Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2N5TP43

Protein Details
Accession A0A2N5TP43    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
380-409INPPLEKSDKKPSKKKSRKRPAESVVEEKPBasic
426-448KSSHSRPSSINSSRKKKIKTSSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-400SDKKPSKKKSRKRP
439-442RKKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MARSKSAASSSNQKPNDFHHLVARFKIPLAPSFLSKPTRPELKVKLEEEMDDLKSTTSSGSEKKMDTHELVEEYGNSGPLEAVNQSLASLLMKYIPSLGAVLVSYLEPPTFILSDEHGNQIRRTATKSTRLPVLTLPGNAWGVVDVEVKLMGWRPTIGQKLIGRPTLSSPSHLSLVIYRTFNASINEHHLKAAGYHYDLNFEVPDHWKSIGETTHPQDTAVHLVPENKDRGCWVDANGVVVGGQEGTISFTVMGLTIANHMISVMGSLLDDPFSIERPARPSQPSQPRAMAKRKAIEREDSEGSSEEDSDSDGHRSKAHGSTRDPPTVLSAAAVPRPAIPSHPAPPPIFSHNIPPPLTVTNLKALNSAHVPPSNNMTFQINPPLEKSDKKPSKKKSRKRPAESVVEEKPSPSTFIPPLPSASHPIKSSHSRPSSINSSRKKKIKTSSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.53
3 0.59
4 0.51
5 0.44
6 0.44
7 0.46
8 0.47
9 0.48
10 0.46
11 0.37
12 0.35
13 0.37
14 0.3
15 0.28
16 0.32
17 0.3
18 0.3
19 0.33
20 0.38
21 0.4
22 0.4
23 0.42
24 0.42
25 0.49
26 0.49
27 0.53
28 0.56
29 0.6
30 0.67
31 0.63
32 0.6
33 0.53
34 0.5
35 0.46
36 0.41
37 0.32
38 0.25
39 0.24
40 0.19
41 0.17
42 0.17
43 0.13
44 0.11
45 0.13
46 0.16
47 0.22
48 0.25
49 0.26
50 0.3
51 0.34
52 0.36
53 0.34
54 0.33
55 0.31
56 0.28
57 0.28
58 0.25
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.06
96 0.08
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.14
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.23
106 0.22
107 0.25
108 0.26
109 0.24
110 0.27
111 0.3
112 0.32
113 0.4
114 0.44
115 0.43
116 0.47
117 0.46
118 0.43
119 0.37
120 0.37
121 0.3
122 0.26
123 0.23
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.15
143 0.18
144 0.19
145 0.22
146 0.24
147 0.3
148 0.33
149 0.35
150 0.3
151 0.27
152 0.3
153 0.31
154 0.29
155 0.25
156 0.24
157 0.23
158 0.24
159 0.23
160 0.2
161 0.15
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.2
173 0.22
174 0.21
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.12
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.16
200 0.17
201 0.2
202 0.2
203 0.2
204 0.18
205 0.17
206 0.18
207 0.15
208 0.14
209 0.11
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.18
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.04
230 0.04
231 0.02
232 0.02
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.15
265 0.18
266 0.22
267 0.24
268 0.27
269 0.36
270 0.46
271 0.48
272 0.47
273 0.5
274 0.52
275 0.56
276 0.61
277 0.58
278 0.52
279 0.56
280 0.57
281 0.58
282 0.55
283 0.54
284 0.49
285 0.48
286 0.46
287 0.39
288 0.35
289 0.29
290 0.27
291 0.21
292 0.17
293 0.12
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.15
303 0.18
304 0.24
305 0.29
306 0.32
307 0.35
308 0.44
309 0.49
310 0.52
311 0.48
312 0.41
313 0.39
314 0.33
315 0.29
316 0.2
317 0.16
318 0.14
319 0.15
320 0.15
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.14
326 0.16
327 0.2
328 0.24
329 0.28
330 0.32
331 0.31
332 0.33
333 0.34
334 0.35
335 0.35
336 0.31
337 0.34
338 0.35
339 0.41
340 0.39
341 0.36
342 0.33
343 0.31
344 0.33
345 0.28
346 0.24
347 0.24
348 0.26
349 0.26
350 0.25
351 0.24
352 0.25
353 0.25
354 0.25
355 0.23
356 0.24
357 0.26
358 0.25
359 0.32
360 0.3
361 0.28
362 0.27
363 0.27
364 0.25
365 0.25
366 0.34
367 0.28
368 0.27
369 0.29
370 0.33
371 0.33
372 0.35
373 0.39
374 0.41
375 0.49
376 0.58
377 0.66
378 0.71
379 0.79
380 0.86
381 0.91
382 0.91
383 0.92
384 0.94
385 0.94
386 0.93
387 0.91
388 0.9
389 0.86
390 0.83
391 0.77
392 0.71
393 0.62
394 0.52
395 0.46
396 0.36
397 0.33
398 0.27
399 0.26
400 0.24
401 0.29
402 0.33
403 0.31
404 0.33
405 0.33
406 0.34
407 0.35
408 0.37
409 0.37
410 0.34
411 0.36
412 0.39
413 0.44
414 0.48
415 0.52
416 0.53
417 0.51
418 0.52
419 0.56
420 0.6
421 0.61
422 0.65
423 0.65
424 0.68
425 0.75
426 0.81
427 0.81
428 0.8