Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NPJ4

Protein Details
Accession J3NPJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-101TDAVLKPQRGQKKKKAALHTPAPRQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-91RGQKKKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 14, cyto 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSLIQLSRLIDLPEPDLQQVLDYALTLSKQEAAEHFKNLLGDAPQAIEFISAFNGRRKDPTVVAPSQPQVTARPGETDAVLKPQRGQKKKKAALHTPAPRQVANTGIGPGTSYSKKDFEDDYISSRSGASTPAQRPGSAKPSPKASAVAPPPKPPPSASGSLVSDLLPVPKRKSKSNSSSRSSTPAPQPKNQNATTKVVITGGTPMHGASTAISDLDAAIRALEITTNPTLGGDGDNTARRCNCVAARHPLQTAAPNCLSCGKVVCLKEGLGPCTFCGASLLSPAEVQAMIKELKLERGKERMAEDRRANKRADVTTTARPFSKPLGTRNEDIGSRPGEDPAVAAAEAKAREHRDKLLAFQAQNAKRTTVRDEASDFDVSMVGSMWATPEDRARELKKQQKLLREMEWNARPEYEKRTQVLSIDLAGGKVVKKMVATERPPSPDDTPAVPDYAGAAASGVLGELDGNRVAGGGAFSRNPLLKDLIKPVYDAKGKGVELEGRKDKATRWRRVQDDLNDNESVILDGGIYGGSPQAPDASREEPNCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.22
4 0.2
5 0.18
6 0.17
7 0.14
8 0.1
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.13
16 0.13
17 0.15
18 0.19
19 0.26
20 0.29
21 0.31
22 0.31
23 0.29
24 0.29
25 0.27
26 0.26
27 0.18
28 0.17
29 0.15
30 0.16
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.11
35 0.09
36 0.08
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.19
41 0.23
42 0.24
43 0.29
44 0.33
45 0.35
46 0.36
47 0.42
48 0.44
49 0.45
50 0.47
51 0.47
52 0.46
53 0.43
54 0.4
55 0.33
56 0.28
57 0.28
58 0.28
59 0.24
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.24
64 0.23
65 0.2
66 0.25
67 0.26
68 0.24
69 0.28
70 0.34
71 0.44
72 0.51
73 0.6
74 0.61
75 0.7
76 0.78
77 0.82
78 0.84
79 0.83
80 0.82
81 0.83
82 0.82
83 0.8
84 0.78
85 0.72
86 0.63
87 0.55
88 0.47
89 0.4
90 0.32
91 0.25
92 0.19
93 0.16
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.18
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.25
105 0.24
106 0.29
107 0.28
108 0.3
109 0.29
110 0.29
111 0.26
112 0.24
113 0.21
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.2
118 0.22
119 0.29
120 0.3
121 0.3
122 0.32
123 0.36
124 0.41
125 0.38
126 0.42
127 0.37
128 0.43
129 0.45
130 0.44
131 0.4
132 0.34
133 0.36
134 0.39
135 0.45
136 0.4
137 0.43
138 0.46
139 0.47
140 0.47
141 0.4
142 0.36
143 0.33
144 0.35
145 0.32
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.28
150 0.23
151 0.18
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.18
156 0.21
157 0.27
158 0.3
159 0.36
160 0.43
161 0.49
162 0.56
163 0.64
164 0.68
165 0.68
166 0.7
167 0.64
168 0.63
169 0.55
170 0.5
171 0.49
172 0.49
173 0.48
174 0.5
175 0.56
176 0.58
177 0.63
178 0.61
179 0.59
180 0.53
181 0.53
182 0.49
183 0.41
184 0.35
185 0.28
186 0.24
187 0.17
188 0.16
189 0.11
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.05
221 0.06
222 0.08
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.15
229 0.17
230 0.18
231 0.2
232 0.24
233 0.31
234 0.35
235 0.36
236 0.35
237 0.33
238 0.31
239 0.3
240 0.27
241 0.23
242 0.2
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.19
247 0.13
248 0.14
249 0.11
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.14
254 0.14
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.14
262 0.14
263 0.1
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.14
282 0.17
283 0.2
284 0.21
285 0.25
286 0.26
287 0.27
288 0.3
289 0.32
290 0.34
291 0.38
292 0.41
293 0.46
294 0.51
295 0.53
296 0.51
297 0.44
298 0.45
299 0.4
300 0.38
301 0.34
302 0.32
303 0.36
304 0.38
305 0.38
306 0.33
307 0.31
308 0.29
309 0.26
310 0.29
311 0.24
312 0.27
313 0.35
314 0.38
315 0.39
316 0.41
317 0.4
318 0.33
319 0.31
320 0.29
321 0.21
322 0.2
323 0.19
324 0.16
325 0.14
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.12
337 0.16
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.27
342 0.27
343 0.3
344 0.33
345 0.34
346 0.31
347 0.34
348 0.4
349 0.37
350 0.41
351 0.39
352 0.34
353 0.32
354 0.34
355 0.34
356 0.31
357 0.29
358 0.27
359 0.28
360 0.28
361 0.3
362 0.28
363 0.23
364 0.16
365 0.15
366 0.13
367 0.11
368 0.09
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.1
377 0.13
378 0.15
379 0.21
380 0.24
381 0.32
382 0.41
383 0.49
384 0.53
385 0.59
386 0.62
387 0.66
388 0.69
389 0.66
390 0.62
391 0.61
392 0.57
393 0.56
394 0.57
395 0.5
396 0.44
397 0.41
398 0.37
399 0.33
400 0.38
401 0.37
402 0.36
403 0.36
404 0.38
405 0.38
406 0.36
407 0.36
408 0.29
409 0.22
410 0.19
411 0.18
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.09
419 0.09
420 0.13
421 0.21
422 0.29
423 0.32
424 0.36
425 0.41
426 0.45
427 0.46
428 0.47
429 0.42
430 0.37
431 0.36
432 0.33
433 0.32
434 0.29
435 0.28
436 0.23
437 0.21
438 0.17
439 0.15
440 0.12
441 0.07
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.14
464 0.16
465 0.16
466 0.18
467 0.21
468 0.23
469 0.27
470 0.34
471 0.37
472 0.35
473 0.36
474 0.36
475 0.4
476 0.4
477 0.37
478 0.33
479 0.34
480 0.33
481 0.33
482 0.33
483 0.32
484 0.32
485 0.4
486 0.42
487 0.38
488 0.4
489 0.4
490 0.42
491 0.46
492 0.53
493 0.54
494 0.58
495 0.66
496 0.69
497 0.75
498 0.79
499 0.78
500 0.77
501 0.73
502 0.67
503 0.58
504 0.52
505 0.45
506 0.36
507 0.27
508 0.17
509 0.11
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.05
514 0.05
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.11
521 0.12
522 0.15
523 0.19
524 0.23
525 0.29