705 0.49
706 0.55
707 0.61
708 0.61
709 0.69
710 0.73
711 0.66
712 0.6
713 0.51
714 0.53
715 0.47
716 0.42
717 0.34
718 0.26
719 0.24
720 0.22
721 0.22
722 0.18
723 0.18
724 0.16
725 0.17
726 0.17
727 0.18
728 0.18
729 0.17
730 0.14
731 0.17
732 0.16
733 0.15
734 0.14
735 0.16
736 0.16
737 0.17
738 0.17
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.17
743 0.16
744 0.18
745 0.22
746 0.28
747 0.32
748 0.34
749 0.34
750 0.34
751 0.41
752 0.42
753 0.43
754 0.45
755 0.49
756 0.54
757 0.59
758 0.62
759 0.6
760 0.66
761 0.66
762 0.64
763 0.62
764 0.64
765 0.68
766 0.7
767 0.72
768 0.73
769 0.75
770 0.77
771 0.79
772 0.79
773 0.8
774 0.81
775 0.81
776 0.79
777 0.75
778 0.75
779 0.76
780 0.76
781 0.74
782 0.72
783 0.69
784 0.67
785 0.69
786 0.64
787 0.58