FuNGI

J3PCE7

Protein Details

Accession

J3PCE7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
97-116	GQARAPPPKKRKFADPSNYS	Hydrophilic
579-605	LKGGGSDRKAKQKQKQQQQRGTKAFEG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-107	PPKKR

Subcellular Location(s)

mito 18.5, cyto_mito 11.5, extr 4, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR041707 Pus3-like IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1
CDD	cd02569 PseudoU_synth_ScPus3

Amino Acid Sequences

MRPTFRVSHKWLWHKPLVALTPKLGLLAVRPPAWARHFITTIMAGEKANYDRWTKDSLIQRIKLLEQQLEKQSRQDTAAVVASSAASASLPTQERQGQARAPPPKKRKFADPSNYSTRFIALKLAYLGGNYNGFEYQANGKLPTIEEELWKALVKTCLVFPERGPDEVDFASCEYSKCGRTDRGVSAFGQVVALRVRSNRPVPRARKQQQQQHAAGSSAEAGDGAAVAAAAELEAPEATGEEGRRQEDDDDDDDDSDETPYPVADEIKYCKLLNRTLPPDIRALAWCPTPPPGFSARFSCRERQYRYFFTQPAFAPAPAVLEGAHHPSSSAGSGGRRVKDGYLGIEAMREAARHFEGSHDFRNFCKIDASKQIGNFERRVLEADIVEVPDTTSALPYLDRPEFLPGQDGNGDSLAVDPPRPRVYYFHVRGTAFLWHQIRHMVAVLFLVGQGLEKPSVVADLLDVSRYPGRPNYHLASDAPLVLWDCLFGRPPPGAEGGATSSEAVEPGPDLDWVYAGEDGDPVDLHGPKGLVDGLWEVWRGRKMDELLANRLLDHVTTLTDPVRAVAASAAAVDAAAALKGGGSDRKAKQKQKQQQQRGTKAFEGGDGSHLIGTYTPLAKRQMQATPEDVNDKWAQSKGFASAAELAGTENWRSVIKARKLAAAEAAAVGGP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.66
3	0.64
4	0.61
5	0.58
6	0.52
7	0.45
8	0.42
9	0.38
10	0.35
11	0.27
12	0.2
13	0.16
14	0.2
15	0.23
16	0.2
17	0.22
18	0.23
19	0.29
20	0.32
21	0.36
22	0.33
23	0.36
24	0.36
25	0.36
26	0.37
27	0.33
28	0.31
29	0.27
30	0.24
31	0.17
32	0.16
33	0.19
34	0.19
35	0.21
36	0.22
37	0.23
38	0.24
39	0.28
40	0.32
41	0.31
42	0.36
43	0.41
44	0.48
45	0.54
46	0.54
47	0.54
48	0.52
49	0.52
50	0.5
51	0.44
52	0.4
53	0.35
54	0.39
55	0.46
56	0.49
57	0.48
58	0.48
59	0.47
60	0.43
61	0.41
62	0.37
63	0.28
64	0.26
65	0.28
66	0.23
67	0.2
68	0.18
69	0.15
70	0.13
71	0.12
72	0.08
73	0.04
74	0.04
75	0.05
76	0.1
77	0.12
78	0.13
79	0.18
80	0.22
81	0.25
82	0.28
83	0.32
84	0.31
85	0.34
86	0.43
87	0.49
88	0.53
89	0.6
90	0.67
91	0.73
92	0.77
93	0.76
94	0.78
95	0.77
96	0.8
97	0.8
98	0.77
99	0.75
100	0.76
101	0.75
102	0.66
103	0.57
104	0.48
105	0.38
106	0.31
107	0.3
108	0.2
109	0.19
110	0.18
111	0.19
112	0.17
113	0.16
114	0.17
115	0.12
116	0.13
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.11
121	0.1
122	0.12
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.18
127	0.18
128	0.19
129	0.19
130	0.21
131	0.21
132	0.18
133	0.18
134	0.19
135	0.2
136	0.2
137	0.2
138	0.17
139	0.15
140	0.17
141	0.16
142	0.15
143	0.16
144	0.2
145	0.22
146	0.23
147	0.2
148	0.27
149	0.27
150	0.27
151	0.28
152	0.23
153	0.24
154	0.23
155	0.23
156	0.14
157	0.13
158	0.14
159	0.12
160	0.12
161	0.13
162	0.16
163	0.18
164	0.19
165	0.23
166	0.25
167	0.29
168	0.34
169	0.37
170	0.37
171	0.37
172	0.35
173	0.33
174	0.3
175	0.26
176	0.21
177	0.15
178	0.12
179	0.11
180	0.11
181	0.1
182	0.11
183	0.14
184	0.19
185	0.27
186	0.31
187	0.38
188	0.47
189	0.54
190	0.62
191	0.71
192	0.72
193	0.75
194	0.77
195	0.79
196	0.79
197	0.79
198	0.72
199	0.65
200	0.6
201	0.5
202	0.41
203	0.32
204	0.23
205	0.14
206	0.11
207	0.06
208	0.05
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.02
213	0.02
214	0.02
215	0.02
216	0.02
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.03
225	0.03
226	0.05
227	0.06
228	0.09
229	0.11
230	0.12
231	0.13
232	0.13
233	0.14
234	0.14
235	0.17
236	0.16
237	0.16
238	0.16
239	0.15
240	0.15
241	0.14
242	0.13
243	0.1
244	0.08
245	0.06
246	0.06
247	0.05
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.06
252	0.08
253	0.12
254	0.15
255	0.17
256	0.17
257	0.19
258	0.22
259	0.25
260	0.3
261	0.34
262	0.35
263	0.39
264	0.4
265	0.38
266	0.37
267	0.33
268	0.28
269	0.21
270	0.19
271	0.15
272	0.15
273	0.13
274	0.12
275	0.15
276	0.15
277	0.14
278	0.15
279	0.18
280	0.2
281	0.21
282	0.27
283	0.28
284	0.34
285	0.36
286	0.4
287	0.42
288	0.48
289	0.53
290	0.54
291	0.56
292	0.56
293	0.58
294	0.57
295	0.51
296	0.44
297	0.42
298	0.35
299	0.33
300	0.28
301	0.23
302	0.18
303	0.16
304	0.16
305	0.12
306	0.12
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.1
311	0.11
312	0.09
313	0.09
314	0.09
315	0.1
316	0.09
317	0.09
318	0.06
319	0.06
320	0.12
321	0.16
322	0.16
323	0.17
324	0.17
325	0.16
326	0.18
327	0.18
328	0.14
329	0.12
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.13
344	0.17
345	0.21
346	0.22
347	0.22
348	0.22
349	0.28
350	0.26
351	0.22
352	0.24
353	0.2
354	0.21
355	0.28
356	0.33
357	0.29
358	0.3
359	0.34
360	0.34
361	0.36
362	0.33
363	0.27
364	0.23
365	0.21
366	0.23
367	0.19
368	0.15
369	0.12
370	0.12
371	0.11
372	0.11
373	0.1
374	0.07
375	0.06
376	0.05
377	0.06
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.06
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.15
389	0.15
390	0.15
391	0.18
392	0.14
393	0.15
394	0.16
395	0.15
396	0.12
397	0.11
398	0.11
399	0.07
400	0.08
401	0.07
402	0.06
403	0.08
404	0.08
405	0.11
406	0.14
407	0.16
408	0.16
409	0.18
410	0.26
411	0.35
412	0.38
413	0.41
414	0.43
415	0.42
416	0.41
417	0.4
418	0.36
419	0.26
420	0.28
421	0.24
422	0.19
423	0.2
424	0.21
425	0.2
426	0.16
427	0.17
428	0.11
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.05
446	0.04
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.08
452	0.11
453	0.12
454	0.14
455	0.17
456	0.21
457	0.24
458	0.29
459	0.31
460	0.3
461	0.31
462	0.3
463	0.28
464	0.25
465	0.22
466	0.16
467	0.14
468	0.12
469	0.1
470	0.1
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.14
481	0.14
482	0.12
483	0.14
484	0.13
485	0.13
486	0.13
487	0.11
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.07
492	0.05
493	0.05
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.07
500	0.07
501	0.08
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.06
509	0.06
510	0.08
511	0.09
512	0.09
513	0.1
514	0.1
515	0.09
516	0.11
517	0.11
518	0.07
519	0.08
520	0.09
521	0.09
522	0.11
523	0.12
524	0.11
525	0.14
526	0.19
527	0.19
528	0.18
529	0.22
530	0.23
531	0.29
532	0.36
533	0.37
534	0.39
535	0.41
536	0.4
537	0.35
538	0.33
539	0.26
540	0.19
541	0.15
542	0.11
543	0.08
544	0.09
545	0.11
546	0.11
547	0.12
548	0.12
549	0.11
550	0.11
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.07
556	0.07
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.04
568	0.06
569	0.08
570	0.11
571	0.19
572	0.25
573	0.37
574	0.46
575	0.55
576	0.63
577	0.71
578	0.79
579	0.83
580	0.88
581	0.89
582	0.9
583	0.92
584	0.92
585	0.89
586	0.85
587	0.76
588	0.69
589	0.58
590	0.5
591	0.42
592	0.32
593	0.27
594	0.22
595	0.2
596	0.16
597	0.15
598	0.13
599	0.1
600	0.11
601	0.12
602	0.15
603	0.15
604	0.19
605	0.24
606	0.27
607	0.31
608	0.34
609	0.37
610	0.36
611	0.4
612	0.4
613	0.4
614	0.38
615	0.4
616	0.34
617	0.33
618	0.33
619	0.3
620	0.29
621	0.28
622	0.26
623	0.24
624	0.26
625	0.24
626	0.24
627	0.23
628	0.22
629	0.23
630	0.22
631	0.2
632	0.18
633	0.16
634	0.15
635	0.17
636	0.14
637	0.12
638	0.12
639	0.12
640	0.14
641	0.19
642	0.28
643	0.34
644	0.42
645	0.43
646	0.48
647	0.49
648	0.5
649	0.48
650	0.39
651	0.32
652	0.25

J3PCE7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer