Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SYH5

Protein Details
Accession A0A2J6SYH5    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-45QIPHNHFRKDWQRRVRVHFDQPGRKLRRRNARLSKAAAHydrophilic
190-211RSEARNLGKREKRAKEKADEAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-46PGRKLRRRNARLSKAAAV
188-215DLRSEARNLGKREKRAKEKADEAAAAKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001380  Ribosomal_L13e  
IPR018256  Ribosomal_L13e_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01294  Ribosomal_L13e  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01104  RIBOSOMAL_L13E  
Amino Acid Sequences MAIKHNQQIPHNHFRKDWQRRVRVHFDQPGRKLRRRNARLSKAAAVAPRPVDKLRPVVRCPTIKYNRRVRAGRGFTLTELKEAGIPRKLAPTIGISVDPRRQNLSTESLAVNVARLKEYHTRLILFPRKLGQHKKGDASKEDVSAVKNVVTRVKLGLPIVRAEAGISEIKKSDMPEPIEGGAYRKLRDLRSEARNLGKREKRAKEKADEAAAAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.67
3 0.68
4 0.7
5 0.69
6 0.73
7 0.78
8 0.85
9 0.85
10 0.82
11 0.8
12 0.79
13 0.78
14 0.77
15 0.76
16 0.78
17 0.77
18 0.76
19 0.75
20 0.75
21 0.77
22 0.76
23 0.79
24 0.8
25 0.82
26 0.82
27 0.79
28 0.74
29 0.65
30 0.6
31 0.52
32 0.43
33 0.37
34 0.32
35 0.29
36 0.27
37 0.25
38 0.25
39 0.26
40 0.33
41 0.37
42 0.4
43 0.41
44 0.46
45 0.51
46 0.52
47 0.54
48 0.56
49 0.58
50 0.6
51 0.66
52 0.69
53 0.7
54 0.74
55 0.72
56 0.67
57 0.67
58 0.65
59 0.59
60 0.52
61 0.45
62 0.38
63 0.41
64 0.35
65 0.25
66 0.2
67 0.17
68 0.16
69 0.16
70 0.18
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.15
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.12
83 0.14
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.22
91 0.24
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.16
96 0.16
97 0.14
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.1
104 0.16
105 0.19
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.24
110 0.33
111 0.37
112 0.31
113 0.3
114 0.3
115 0.34
116 0.39
117 0.46
118 0.44
119 0.46
120 0.49
121 0.54
122 0.55
123 0.54
124 0.5
125 0.49
126 0.42
127 0.35
128 0.33
129 0.27
130 0.23
131 0.21
132 0.19
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.19
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.16
148 0.14
149 0.12
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.16
159 0.18
160 0.21
161 0.25
162 0.26
163 0.27
164 0.27
165 0.28
166 0.26
167 0.24
168 0.25
169 0.24
170 0.22
171 0.25
172 0.29
173 0.3
174 0.36
175 0.4
176 0.42
177 0.48
178 0.54
179 0.54
180 0.59
181 0.64
182 0.63
183 0.67
184 0.66
185 0.67
186 0.7
187 0.76
188 0.76
189 0.79
190 0.83
191 0.81
192 0.81
193 0.79
194 0.75
195 0.68