Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SWF1

Protein Details
Accession A0A2J6SWF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-105PSPPPTPKEKPLRTKRGHRKPDFLTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-100PKEKPLRTKRGHRK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Amino Acid Sequences MAPPSGAIPPELPPSVEAAYRKKCIQLKQRMNEVEEANDAARQRLARLNRSVQKLRLERAFLLEQLAKRTSTNVEDSEGSPSPPPTPKEKPLRTKRGHRKPDFLTSDIGDGRTGTAFIQQGPVTLSPSSDAFSHTHPDVLRNSTPQAQVQPSKRQLPSNGTHATPTISASTPSQPRRIKSGFDLYCNETRPLLASEHKKEIAEGTFNVENFLAAGWSGLDEPTKSSFLQRFDALKKQLEVEKEAGSTGPRQTVFDAAPGHADEDVEMGDDATDAGTPSVAGESGGFTAVNRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.25
5 0.29
6 0.35
7 0.39
8 0.4
9 0.44
10 0.48
11 0.54
12 0.6
13 0.63
14 0.67
15 0.71
16 0.8
17 0.76
18 0.73
19 0.69
20 0.6
21 0.51
22 0.41
23 0.35
24 0.25
25 0.23
26 0.2
27 0.16
28 0.17
29 0.15
30 0.16
31 0.21
32 0.27
33 0.32
34 0.38
35 0.47
36 0.52
37 0.6
38 0.63
39 0.61
40 0.64
41 0.62
42 0.6
43 0.56
44 0.52
45 0.45
46 0.45
47 0.42
48 0.32
49 0.31
50 0.3
51 0.26
52 0.26
53 0.27
54 0.22
55 0.2
56 0.22
57 0.21
58 0.21
59 0.23
60 0.2
61 0.21
62 0.22
63 0.23
64 0.26
65 0.23
66 0.21
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.22
71 0.24
72 0.27
73 0.33
74 0.41
75 0.5
76 0.58
77 0.66
78 0.71
79 0.8
80 0.8
81 0.84
82 0.87
83 0.87
84 0.89
85 0.84
86 0.81
87 0.75
88 0.78
89 0.72
90 0.62
91 0.53
92 0.43
93 0.4
94 0.32
95 0.28
96 0.17
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.1
118 0.09
119 0.11
120 0.13
121 0.12
122 0.15
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.19
127 0.19
128 0.17
129 0.19
130 0.2
131 0.21
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.24
136 0.27
137 0.34
138 0.35
139 0.4
140 0.41
141 0.4
142 0.4
143 0.41
144 0.4
145 0.38
146 0.36
147 0.3
148 0.29
149 0.26
150 0.24
151 0.18
152 0.16
153 0.11
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.16
158 0.21
159 0.24
160 0.32
161 0.33
162 0.34
163 0.41
164 0.42
165 0.39
166 0.37
167 0.45
168 0.38
169 0.39
170 0.41
171 0.37
172 0.39
173 0.39
174 0.34
175 0.24
176 0.22
177 0.2
178 0.19
179 0.17
180 0.2
181 0.25
182 0.28
183 0.33
184 0.34
185 0.32
186 0.31
187 0.31
188 0.27
189 0.22
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.19
194 0.2
195 0.17
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.06
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.08
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.17
213 0.21
214 0.24
215 0.27
216 0.29
217 0.32
218 0.35
219 0.42
220 0.41
221 0.4
222 0.38
223 0.39
224 0.39
225 0.36
226 0.35
227 0.31
228 0.28
229 0.25
230 0.24
231 0.21
232 0.19
233 0.2
234 0.18
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.21
239 0.24
240 0.23
241 0.24
242 0.24
243 0.19
244 0.2
245 0.2
246 0.19
247 0.15
248 0.15
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08