FuNGI

A0A2J6SHY2

Protein Details

Accession

A0A2J6SHY2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-49	NTRVPLQTSLPIRKRKRRPSPSPGPSLSE	Hydrophilic
338-365	AFAAEQRRKSRRMRRRAERRWTERDEIR	Basic
448-473	QRVGDHERGKKKHKEEQERAKKLFDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
33-40	RKRKRRPS
344-358	RRKSRRMRRRAERRW
454-469	ERGKKKHKEEQERAKK

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 7, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007224 TIF_Rrn11
Gene Ontology	GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding GO:0001181 F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity
Pfam	View protein in Pfam PF04090 RNA_pol_I_TF

Amino Acid Sequences

MPLFALPLAPSSTTSHFQPTNTRVPLQTSLPIRKRKRRPSPSPGPSLSEDDHDHDHDNELPASTNPLSLTPNEIAQYKVAGLRLDEEIPGVKGWPHRGLGPARAAEGKQDWKGKVKEKSHILQHGEGVDGEGGEVRKIGADNGEEGIKEKRAERGPRLRLQHLSVLMTILQRCLLEGDISRASRAWAMLIRAQVGGRGVDLRGSGYWGIGAELLIRSLERRGKYSYDEESEGEGEEGGGEQMWGSREGLEKARDYYERLILQHPYKRQFDGSVSALDFWPVLVGCEVYGIQFEQNEELRRITREAEEDEGGERSESQSEESEEDAKDAEDEEFGMDAAFAAEQRRKSRRMRRRAERRWTERDEIRKTALTASEKIAARLDDLMTTPPYSDSHNLLRLRGMIALYIGHLSVPAPPPDETNEDNEGEGLERSRRLRSADKNMERRFLFSQRVGDHERGKKKHKEEQERAKKLFDRIAREGGDIEDIKLPLEQDEDPVEFYDAER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.3
3	0.31
4	0.32
5	0.39
6	0.42
7	0.47
8	0.48
9	0.49
10	0.43
11	0.47
12	0.48
13	0.42
14	0.43
15	0.41
16	0.48
17	0.54
18	0.62
19	0.67
20	0.74
21	0.81
22	0.86
23	0.89
24	0.9
25	0.92
26	0.92
27	0.93
28	0.92
29	0.91
30	0.83
31	0.77
32	0.7
33	0.64
34	0.55
35	0.48
36	0.41
37	0.35
38	0.35
39	0.32
40	0.31
41	0.26
42	0.27
43	0.25
44	0.26
45	0.23
46	0.2
47	0.19
48	0.17
49	0.21
50	0.19
51	0.17
52	0.15
53	0.16
54	0.17
55	0.16
56	0.21
57	0.17
58	0.19
59	0.19
60	0.2
61	0.19
62	0.18
63	0.18
64	0.14
65	0.15
66	0.15
67	0.14
68	0.14
69	0.15
70	0.17
71	0.17
72	0.15
73	0.14
74	0.13
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.12
79	0.14
80	0.19
81	0.22
82	0.22
83	0.23
84	0.29
85	0.32
86	0.34
87	0.36
88	0.32
89	0.3
90	0.31
91	0.3
92	0.27
93	0.29
94	0.29
95	0.29
96	0.34
97	0.34
98	0.4
99	0.46
100	0.51
101	0.56
102	0.56
103	0.59
104	0.6
105	0.65
106	0.65
107	0.66
108	0.62
109	0.54
110	0.51
111	0.44
112	0.37
113	0.3
114	0.23
115	0.15
116	0.1
117	0.08
118	0.08
119	0.07
120	0.06
121	0.07
122	0.06
123	0.06
124	0.07
125	0.07
126	0.08
127	0.08
128	0.1
129	0.11
130	0.11
131	0.1
132	0.12
133	0.14
134	0.14
135	0.14
136	0.14
137	0.2
138	0.27
139	0.34
140	0.42
141	0.5
142	0.55
143	0.61
144	0.65
145	0.63
146	0.59
147	0.55
148	0.51
149	0.43
150	0.36
151	0.29
152	0.24
153	0.21
154	0.2
155	0.17
156	0.12
157	0.11
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.12
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.14
171	0.13
172	0.11
173	0.09
174	0.11
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.14
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.1
183	0.08
184	0.08
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.06
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.07
194	0.06
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.08
205	0.12
206	0.13
207	0.15
208	0.18
209	0.2
210	0.24
211	0.27
212	0.28
213	0.26
214	0.27
215	0.25
216	0.24
217	0.22
218	0.18
219	0.14
220	0.1
221	0.07
222	0.05
223	0.05
224	0.03
225	0.03
226	0.02
227	0.02
228	0.03
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.06
233	0.07
234	0.09
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.14
239	0.17
240	0.16
241	0.18
242	0.18
243	0.19
244	0.19
245	0.2
246	0.2
247	0.22
248	0.25
249	0.28
250	0.31
251	0.32
252	0.32
253	0.32
254	0.31
255	0.29
256	0.26
257	0.26
258	0.22
259	0.19
260	0.17
261	0.17
262	0.15
263	0.14
264	0.12
265	0.07
266	0.06
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.1
282	0.12
283	0.13
284	0.14
285	0.15
286	0.16
287	0.17
288	0.16
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.19
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.16
297	0.14
298	0.11
299	0.09
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.11
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.12
312	0.1
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.05
317	0.06
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.06
328	0.1
329	0.13
330	0.2
331	0.26
332	0.32
333	0.42
334	0.53
335	0.61
336	0.69
337	0.76
338	0.8
339	0.87
340	0.91
341	0.93
342	0.93
343	0.91
344	0.89
345	0.85
346	0.81
347	0.77
348	0.75
349	0.71
350	0.63
351	0.58
352	0.51
353	0.45
354	0.4
355	0.39
356	0.33
357	0.29
358	0.28
359	0.31
360	0.29
361	0.29
362	0.28
363	0.23
364	0.2
365	0.19
366	0.17
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.15
376	0.17
377	0.19
378	0.23
379	0.3
380	0.3
381	0.3
382	0.31
383	0.28
384	0.27
385	0.24
386	0.19
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.09
392	0.08
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.1
397	0.12
398	0.13
399	0.15
400	0.16
401	0.18
402	0.22
403	0.27
404	0.24
405	0.26
406	0.28
407	0.26
408	0.26
409	0.24
410	0.21
411	0.17
412	0.16
413	0.13
414	0.12
415	0.16
416	0.18
417	0.22
418	0.24
419	0.28
420	0.37
421	0.44
422	0.53
423	0.6
424	0.68
425	0.75
426	0.76
427	0.78
428	0.7
429	0.65
430	0.59
431	0.55
432	0.51
433	0.45
434	0.48
435	0.43
436	0.48
437	0.49
438	0.49
439	0.52
440	0.54
441	0.6
442	0.6
443	0.67
444	0.71
445	0.73
446	0.77
447	0.79
448	0.81
449	0.82
450	0.86
451	0.88
452	0.89
453	0.83
454	0.81
455	0.76
456	0.7
457	0.67
458	0.62
459	0.59
460	0.55
461	0.6
462	0.54
463	0.5
464	0.45
465	0.38
466	0.38
467	0.29
468	0.26
469	0.22
470	0.21
471	0.2
472	0.2
473	0.19
474	0.14
475	0.17
476	0.15
477	0.14
478	0.18
479	0.19
480	0.19
481	0.2
482	0.2

A0A2J6SHY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer