Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SSD6

Protein Details
Accession A0A2J6SSD6    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34IPTSADPRSKRPTKKRALSPKSQTAAHydrophilic
117-151RREREERDREKTRKNREKRERLKNKGKKGKGGKEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-24SKRPTKKR
114-166ERERREREERDREKTRKNREKRERLKNKGKKGKGGKEGGEVQQAKGGKFKARV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEQIPESIPTSADPRSKRPTKKRALSPKSQTAAQLDALFAKPDQEIRIPSTSSALSHTPGSAPPEIVQNVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRGMEEEVRNEEDGEKWERERREREERDREKTRKNREKRERLKNKGKKGKGGKEGGEVQQAKGGKFKARVDVGKRPEGLGGEGPEDGEGMAGVVSEEAGIVIHDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.35
3 0.44
4 0.53
5 0.62
6 0.69
7 0.75
8 0.79
9 0.86
10 0.89
11 0.9
12 0.89
13 0.89
14 0.87
15 0.86
16 0.79
17 0.7
18 0.62
19 0.54
20 0.48
21 0.4
22 0.31
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.17
27 0.14
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.2
35 0.23
36 0.22
37 0.22
38 0.22
39 0.2
40 0.18
41 0.19
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.14
48 0.17
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.07
72 0.07
73 0.12
74 0.19
75 0.26
76 0.31
77 0.35
78 0.41
79 0.5
80 0.57
81 0.62
82 0.62
83 0.57
84 0.53
85 0.5
86 0.46
87 0.41
88 0.35
89 0.27
90 0.21
91 0.19
92 0.17
93 0.17
94 0.15
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.19
101 0.22
102 0.28
103 0.33
104 0.38
105 0.45
106 0.52
107 0.6
108 0.66
109 0.7
110 0.73
111 0.77
112 0.75
113 0.75
114 0.76
115 0.78
116 0.77
117 0.8
118 0.83
119 0.84
120 0.9
121 0.9
122 0.92
123 0.92
124 0.91
125 0.93
126 0.91
127 0.91
128 0.9
129 0.85
130 0.83
131 0.82
132 0.81
133 0.79
134 0.76
135 0.67
136 0.62
137 0.62
138 0.55
139 0.53
140 0.44
141 0.36
142 0.33
143 0.32
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.23
148 0.28
149 0.3
150 0.34
151 0.39
152 0.45
153 0.48
154 0.56
155 0.56
156 0.57
157 0.55
158 0.48
159 0.44
160 0.38
161 0.34
162 0.28
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.11
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03