FuNGI

A0A2N5W4B9

Protein Details

Accession

A0A2N5W4B9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-62	NNNNNNNNNNNNNKNKNKNKNNNTIKSSFT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 13.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MRFMFPVMDAFEVEDSLLNTLPIHPIFNNNNNNNNNNNNNNNNNNKNKNKNKNNNTIKSSFTIINSNQLILSAPPELRLLSLTSFKASSQQSYKLIVPVPASAIPRNPISKLIANPNSRLLAICSSDQVSVISLPRSEEHSDTCTQIQCSTIPIGLDHHLGTIAKLLWHPWSHRASTLLILYSSGFLLEYDVSRDAANPTQILDLNSPNSLQLTPSTRPTTSATSSQLYEGHPSIISSFQKVSLNSQRHSINPHGKNTHKKPGSKLSHSPGAFKSLLNSSHSGTYGSTDRASCTAVSICFGTGTADWGPLTLYVVMLNGDLYAICPYLPKNAVIPMSYRNSLLFFLTAKLESISNSGATGATLQDLQGPLNRSLDYLNSLSDLPDLPLDDEYPEESENPPEAIRTHRKDRFEAAVKPLRQGPFLMMPSPIETNDSEEETVSDLLHFRYSSIPSSSSPTATTVATQKQQTGNLLTEVSASSDSQNEGVGVFMIAYQSRIDVCLEVEKIEPRWASCSELEQRSQKERAATELPVLVTYECIDLGLRGGADGLSMVPDARYLDTIYVFHGLGMHAVSTQAWIEGLARGSFRKAGDTSSISEDEKAYLLRAIQERVGSQVAWIMQTVPCGGASRNSLMDSSTLQGPPGIAAVCVVDDAYLGYSLMALTDDGQLVGIPLKHRSLGLPPEDVDSQGGRTMVLGGAGLGSASASASQQLITAPGGILGRSVGACRGVLAENQWGVPGLLAQGAGGGSRRLSGPPEGCGSSASGVLRYANQVWSEIDQYIRQLVEAVNAGQGRLQLQISQFQDQIHQLARFPGHLHALDEHLDAQIARIQAVYHAHKSLLRRADTVLQKLADDRNRDLSREEVRWFAELNRMAAEVREGPPDGADNNTNNNTKKVGLEAQIAQLKRQLEATKARVRMAAERAAPAHDHAGPRGVGVASGSGKMGESQLVPIHHKLQQANGCLAIIHDQIAKINSSLTTM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.1
4	0.1
5	0.09
6	0.09
7	0.1
8	0.14
9	0.14
10	0.16
11	0.15
12	0.23
13	0.3
14	0.39
15	0.48
16	0.49
17	0.58
18	0.6
19	0.64
20	0.61
21	0.62
22	0.6
23	0.57
24	0.6
25	0.58
26	0.6
27	0.65
28	0.68
29	0.7
30	0.72
31	0.75
32	0.77
33	0.8
34	0.84
35	0.86
36	0.88
37	0.91
38	0.91
39	0.92
40	0.93
41	0.92
42	0.89
43	0.81
44	0.73
45	0.65
46	0.59
47	0.51
48	0.42
49	0.4
50	0.33
51	0.38
52	0.35
53	0.33
54	0.28
55	0.25
56	0.24
57	0.17
58	0.18
59	0.14
60	0.13
61	0.13
62	0.14
63	0.14
64	0.14
65	0.15
66	0.15
67	0.14
68	0.18
69	0.18
70	0.2
71	0.2
72	0.2
73	0.25
74	0.25
75	0.29
76	0.3
77	0.35
78	0.36
79	0.39
80	0.41
81	0.38
82	0.38
83	0.34
84	0.3
85	0.25
86	0.26
87	0.26
88	0.27
89	0.25
90	0.25
91	0.25
92	0.29
93	0.3
94	0.28
95	0.28
96	0.3
97	0.33
98	0.35
99	0.43
100	0.47
101	0.47
102	0.48
103	0.49
104	0.46
105	0.4
106	0.36
107	0.29
108	0.24
109	0.23
110	0.22
111	0.2
112	0.2
113	0.2
114	0.19
115	0.17
116	0.14
117	0.13
118	0.14
119	0.14
120	0.13
121	0.14
122	0.15
123	0.2
124	0.21
125	0.22
126	0.23
127	0.26
128	0.27
129	0.28
130	0.3
131	0.29
132	0.27
133	0.25
134	0.24
135	0.19
136	0.2
137	0.19
138	0.17
139	0.14
140	0.14
141	0.16
142	0.16
143	0.17
144	0.15
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.12
149	0.13
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.12
154	0.16
155	0.2
156	0.22
157	0.27
158	0.31
159	0.31
160	0.33
161	0.34
162	0.3
163	0.3
164	0.3
165	0.23
166	0.18
167	0.17
168	0.16
169	0.14
170	0.12
171	0.09
172	0.07
173	0.06
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.09
178	0.1
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.15
184	0.16
185	0.14
186	0.14
187	0.16
188	0.18
189	0.19
190	0.18
191	0.18
192	0.18
193	0.18
194	0.17
195	0.15
196	0.15
197	0.13
198	0.12
199	0.13
200	0.17
201	0.19
202	0.25
203	0.29
204	0.27
205	0.3
206	0.33
207	0.34
208	0.32
209	0.34
210	0.32
211	0.3
212	0.31
213	0.29
214	0.28
215	0.24
216	0.24
217	0.2
218	0.17
219	0.15
220	0.15
221	0.14
222	0.18
223	0.17
224	0.16
225	0.16
226	0.18
227	0.21
228	0.22
229	0.28
230	0.32
231	0.37
232	0.35
233	0.39
234	0.38
235	0.37
236	0.41
237	0.42
238	0.44
239	0.43
240	0.5
241	0.52
242	0.57
243	0.66
244	0.68
245	0.7
246	0.66
247	0.65
248	0.64
249	0.68
250	0.7
251	0.67
252	0.67
253	0.63
254	0.65
255	0.61
256	0.58
257	0.49
258	0.46
259	0.39
260	0.32
261	0.28
262	0.24
263	0.26
264	0.24
265	0.25
266	0.2
267	0.21
268	0.22
269	0.2
270	0.15
271	0.16
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.14
276	0.14
277	0.15
278	0.16
279	0.13
280	0.12
281	0.13
282	0.11
283	0.12
284	0.11
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.07
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.09
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.06
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.16
319	0.18
320	0.17
321	0.19
322	0.19
323	0.22
324	0.22
325	0.21
326	0.18
327	0.18
328	0.18
329	0.17
330	0.13
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.07
353	0.07
354	0.1
355	0.13
356	0.13
357	0.15
358	0.15
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.14
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.15
390	0.23
391	0.28
392	0.36
393	0.41
394	0.44
395	0.45
396	0.48
397	0.49
398	0.47
399	0.45
400	0.44
401	0.46
402	0.44
403	0.43
404	0.43
405	0.36
406	0.31
407	0.27
408	0.22
409	0.2
410	0.2
411	0.2
412	0.16
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.14
417	0.1
418	0.09
419	0.12
420	0.12
421	0.13
422	0.12
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.11
427	0.07
428	0.07
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.09
435	0.1
436	0.12
437	0.12
438	0.14
439	0.14
440	0.18
441	0.18
442	0.17
443	0.16
444	0.15
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.13
449	0.15
450	0.18
451	0.18
452	0.19
453	0.19
454	0.2
455	0.2
456	0.19
457	0.17
458	0.15
459	0.14
460	0.12
461	0.1
462	0.09
463	0.08
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.04
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.1
494	0.13
495	0.13
496	0.11
497	0.14
498	0.14
499	0.16
500	0.15
501	0.19
502	0.21
503	0.24
504	0.26
505	0.27
506	0.3
507	0.31
508	0.33
509	0.3
510	0.28
511	0.26
512	0.27
513	0.26
514	0.23
515	0.19
516	0.19
517	0.17
518	0.14
519	0.14
520	0.1
521	0.07
522	0.07
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.04
531	0.03
532	0.04
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.04
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.06
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.09
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.13
578	0.16
579	0.18
580	0.19
581	0.2
582	0.21
583	0.19
584	0.19
585	0.18
586	0.15
587	0.13
588	0.11
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.11
593	0.12
594	0.13
595	0.14
596	0.14
597	0.14
598	0.16
599	0.16
600	0.12
601	0.1
602	0.11
603	0.1
604	0.09
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.11
616	0.12
617	0.13
618	0.13
619	0.13
620	0.12
621	0.13
622	0.11
623	0.11
624	0.12
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.11
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.04
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.03
650	0.04
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.09
661	0.1
662	0.11
663	0.11
664	0.12
665	0.16
666	0.21
667	0.23
668	0.23
669	0.23
670	0.25
671	0.25
672	0.24
673	0.2
674	0.15
675	0.13
676	0.12
677	0.11
678	0.08
679	0.08
680	0.09
681	0.07
682	0.07
683	0.06
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.03
689	0.02
690	0.02
691	0.02
692	0.03
693	0.03
694	0.04
695	0.04
696	0.05
697	0.05
698	0.05
699	0.07
700	0.06
701	0.07
702	0.06
703	0.08
704	0.08
705	0.07
706	0.07
707	0.06
708	0.07
709	0.06
710	0.07
711	0.06
712	0.07
713	0.07
714	0.07
715	0.09
716	0.09
717	0.1
718	0.11
719	0.14
720	0.14
721	0.14
722	0.13
723	0.12
724	0.11
725	0.1
726	0.08
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.05
736	0.05
737	0.06
738	0.07
739	0.08
740	0.1
741	0.16
742	0.17
743	0.19
744	0.23
745	0.23
746	0.22
747	0.22
748	0.21
749	0.16
750	0.17
751	0.14
752	0.11
753	0.11
754	0.11
755	0.12
756	0.13
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.15
761	0.16
762	0.17
763	0.18
764	0.16
765	0.16
766	0.14
767	0.15
768	0.16
769	0.14
770	0.12
771	0.12
772	0.11
773	0.12
774	0.12
775	0.12
776	0.13
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.13
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.11
785	0.13
786	0.2
787	0.22
788	0.24
789	0.24
790	0.23
791	0.25
792	0.24
793	0.26
794	0.23
795	0.21
796	0.19
797	0.22
798	0.23
799	0.21
800	0.22
801	0.21
802	0.21
803	0.21
804	0.22
805	0.19
806	0.2
807	0.21
808	0.2
809	0.18
810	0.13
811	0.13
812	0.11
813	0.11
814	0.12
815	0.1
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.12
820	0.18
821	0.22
822	0.22
823	0.23
824	0.24
825	0.27
826	0.3
827	0.36
828	0.38
829	0.35
830	0.34
831	0.36
832	0.43
833	0.46
834	0.47
835	0.44
836	0.36
837	0.34
838	0.36
839	0.41
840	0.38
841	0.37
842	0.35
843	0.41
844	0.42
845	0.43
846	0.42
847	0.4
848	0.41
849	0.41
850	0.4
851	0.33
852	0.33
853	0.33
854	0.32
855	0.28
856	0.29
857	0.27
858	0.26
859	0.24
860	0.23
861	0.22
862	0.21
863	0.22
864	0.18
865	0.17
866	0.19
867	0.19
868	0.18
869	0.19
870	0.2
871	0.18
872	0.17
873	0.19
874	0.18
875	0.24
876	0.3
877	0.35
878	0.35
879	0.36
880	0.35
881	0.32
882	0.31
883	0.29
884	0.29
885	0.27
886	0.31
887	0.31
888	0.36
889	0.4
890	0.39
891	0.35
892	0.33
893	0.3
894	0.26
895	0.3
896	0.25
897	0.26
898	0.34
899	0.42
900	0.46
901	0.48
902	0.49
903	0.46
904	0.47
905	0.47
906	0.44
907	0.43
908	0.37
909	0.37
910	0.37
911	0.36
912	0.34
913	0.29
914	0.28
915	0.24
916	0.24
917	0.22
918	0.25
919	0.23
920	0.22
921	0.23
922	0.19
923	0.15
924	0.13
925	0.16
926	0.13
927	0.14
928	0.14
929	0.11
930	0.12
931	0.12
932	0.13
933	0.11
934	0.1
935	0.13
936	0.16
937	0.2
938	0.23
939	0.26
940	0.3
941	0.32
942	0.37
943	0.36
944	0.41
945	0.44
946	0.44
947	0.44
948	0.4
949	0.36
950	0.3
951	0.29
952	0.24
953	0.18
954	0.16
955	0.15
956	0.14
957	0.17
958	0.19
959	0.19
960	0.16
961	0.17

A0A2N5W4B9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer