Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TF94

Protein Details
Accession A0A2J6TF94    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-94EELPKLPKAKPRKPATKKVGVGEBasic
98-175AKAPRKKKDTVEGEPKKPRKPRVKVTDQAVGGNDTPKEPAPKKPRAKKVDKDANPDEGIKDKPARKPRSKKPEGESQIBasic
558-588ASNPKSKESTPKKSKREKRDKSPSRRTKSLAHydrophilic
669-694NQVCAASPKRPRGRPRKESTTSSPPKHydrophilic
713-737SDTPLSQTRTPKKSKKGKEAVVEDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-122KLPKAKPRKPATKKVGVGEEKVAKAPRKKKDTVEGEPKKPRKPRVKV
133-169PKEPAPKKPRAKKVDKDANPDEGIKDKPARKPRSKKP
296-298RKR
319-324KAPKKK
369-386PPKPRSKSLVKGAKPKKG
562-598KSKESTPKKSKREKRDKSPSRRTKSLAKASTKAAKSK
676-702PKRPRGRPRKESTTSSPPKGKVGRPKK
725-728KSKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MSSSPLPSFNELTQKKAPVLRTGSRATQVPQTASASFTSVASLLKATSAKDLLGVDAIGSFRMEEHNGDSVEELPKLPKAKPRKPATKKVGVGEEKVAKAPRKKKDTVEGEPKKPRKPRVKVTDQAVGGNDTPKEPAPKKPRAKKVDKDANPDEGIKDKPARKPRSKKPEGESQIILAKGQITKPSSKLTSDRVDKAVKSKKLESAITDPFADPVDLGLVEAVQRRTDWTPPTATGKTTGITPISGDRLDFGSTSCGSIQSGERSKTFTDLFGSFGFSKLDNNDIGKKSLETEKPRKRKLIELVKTSVSTAAATSLKEKAPKKKARTITGLATSAYAEQEEITAKPAPLLQYFSRQTTERPTNDGFKVPPKPRSKSLVKGAKPKKGSADAPILLSPESALKQSGNQDFVFGTSSQLAREDSPRLLRDLHEAMQASNEIDEDDPFADSIHASVFANRGKTLAPANRDLWSAAARDMAGDLLEVEMVDLVDSPVATKHTIPTIMPGATKPLVNEVAEDVWYDIEELGKNMDQDLQTTKEATRRIGPVEAAIRAELLSSPASNPKSKESTPKKSKREKRDKSPSRRTKSLAKASTKAAKSKGVGMPDFSSYTTAQLAKEIASYRFKPVKSRDGMIALLEKCWEGKNRIALGALGANVLSQPPPESSKPPASNQVCAASPKRPRGRPRKESTTSSPPKGKVGRPKKSTTVEYFEMDSDTPLSQTRTPKKSKKGKEAVVEDISDSDTETRPSPPRRQASQTKTPPLPLKLSTDLEIDTSPELSPLSSRALLFMHITRAIKNAPPSKDPSKPSWHEKILLYDPIILEELAVWLNTGALEKVGWDGEVDVKEVKKWCEGRSICCLWRENLRGGARSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.47
4 0.47
5 0.45
6 0.51
7 0.51
8 0.52
9 0.53
10 0.53
11 0.51
12 0.51
13 0.45
14 0.45
15 0.43
16 0.39
17 0.37
18 0.35
19 0.32
20 0.31
21 0.29
22 0.24
23 0.2
24 0.17
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.11
30 0.09
31 0.12
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.17
36 0.16
37 0.18
38 0.18
39 0.16
40 0.16
41 0.14
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.15
53 0.19
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.21
59 0.2
60 0.18
61 0.15
62 0.19
63 0.21
64 0.24
65 0.3
66 0.39
67 0.47
68 0.56
69 0.65
70 0.72
71 0.79
72 0.86
73 0.87
74 0.87
75 0.84
76 0.8
77 0.79
78 0.72
79 0.65
80 0.62
81 0.58
82 0.49
83 0.48
84 0.47
85 0.44
86 0.49
87 0.55
88 0.58
89 0.6
90 0.65
91 0.68
92 0.73
93 0.76
94 0.76
95 0.79
96 0.78
97 0.79
98 0.83
99 0.83
100 0.81
101 0.8
102 0.81
103 0.8
104 0.81
105 0.83
106 0.83
107 0.86
108 0.85
109 0.82
110 0.8
111 0.7
112 0.63
113 0.53
114 0.45
115 0.35
116 0.31
117 0.25
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.26
122 0.25
123 0.34
124 0.41
125 0.51
126 0.61
127 0.69
128 0.78
129 0.8
130 0.88
131 0.87
132 0.88
133 0.89
134 0.85
135 0.84
136 0.78
137 0.74
138 0.66
139 0.58
140 0.48
141 0.4
142 0.35
143 0.31
144 0.34
145 0.34
146 0.41
147 0.5
148 0.59
149 0.66
150 0.74
151 0.8
152 0.84
153 0.87
154 0.87
155 0.83
156 0.84
157 0.79
158 0.74
159 0.65
160 0.56
161 0.51
162 0.42
163 0.36
164 0.25
165 0.21
166 0.18
167 0.18
168 0.21
169 0.2
170 0.23
171 0.26
172 0.31
173 0.31
174 0.33
175 0.35
176 0.36
177 0.42
178 0.45
179 0.46
180 0.45
181 0.47
182 0.45
183 0.5
184 0.53
185 0.5
186 0.49
187 0.49
188 0.5
189 0.52
190 0.52
191 0.47
192 0.45
193 0.44
194 0.4
195 0.37
196 0.31
197 0.27
198 0.25
199 0.2
200 0.13
201 0.09
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.1
212 0.13
213 0.15
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.24
218 0.27
219 0.33
220 0.31
221 0.3
222 0.28
223 0.26
224 0.23
225 0.21
226 0.2
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.17
248 0.22
249 0.23
250 0.23
251 0.25
252 0.26
253 0.27
254 0.26
255 0.2
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.16
260 0.19
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.13
265 0.14
266 0.13
267 0.15
268 0.13
269 0.15
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.27
277 0.32
278 0.34
279 0.44
280 0.53
281 0.62
282 0.67
283 0.71
284 0.66
285 0.67
286 0.69
287 0.69
288 0.66
289 0.62
290 0.6
291 0.56
292 0.53
293 0.45
294 0.36
295 0.25
296 0.17
297 0.11
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.15
304 0.21
305 0.26
306 0.33
307 0.42
308 0.51
309 0.57
310 0.63
311 0.69
312 0.69
313 0.71
314 0.66
315 0.6
316 0.56
317 0.5
318 0.4
319 0.33
320 0.27
321 0.2
322 0.16
323 0.1
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.16
337 0.14
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.24
343 0.24
344 0.29
345 0.35
346 0.29
347 0.32
348 0.33
349 0.35
350 0.36
351 0.37
352 0.3
353 0.29
354 0.37
355 0.36
356 0.43
357 0.45
358 0.48
359 0.51
360 0.57
361 0.56
362 0.55
363 0.6
364 0.61
365 0.59
366 0.65
367 0.67
368 0.66
369 0.62
370 0.57
371 0.51
372 0.46
373 0.43
374 0.37
375 0.37
376 0.31
377 0.3
378 0.28
379 0.24
380 0.19
381 0.17
382 0.13
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.09
389 0.14
390 0.16
391 0.18
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.11
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.16
409 0.16
410 0.17
411 0.17
412 0.16
413 0.18
414 0.19
415 0.18
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.11
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.15
447 0.16
448 0.18
449 0.21
450 0.22
451 0.23
452 0.23
453 0.22
454 0.18
455 0.16
456 0.13
457 0.1
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.05
464 0.04
465 0.04
466 0.03
467 0.03
468 0.03
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.02
473 0.02
474 0.02
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.09
484 0.1
485 0.1
486 0.12
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.15
494 0.12
495 0.13
496 0.14
497 0.13
498 0.14
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.08
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.1
516 0.09
517 0.1
518 0.13
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.16
523 0.18
524 0.19
525 0.2
526 0.21
527 0.2
528 0.22
529 0.22
530 0.21
531 0.2
532 0.21
533 0.2
534 0.16
535 0.14
536 0.12
537 0.1
538 0.1
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.07
544 0.12
545 0.15
546 0.17
547 0.19
548 0.23
549 0.27
550 0.29
551 0.39
552 0.43
553 0.52
554 0.61
555 0.69
556 0.74
557 0.8
558 0.87
559 0.88
560 0.9
561 0.89
562 0.89
563 0.91
564 0.92
565 0.92
566 0.94
567 0.93
568 0.9
569 0.86
570 0.79
571 0.77
572 0.76
573 0.75
574 0.72
575 0.67
576 0.61
577 0.6
578 0.65
579 0.58
580 0.52
581 0.45
582 0.41
583 0.36
584 0.41
585 0.39
586 0.35
587 0.33
588 0.31
589 0.3
590 0.27
591 0.27
592 0.2
593 0.19
594 0.15
595 0.15
596 0.15
597 0.15
598 0.13
599 0.13
600 0.13
601 0.11
602 0.13
603 0.14
604 0.15
605 0.2
606 0.21
607 0.27
608 0.33
609 0.33
610 0.38
611 0.43
612 0.49
613 0.47
614 0.48
615 0.44
616 0.41
617 0.41
618 0.35
619 0.35
620 0.25
621 0.21
622 0.19
623 0.16
624 0.14
625 0.16
626 0.18
627 0.16
628 0.2
629 0.27
630 0.28
631 0.29
632 0.28
633 0.26
634 0.23
635 0.21
636 0.17
637 0.1
638 0.08
639 0.07
640 0.06
641 0.07
642 0.06
643 0.05
644 0.06
645 0.08
646 0.13
647 0.15
648 0.19
649 0.25
650 0.34
651 0.38
652 0.4
653 0.48
654 0.46
655 0.47
656 0.45
657 0.43
658 0.35
659 0.35
660 0.35
661 0.32
662 0.37
663 0.44
664 0.5
665 0.56
666 0.64
667 0.72
668 0.8
669 0.83
670 0.85
671 0.86
672 0.83
673 0.83
674 0.8
675 0.8
676 0.77
677 0.73
678 0.71
679 0.61
680 0.63
681 0.62
682 0.61
683 0.6
684 0.64
685 0.67
686 0.67
687 0.72
688 0.72
689 0.73
690 0.73
691 0.68
692 0.64
693 0.57
694 0.52
695 0.48
696 0.4
697 0.34
698 0.27
699 0.22
700 0.16
701 0.13
702 0.12
703 0.12
704 0.15
705 0.18
706 0.27
707 0.36
708 0.43
709 0.53
710 0.61
711 0.7
712 0.77
713 0.83
714 0.85
715 0.85
716 0.84
717 0.84
718 0.81
719 0.78
720 0.7
721 0.6
722 0.49
723 0.4
724 0.33
725 0.23
726 0.18
727 0.13
728 0.11
729 0.12
730 0.13
731 0.17
732 0.25
733 0.32
734 0.41
735 0.48
736 0.56
737 0.61
738 0.69
739 0.74
740 0.75
741 0.79
742 0.79
743 0.78
744 0.72
745 0.72
746 0.7
747 0.64
748 0.6
749 0.52
750 0.49
751 0.46
752 0.46
753 0.41
754 0.36
755 0.31
756 0.28
757 0.25
758 0.2
759 0.15
760 0.14
761 0.12
762 0.11
763 0.1
764 0.09
765 0.1
766 0.1
767 0.14
768 0.15
769 0.15
770 0.16
771 0.17
772 0.18
773 0.2
774 0.2
775 0.19
776 0.22
777 0.23
778 0.22
779 0.25
780 0.26
781 0.27
782 0.34
783 0.38
784 0.39
785 0.43
786 0.49
787 0.53
788 0.59
789 0.59
790 0.58
791 0.61
792 0.63
793 0.67
794 0.69
795 0.66
796 0.63
797 0.61
798 0.61
799 0.56
800 0.54
801 0.46
802 0.4
803 0.35
804 0.31
805 0.29
806 0.21
807 0.16
808 0.11
809 0.11
810 0.09
811 0.08
812 0.07
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.07
817 0.06
818 0.06
819 0.06
820 0.07
821 0.09
822 0.09
823 0.09
824 0.08
825 0.09
826 0.14
827 0.15
828 0.16
829 0.18
830 0.18
831 0.23
832 0.27
833 0.29
834 0.32
835 0.36
836 0.37
837 0.44
838 0.47
839 0.49
840 0.53
841 0.58
842 0.54
843 0.55
844 0.56
845 0.49
846 0.55
847 0.54
848 0.5
849 0.51
850 0.52
851 0.51