Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PDM8

Protein Details
Accession J3PDM8    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MGSSIRKKKEKKKDFQRAKLKVGKAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-29RKKKEKKKDFQRAKLKVGKAKEKP
Subcellular Location(s) mito 8, cyto 7, plas 6, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR024679  Ipi1_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097344  C:Rix1 complex  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12333  Ipi1_N  
Amino Acid Sequences MGSSIRKKKEKKKDFQRAKLKVGKAKEKPASFTDTSFKSKAIVVAQQSITVDGPSPAEQFKHNLSLASSSRSENQRRDALAFLTGQLAAKPPNNPVGTAGVLARLLPLISDTCSGVRTQLLKLFQTLPRADVAQQAEKVLMYVRAGMTHLSADVRNDSLGVMEWLLDTAGDEVVSCAGGWMKTLNVFAAMLGWSSIAAVAAAASAGAATSSVSKTTSTTTKGWTSAPKSTFGAAKGGQSYARQLLALAKFLEIGLRPEVVSTSAGPSAYWNGLYRLPRCSNPFGHLNLFGAPRDADSEMYADREDRQRVFSARWQVVVSKGLEEAKKEGGAVGRAAAILDLAVKDGMEGYDIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.95
3 0.95
4 0.92
5 0.91
6 0.89
7 0.86
8 0.81
9 0.8
10 0.8
11 0.76
12 0.78
13 0.76
14 0.71
15 0.68
16 0.64
17 0.63
18 0.54
19 0.5
20 0.46
21 0.42
22 0.44
23 0.41
24 0.37
25 0.3
26 0.3
27 0.3
28 0.28
29 0.28
30 0.26
31 0.31
32 0.31
33 0.32
34 0.3
35 0.28
36 0.24
37 0.19
38 0.16
39 0.1
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.18
47 0.21
48 0.24
49 0.23
50 0.22
51 0.22
52 0.27
53 0.27
54 0.28
55 0.26
56 0.23
57 0.28
58 0.35
59 0.41
60 0.4
61 0.44
62 0.45
63 0.45
64 0.46
65 0.42
66 0.35
67 0.31
68 0.26
69 0.21
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.22
85 0.21
86 0.19
87 0.12
88 0.12
89 0.11
90 0.09
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.18
108 0.18
109 0.2
110 0.23
111 0.23
112 0.27
113 0.26
114 0.23
115 0.21
116 0.22
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.2
121 0.2
122 0.19
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.12
127 0.1
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.02
192 0.02
193 0.02
194 0.02
195 0.02
196 0.03
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.1
203 0.13
204 0.16
205 0.17
206 0.2
207 0.22
208 0.23
209 0.25
210 0.28
211 0.3
212 0.33
213 0.33
214 0.32
215 0.3
216 0.31
217 0.3
218 0.25
219 0.25
220 0.19
221 0.2
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.16
226 0.18
227 0.15
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.17
232 0.17
233 0.18
234 0.16
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.1
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.13
259 0.18
260 0.23
261 0.23
262 0.29
263 0.32
264 0.35
265 0.4
266 0.44
267 0.42
268 0.42
269 0.45
270 0.41
271 0.41
272 0.37
273 0.33
274 0.3
275 0.29
276 0.24
277 0.21
278 0.17
279 0.14
280 0.16
281 0.15
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.16
290 0.21
291 0.25
292 0.24
293 0.27
294 0.31
295 0.33
296 0.37
297 0.4
298 0.44
299 0.42
300 0.42
301 0.4
302 0.37
303 0.37
304 0.37
305 0.31
306 0.22
307 0.23
308 0.26
309 0.26
310 0.26
311 0.26
312 0.25
313 0.24
314 0.23
315 0.23
316 0.21
317 0.22
318 0.2
319 0.18
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.08
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07