FuNGI

A0A2N5SL96

Protein Details

Accession

A0A2N5SL96

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
190-214	SSNKCSGGKHNLKARHRKERCYELF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MEKNLDGYLLADKAATAKDKTQREAWTDKKISAAGVIGRHLSKDNTSRFITDENRREPHLIWDALSKHFESNSSQNQAKVYQKFLKVGFQSTLRDFLMQVDNSVANMQAVGLQIGKPTAGQPDVNETLLAEHIVSLLPSSYDHTKEIIFTKRPLSLKIIRDHLKAKSLDSEEVTVKIESAHQASGQASDSSNKCSGGKHNLKARHRKERCYELFPHIKEEDEAKKREKSKSVAKAATSSPSGEPDPESNLDDNNASVVSNPLAYYAVGRALHTQRASQGPILLDSGCSDHMFPDQSCFSSYKSIKSLVEIADGQTVPIIGLGYVHIKNSNGDVHAFKAVHVPSLSHPLISFGRLFLKNCALVRLSNDEFAIKDPTSNFTIFDGKVRGKVFNIQGTILKYQGQSQSSLSFKASQADTAELHRQAGHPSGEALKLMFGVDYNTMTFKSCRLSKSQRLPFLSKLPDAESTLNFIYMDLSGKITPQSTGGGHYYFKITDAFSSFKHVFILSRKSQAFEKFKSYCNEVQNVHSSKIKNVVTDGGGEFCSAVFERFFAEQGIVHHITAPYTPQQNSIAERGNRTTSEKARSLLKQANLPTSLWGEAVITAVFYENITPLKRLKWKSAYEVWFGTPFDYSRLHSFGCRAYVNIPKERRKGKFGDTSKKGILMGYRQGIRNWRILTPGNWVKYSHDVIFDNSCFPGISPNSSADTSEFIPFIDKDDPVVNAVPSTHFPFLPCPDGIGRLVPPTATEPQEEVSSPAGASWQSDSQVEVAQESLETSDAPADLPAPAASSDAQHKPSWLWVPADQPAPKNISSDIDTSNILDSKRRARYANTLLTAKPYFEPIFAMAVTQSESPSIPKSYKSAMASSEAADWSSAIKVELDAMVRLGVWTVVPIPSNRHLLGTIWVFRKKFDASGNLIKFKARLCAQGSAQQEGIDFTKTYAPTGRSAALKTALTVGVNAGMSIHQMDVRNAFLNGKLDEEIYLRCPSGLDAPPGHCLKLHKSIYGLKKAPRVWYSELSSFFASIDFVSSPADPCLFISKVPGWECLFHVYVDDMAIISHDVDRFKKLVSARFLMDDLGPTSSLLGMKITRHNKFLTLSQERYVAEILSEYNFLDCRSVPTPMIPSTRLTPATDKEIAAFSNLNVSYLSQLSQYLERPGIVHWRAFQHLLQYLSGTKNYSIRVGGGDGVFRIYTNADWANCPETRRSYSGYLVSWGDSIISWKAKKQATVSTSTTEAEYHALYDGVQEAVWLQSLLGSISGTSIYPINVFTDNLAALALSRNPLANQRTKHIDVKYHFIREAVGKNWVKINYISTVVMPADGLTKALANPKHSAFLKFLKMKIQELRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.18
3	0.17
4	0.24
5	0.32
6	0.38
7	0.43
8	0.47
9	0.51
10	0.54
11	0.61
12	0.6
13	0.63
14	0.6
15	0.57
16	0.54
17	0.49
18	0.42
19	0.35
20	0.31
21	0.24
22	0.24
23	0.25
24	0.24
25	0.24
26	0.25
27	0.25
28	0.24
29	0.27
30	0.33
31	0.36
32	0.39
33	0.41
34	0.4
35	0.4
36	0.44
37	0.46
38	0.48
39	0.51
40	0.54
41	0.55
42	0.57
43	0.57
44	0.52
45	0.52
46	0.5
47	0.42
48	0.35
49	0.38
50	0.38
51	0.39
52	0.4
53	0.33
54	0.27
55	0.27
56	0.27
57	0.26
58	0.32
59	0.37
60	0.41
61	0.42
62	0.42
63	0.43
64	0.48
65	0.51
66	0.46
67	0.45
68	0.46
69	0.48
70	0.52
71	0.51
72	0.53
73	0.47
74	0.48
75	0.44
76	0.4
77	0.41
78	0.38
79	0.4
80	0.33
81	0.31
82	0.27
83	0.27
84	0.31
85	0.26
86	0.24
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.22
91	0.17
92	0.1
93	0.09
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.1
103	0.08
104	0.09
105	0.13
106	0.15
107	0.16
108	0.16
109	0.24
110	0.26
111	0.26
112	0.25
113	0.2
114	0.19
115	0.19
116	0.18
117	0.09
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.1
127	0.14
128	0.16
129	0.18
130	0.19
131	0.19
132	0.22
133	0.27
134	0.32
135	0.32
136	0.33
137	0.36
138	0.41
139	0.42
140	0.42
141	0.44
142	0.44
143	0.47
144	0.51
145	0.56
146	0.54
147	0.57
148	0.58
149	0.54
150	0.54
151	0.48
152	0.43
153	0.42
154	0.4
155	0.39
156	0.36
157	0.36
158	0.3
159	0.3
160	0.3
161	0.22
162	0.19
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.16
167	0.15
168	0.13
169	0.15
170	0.16
171	0.17
172	0.17
173	0.15
174	0.14
175	0.18
176	0.19
177	0.22
178	0.24
179	0.24
180	0.23
181	0.25
182	0.3
183	0.36
184	0.44
185	0.46
186	0.53
187	0.61
188	0.7
189	0.78
190	0.81
191	0.81
192	0.79
193	0.81
194	0.81
195	0.83
196	0.8
197	0.76
198	0.72
199	0.7
200	0.72
201	0.64
202	0.62
203	0.51
204	0.45
205	0.4
206	0.4
207	0.4
208	0.38
209	0.42
210	0.41
211	0.48
212	0.53
213	0.59
214	0.6
215	0.58
216	0.61
217	0.67
218	0.71
219	0.69
220	0.64
221	0.61
222	0.56
223	0.53
224	0.44
225	0.36
226	0.27
227	0.25
228	0.25
229	0.21
230	0.22
231	0.19
232	0.22
233	0.21
234	0.23
235	0.2
236	0.2
237	0.2
238	0.18
239	0.16
240	0.13
241	0.11
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.09
252	0.08
253	0.12
254	0.12
255	0.13
256	0.18
257	0.2
258	0.25
259	0.25
260	0.26
261	0.25
262	0.29
263	0.3
264	0.25
265	0.26
266	0.21
267	0.22
268	0.22
269	0.18
270	0.14
271	0.12
272	0.13
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.09
277	0.11
278	0.14
279	0.13
280	0.17
281	0.17
282	0.17
283	0.19
284	0.2
285	0.19
286	0.26
287	0.27
288	0.27
289	0.29
290	0.32
291	0.3
292	0.32
293	0.34
294	0.26
295	0.28
296	0.23
297	0.21
298	0.22
299	0.21
300	0.18
301	0.14
302	0.13
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.04
307	0.04
308	0.05
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.11
313	0.12
314	0.13
315	0.15
316	0.17
317	0.13
318	0.15
319	0.16
320	0.16
321	0.21
322	0.2
323	0.18
324	0.21
325	0.2
326	0.21
327	0.2
328	0.19
329	0.17
330	0.25
331	0.25
332	0.19
333	0.19
334	0.2
335	0.2
336	0.2
337	0.19
338	0.12
339	0.19
340	0.21
341	0.22
342	0.21
343	0.24
344	0.26
345	0.26
346	0.28
347	0.22
348	0.21
349	0.23
350	0.27
351	0.24
352	0.22
353	0.22
354	0.2
355	0.19
356	0.2
357	0.21
358	0.14
359	0.15
360	0.14
361	0.17
362	0.19
363	0.19
364	0.18
365	0.16
366	0.2
367	0.19
368	0.21
369	0.22
370	0.2
371	0.25
372	0.25
373	0.24
374	0.22
375	0.28
376	0.29
377	0.29
378	0.3
379	0.26
380	0.27
381	0.29
382	0.29
383	0.23
384	0.21
385	0.17
386	0.2
387	0.24
388	0.22
389	0.2
390	0.21
391	0.25
392	0.24
393	0.25
394	0.22
395	0.2
396	0.19
397	0.22
398	0.2
399	0.17
400	0.18
401	0.18
402	0.18
403	0.18
404	0.22
405	0.18
406	0.19
407	0.18
408	0.17
409	0.17
410	0.2
411	0.17
412	0.13
413	0.14
414	0.15
415	0.15
416	0.14
417	0.13
418	0.09
419	0.08
420	0.08
421	0.07
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.08
429	0.1
430	0.1
431	0.1
432	0.15
433	0.18
434	0.19
435	0.27
436	0.35
437	0.43
438	0.54
439	0.6
440	0.62
441	0.64
442	0.66
443	0.61
444	0.59
445	0.54
446	0.45
447	0.38
448	0.33
449	0.29
450	0.28
451	0.26
452	0.2
453	0.19
454	0.18
455	0.17
456	0.14
457	0.13
458	0.11
459	0.09
460	0.1
461	0.07
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.1
470	0.09
471	0.11
472	0.13
473	0.13
474	0.13
475	0.13
476	0.14
477	0.12
478	0.13
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.12
483	0.13
484	0.12
485	0.19
486	0.18
487	0.18
488	0.18
489	0.17
490	0.17
491	0.2
492	0.27
493	0.23
494	0.29
495	0.29
496	0.3
497	0.34
498	0.4
499	0.42
500	0.37
501	0.43
502	0.38
503	0.43
504	0.44
505	0.45
506	0.43
507	0.4
508	0.42
509	0.35
510	0.36
511	0.39
512	0.39
513	0.35
514	0.33
515	0.3
516	0.27
517	0.33
518	0.31
519	0.23
520	0.22
521	0.22
522	0.18
523	0.2
524	0.18
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.09
529	0.07
530	0.08
531	0.06
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.07
536	0.07
537	0.08
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.09
542	0.15
543	0.14
544	0.13
545	0.14
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.14
550	0.11
551	0.14
552	0.14
553	0.15
554	0.17
555	0.19
556	0.21
557	0.22
558	0.25
559	0.23
560	0.25
561	0.25
562	0.24
563	0.24
564	0.25
565	0.27
566	0.26
567	0.3
568	0.3
569	0.3
570	0.33
571	0.33
572	0.35
573	0.35
574	0.32
575	0.31
576	0.31
577	0.33
578	0.3
579	0.28
580	0.24
581	0.2
582	0.18
583	0.13
584	0.12
585	0.08
586	0.07
587	0.07
588	0.05
589	0.04
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.06
597	0.07
598	0.08
599	0.1
600	0.14
601	0.22
602	0.24
603	0.31
604	0.37
605	0.39
606	0.43
607	0.5
608	0.49
609	0.44
610	0.43
611	0.37
612	0.3
613	0.28
614	0.23
615	0.15
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.12
620	0.12
621	0.14
622	0.14
623	0.14
624	0.15
625	0.14
626	0.16
627	0.15
628	0.13
629	0.15
630	0.21
631	0.24
632	0.3
633	0.35
634	0.39
635	0.45
636	0.52
637	0.52
638	0.5
639	0.51
640	0.5
641	0.54
642	0.55
643	0.59
644	0.55
645	0.56
646	0.52
647	0.48
648	0.41
649	0.32
650	0.26
651	0.19
652	0.18
653	0.17
654	0.19
655	0.18
656	0.2
657	0.24
658	0.25
659	0.27
660	0.25
661	0.22
662	0.23
663	0.23
664	0.23
665	0.26
666	0.29
667	0.26
668	0.25
669	0.25
670	0.24
671	0.26
672	0.28
673	0.21
674	0.18
675	0.17
676	0.18
677	0.2
678	0.18
679	0.15
680	0.13
681	0.12
682	0.09
683	0.09
684	0.12
685	0.1
686	0.12
687	0.12
688	0.13
689	0.15
690	0.15
691	0.16
692	0.12
693	0.13
694	0.12
695	0.12
696	0.1
697	0.08
698	0.1
699	0.09
700	0.12
701	0.11
702	0.1
703	0.1
704	0.11
705	0.11
706	0.11
707	0.12
708	0.09
709	0.08
710	0.08
711	0.08
712	0.08
713	0.11
714	0.11
715	0.1
716	0.11
717	0.14
718	0.15
719	0.17
720	0.16
721	0.14
722	0.14
723	0.15
724	0.15
725	0.14
726	0.12
727	0.1
728	0.1
729	0.08
730	0.09
731	0.1
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.12
736	0.13
737	0.14
738	0.14
739	0.12
740	0.1
741	0.09
742	0.09
743	0.08
744	0.07
745	0.07
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.08
750	0.08
751	0.08
752	0.08
753	0.1
754	0.1
755	0.08
756	0.07
757	0.07
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.04
770	0.05
771	0.05
772	0.05
773	0.05
774	0.06
775	0.06
776	0.07
777	0.11
778	0.13
779	0.16
780	0.16
781	0.16
782	0.16
783	0.19
784	0.21
785	0.19
786	0.19
787	0.18
788	0.2
789	0.23
790	0.28
791	0.26
792	0.23
793	0.24
794	0.25
795	0.23
796	0.22
797	0.19
798	0.17
799	0.17
800	0.18
801	0.17
802	0.15
803	0.15
804	0.15
805	0.15
806	0.15
807	0.13
808	0.13
809	0.14
810	0.21
811	0.26
812	0.29
813	0.29
814	0.31
815	0.39
816	0.45
817	0.49
818	0.44
819	0.41
820	0.38
821	0.41
822	0.38
823	0.3
824	0.22
825	0.19
826	0.17
827	0.15
828	0.16
829	0.12
830	0.13
831	0.12
832	0.11
833	0.08
834	0.08
835	0.08
836	0.08
837	0.07
838	0.06
839	0.07
840	0.08
841	0.1
842	0.12
843	0.12
844	0.13
845	0.15
846	0.17
847	0.22
848	0.23
849	0.23
850	0.22
851	0.24
852	0.24
853	0.22
854	0.21
855	0.16
856	0.14
857	0.12
858	0.1
859	0.08
860	0.07
861	0.06
862	0.05
863	0.05
864	0.05
865	0.06
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.06
871	0.06
872	0.06
873	0.05
874	0.04
875	0.03
876	0.04
877	0.04
878	0.05
879	0.06
880	0.07
881	0.11
882	0.15
883	0.19
884	0.19
885	0.19
886	0.18
887	0.18
888	0.22
889	0.21
890	0.23
891	0.24
892	0.27
893	0.27
894	0.27
895	0.3
896	0.27
897	0.27
898	0.25
899	0.27
900	0.29
901	0.39
902	0.42
903	0.41
904	0.4
905	0.37
906	0.35
907	0.3
908	0.3
909	0.22
910	0.24
911	0.24
912	0.29
913	0.3
914	0.35
915	0.36
916	0.32
917	0.3
918	0.25
919	0.22
920	0.18
921	0.18
922	0.12
923	0.11
924	0.1
925	0.14
926	0.14
927	0.15
928	0.18
929	0.18
930	0.19
931	0.21
932	0.23
933	0.2
934	0.21
935	0.22
936	0.21
937	0.19
938	0.17
939	0.17
940	0.15
941	0.13
942	0.12
943	0.1
944	0.09
945	0.09
946	0.08
947	0.06
948	0.06
949	0.06
950	0.06
951	0.07
952	0.07
953	0.08
954	0.1
955	0.11
956	0.12
957	0.13
958	0.13
959	0.13
960	0.13
961	0.15
962	0.14
963	0.15
964	0.13
965	0.12
966	0.13
967	0.14
968	0.13
969	0.13
970	0.14
971	0.13
972	0.12
973	0.12
974	0.12
975	0.17
976	0.19
977	0.2
978	0.21
979	0.23
980	0.28
981	0.29
982	0.28
983	0.24
984	0.24
985	0.25
986	0.33
987	0.33
988	0.28
989	0.31
990	0.39
991	0.45
992	0.51
993	0.51
994	0.45
995	0.51
996	0.52
997	0.56
998	0.51
999	0.49
1000	0.45
1001	0.46
1002	0.46
1003	0.44
1004	0.44
1005	0.39
1006	0.37
1007	0.31
1008	0.26
1009	0.2
1010	0.15
1011	0.1
1012	0.1
1013	0.07
1014	0.07
1015	0.08
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.1
1019	0.11
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.14
1023	0.13
1024	0.13
1025	0.17
1026	0.18
1027	0.24
1028	0.25
1029	0.29
1030	0.25
1031	0.26
1032	0.27
1033	0.27
1034	0.25
1035	0.19
1036	0.18
1037	0.15
1038	0.14
1039	0.12
1040	0.11
1041	0.06
1042	0.05
1043	0.06
1044	0.05
1045	0.05
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.11
1049	0.12
1050	0.15
1051	0.16
1052	0.16
1053	0.2
1054	0.22
1055	0.27
1056	0.31
1057	0.33
1058	0.32
1059	0.33
1060	0.33
1061	0.29
1062	0.26
1063	0.2
1064	0.16
1065	0.13
1066	0.12
1067	0.1
1068	0.1
1069	0.1
1070	0.1
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.1
1074	0.13
1075	0.22
1076	0.3
1077	0.31
1078	0.34
1079	0.35
1080	0.37
1081	0.38
1082	0.4
1083	0.41
1084	0.41
1085	0.41
1086	0.39
1087	0.42
1088	0.39
1089	0.38
1090	0.33
1091	0.23
1092	0.16
1093	0.13
1094	0.13
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.11
1102	0.1
1103	0.14
1104	0.16
1105	0.18
1106	0.18
1107	0.2
1108	0.24
1109	0.27
1110	0.31
1111	0.27
1112	0.27
1113	0.28
1114	0.33
1115	0.32
1116	0.31
1117	0.31
1118	0.3
1119	0.35
1120	0.35
1121	0.31
1122	0.28
1123	0.27
1124	0.25
1125	0.22
1126	0.2
1127	0.13
1128	0.18
1129	0.18
1130	0.17
1131	0.15
1132	0.16
1133	0.15
1134	0.15
1135	0.16
1136	0.09
1137	0.11
1138	0.12
1139	0.15
1140	0.16
1141	0.18
1142	0.18
1143	0.18
1144	0.18
1145	0.19
1146	0.26
1147	0.25
1148	0.26
1149	0.25
1150	0.28
1151	0.31
1152	0.33
1153	0.32
1154	0.28
1155	0.3
1156	0.3
1157	0.27
1158	0.25
1159	0.25
1160	0.25
1161	0.26
1162	0.22
1163	0.2
1164	0.22
1165	0.23
1166	0.23
1167	0.21
1168	0.19
1169	0.19
1170	0.19
1171	0.2
1172	0.17
1173	0.16
1174	0.14
1175	0.14
1176	0.13
1177	0.11
1178	0.11
1179	0.09
1180	0.09
1181	0.13
1182	0.16
1183	0.15
1184	0.17
1185	0.2
1186	0.24
1187	0.25
1188	0.27
1189	0.28
1190	0.3
1191	0.34
1192	0.36
1193	0.39
1194	0.38
1195	0.41
1196	0.43
1197	0.39
1198	0.36
1199	0.32
1200	0.29
1201	0.25
1202	0.21
1203	0.16
1204	0.12
1205	0.13
1206	0.14
1207	0.19
1208	0.19
1209	0.23
1210	0.31
1211	0.33
1212	0.37
1213	0.39
1214	0.44
1215	0.42
1216	0.48
1217	0.47
1218	0.43
1219	0.42
1220	0.38
1221	0.35
1222	0.26
1223	0.23
1224	0.18
1225	0.15
1226	0.12
1227	0.11
1228	0.1
1229	0.09
1230	0.1
1231	0.1
1232	0.09
1233	0.08
1234	0.07
1235	0.07
1236	0.07
1237	0.08
1238	0.07
1239	0.06
1240	0.06
1241	0.07
1242	0.07
1243	0.07
1244	0.07
1245	0.06
1246	0.07
1247	0.08
1248	0.06
1249	0.07
1250	0.08
1251	0.08
1252	0.09
1253	0.09
1254	0.11
1255	0.12
1256	0.13
1257	0.12
1258	0.14
1259	0.13
1260	0.12
1261	0.11
1262	0.09
1263	0.08
1264	0.1
1265	0.11
1266	0.1
1267	0.11
1268	0.12
1269	0.13
1270	0.21
1271	0.27
1272	0.33
1273	0.35
1274	0.41
1275	0.48
1276	0.52
1277	0.58
1278	0.56
1279	0.59
1280	0.54
1281	0.6
1282	0.61
1283	0.58
1284	0.54
1285	0.47
1286	0.45
1287	0.42
1288	0.44
1289	0.37
1290	0.39
1291	0.36
1292	0.38
1293	0.44
1294	0.42
1295	0.38
1296	0.34
1297	0.35
1298	0.29
1299	0.29
1300	0.28
1301	0.22
1302	0.24
1303	0.21
1304	0.19
1305	0.16
1306	0.12
1307	0.12
1308	0.11
1309	0.11
1310	0.09
1311	0.1
1312	0.11
1313	0.19
1314	0.22
1315	0.24
1316	0.29
1317	0.3
1318	0.38
1319	0.39
1320	0.4
1321	0.39
1322	0.42
1323	0.48
1324	0.49
1325	0.49
1326	0.5
1327	0.51
1328	0.55

A0A2N5SL96

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer