FuNGI

A0A2J6TW61

Protein Details

Accession

A0A2J6TW61

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-35	PLKFQSQSSKSKKKSAPSKKSPKSAPPPASFKS	Hydrophilic
492-521	PSPGKGDQRPSEKPKSKKRDRSESATPLTK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-28	KSKKKSAPSKKSPKSAP
400-413	KRKHGEKEERKSKH
488-512	PRAQPSPGKGDQRPSEKPKSKKRDR
542-552	RRKKIKWLKNK

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MPPLKFQSQSSKSKKKSAPSKKSPKSAPPPASFKSAEYVQESDEEEPVNSEKESESDSDGESLPSNPVDIMITPNGKLQRPAGSSSSSENESESDENGSEADDEEEEEPSVAAKQTAAGPDKMASKPPRGSVVTFQKPPLYKPPVGFEKASLEGTPKAEHMFKRSSLGEKQIWYFTAPASLPVSAIEQMSWKDATDGKPIVNHNGNEYGFMRDSAEDKTYTKIMVPDGSDDGYRTVKKPIDQIFHLQQILQLPGAHASSSITASSSKATVPAKKPIRQQPQGLKMRFRPIGFGGGETGKIGSSSSSVDSSSDEEVEQPPAAFRPPVPIASESSEEEESPEDSESDGQSSEDSGSDEESSSSDVEMTEAPPLLRKPIAEERNNKISATVSSSQEVTNGSLKRKHGEKEERKSKHSSSRSLSIDDRELKRLKEKQTESQRGLGGRASVSIEPRKSSTQGSSAKSGITSSKADTPIRPPKSAILPHSSPAPRAQPSPGKGDQRPSEKPKSKKRDRSESATPLTKSGVSLHDLTKATDPSLTGEERRKKIKWLKNKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.78
3	0.81
4	0.82
5	0.83
6	0.83
7	0.89
8	0.88
9	0.92
10	0.9
11	0.89
12	0.88
13	0.88
14	0.86
15	0.83
16	0.81
17	0.74
18	0.73
19	0.64
20	0.54
21	0.49
22	0.43
23	0.39
24	0.35
25	0.33
26	0.27
27	0.29
28	0.29
29	0.25
30	0.23
31	0.2
32	0.16
33	0.17
34	0.17
35	0.16
36	0.14
37	0.14
38	0.12
39	0.13
40	0.16
41	0.15
42	0.17
43	0.16
44	0.17
45	0.19
46	0.19
47	0.18
48	0.17
49	0.16
50	0.14
51	0.13
52	0.12
53	0.1
54	0.1
55	0.1
56	0.1
57	0.13
58	0.15
59	0.17
60	0.17
61	0.22
62	0.25
63	0.26
64	0.27
65	0.26
66	0.3
67	0.31
68	0.35
69	0.33
70	0.32
71	0.32
72	0.34
73	0.35
74	0.28
75	0.26
76	0.23
77	0.21
78	0.21
79	0.2
80	0.17
81	0.15
82	0.13
83	0.13
84	0.12
85	0.12
86	0.09
87	0.08
88	0.09
89	0.07
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.06
101	0.08
102	0.1
103	0.16
104	0.18
105	0.17
106	0.18
107	0.2
108	0.25
109	0.25
110	0.3
111	0.29
112	0.33
113	0.36
114	0.38
115	0.42
116	0.4
117	0.41
118	0.42
119	0.49
120	0.5
121	0.48
122	0.47
123	0.47
124	0.45
125	0.46
126	0.47
127	0.44
128	0.4
129	0.39
130	0.45
131	0.47
132	0.49
133	0.46
134	0.38
135	0.35
136	0.34
137	0.32
138	0.25
139	0.21
140	0.2
141	0.21
142	0.2
143	0.16
144	0.16
145	0.19
146	0.21
147	0.24
148	0.25
149	0.25
150	0.28
151	0.29
152	0.32
153	0.31
154	0.36
155	0.34
156	0.32
157	0.33
158	0.3
159	0.29
160	0.25
161	0.23
162	0.16
163	0.17
164	0.14
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.12
169	0.12
170	0.13
171	0.1
172	0.1
173	0.08
174	0.08
175	0.09
176	0.11
177	0.1
178	0.09
179	0.1
180	0.13
181	0.15
182	0.19
183	0.2
184	0.18
185	0.23
186	0.24
187	0.28
188	0.3
189	0.27
190	0.24
191	0.28
192	0.28
193	0.26
194	0.26
195	0.23
196	0.18
197	0.18
198	0.16
199	0.12
200	0.13
201	0.13
202	0.14
203	0.12
204	0.13
205	0.14
206	0.14
207	0.13
208	0.13
209	0.13
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.13
214	0.14
215	0.14
216	0.13
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.16
223	0.17
224	0.19
225	0.25
226	0.3
227	0.31
228	0.32
229	0.36
230	0.35
231	0.36
232	0.35
233	0.28
234	0.23
235	0.2
236	0.19
237	0.14
238	0.11
239	0.08
240	0.09
241	0.09
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.1
255	0.12
256	0.18
257	0.2
258	0.29
259	0.35
260	0.39
261	0.46
262	0.52
263	0.6
264	0.59
265	0.63
266	0.62
267	0.66
268	0.7
269	0.65
270	0.59
271	0.53
272	0.55
273	0.51
274	0.43
275	0.35
276	0.27
277	0.3
278	0.26
279	0.23
280	0.18
281	0.15
282	0.15
283	0.12
284	0.11
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.08
295	0.08
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.08
300	0.09
301	0.1
302	0.1
303	0.1
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.11
311	0.13
312	0.14
313	0.16
314	0.17
315	0.18
316	0.2
317	0.22
318	0.17
319	0.19
320	0.18
321	0.15
322	0.15
323	0.13
324	0.11
325	0.1
326	0.1
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.07
347	0.07
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.1
357	0.1
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.17
362	0.26
363	0.34
364	0.39
365	0.46
366	0.5
367	0.57
368	0.58
369	0.52
370	0.42
371	0.36
372	0.3
373	0.3
374	0.27
375	0.21
376	0.21
377	0.22
378	0.21
379	0.21
380	0.2
381	0.15
382	0.18
383	0.19
384	0.22
385	0.26
386	0.27
387	0.31
388	0.36
389	0.38
390	0.42
391	0.51
392	0.58
393	0.64
394	0.73
395	0.74
396	0.73
397	0.75
398	0.71
399	0.7
400	0.67
401	0.64
402	0.59
403	0.62
404	0.6
405	0.58
406	0.55
407	0.47
408	0.47
409	0.47
410	0.43
411	0.42
412	0.42
413	0.4
414	0.46
415	0.5
416	0.51
417	0.54
418	0.56
419	0.59
420	0.68
421	0.75
422	0.7
423	0.68
424	0.63
425	0.54
426	0.5
427	0.41
428	0.32
429	0.23
430	0.2
431	0.18
432	0.16
433	0.2
434	0.25
435	0.25
436	0.26
437	0.28
438	0.31
439	0.3
440	0.32
441	0.31
442	0.34
443	0.39
444	0.41
445	0.42
446	0.39
447	0.37
448	0.34
449	0.32
450	0.25
451	0.21
452	0.2
453	0.18
454	0.24
455	0.28
456	0.3
457	0.32
458	0.39
459	0.46
460	0.49
461	0.48
462	0.43
463	0.44
464	0.51
465	0.54
466	0.5
467	0.48
468	0.45
469	0.44
470	0.52
471	0.48
472	0.41
473	0.39
474	0.41
475	0.36
476	0.36
477	0.43
478	0.42
479	0.44
480	0.5
481	0.52
482	0.53
483	0.54
484	0.61
485	0.61
486	0.61
487	0.67
488	0.68
489	0.72
490	0.73
491	0.79
492	0.81
493	0.85
494	0.87
495	0.89
496	0.9
497	0.91
498	0.89
499	0.88
500	0.87
501	0.85
502	0.82
503	0.79
504	0.7
505	0.6
506	0.54
507	0.46
508	0.37
509	0.31
510	0.26
511	0.22
512	0.24
513	0.24
514	0.29
515	0.29
516	0.3
517	0.32
518	0.3
519	0.27
520	0.25
521	0.25
522	0.21
523	0.25
524	0.26
525	0.27
526	0.35
527	0.44
528	0.49
529	0.56
530	0.55
531	0.61
532	0.68
533	0.73

A0A2J6TW61

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer