Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TIP4

Protein Details
Accession A0A2J6TIP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-165LERAPPPKSARPKSRRTKSANMPIPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-156PPKSARPKSRRT
Subcellular Location(s) cyto 13.5cyto_nucl 13.5, nucl 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009686  Senescence/spartin_C  
IPR045036  Spartin-like  
Pfam View protein in Pfam  
PF06911  Senescence  
Amino Acid Sequences MASGHNDPKLLYAINGINAYHIENGKEECLTPAGPQTLSLLMVPTSSPFSGLSNADLQSATPEEDFYLHLHLPPELDLPLPATTQIYHQPPDSYLIPRWDIGHDNGAFTRIEFPGIGQGKVSQEDVDTFETILAQCTAFLERAPPPKSARPKSRRTKSANMPIPPYDPSTFKPGEAYVTGSASSHAGGQIVLIDEENGSVVGELGDGFHVVEDSKMQAGSKDPVEITLPSDGSMNIGVAPASAAYLEMAMHPAYRNSTLVSKAAMASRLIVTTSTYVSKTLQSSADNFTQKTKPSSKPVTFTPTTHARIRKVHTFSEGAAGLSAKTVGQVQKYAQNLGATLAKKGADQRAKRGIGPDGQPIEDYKPGLLNKSLMAFSTIADGVDQAGRNILASTSTAATTVVTH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.21
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.19
8 0.18
9 0.16
10 0.17
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.18
15 0.16
16 0.17
17 0.17
18 0.16
19 0.19
20 0.21
21 0.2
22 0.2
23 0.2
24 0.19
25 0.19
26 0.17
27 0.13
28 0.1
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.13
37 0.16
38 0.16
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.19
43 0.18
44 0.16
45 0.15
46 0.16
47 0.15
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.13
53 0.11
54 0.14
55 0.13
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.15
61 0.15
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.18
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.23
78 0.27
79 0.27
80 0.25
81 0.24
82 0.27
83 0.27
84 0.26
85 0.27
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.27
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.23
94 0.2
95 0.17
96 0.19
97 0.12
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.19
108 0.2
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.13
129 0.21
130 0.24
131 0.26
132 0.29
133 0.37
134 0.47
135 0.53
136 0.6
137 0.61
138 0.69
139 0.77
140 0.82
141 0.84
142 0.82
143 0.83
144 0.81
145 0.83
146 0.8
147 0.72
148 0.66
149 0.58
150 0.52
151 0.44
152 0.38
153 0.29
154 0.23
155 0.22
156 0.25
157 0.24
158 0.22
159 0.22
160 0.18
161 0.19
162 0.17
163 0.18
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.19
271 0.22
272 0.28
273 0.27
274 0.27
275 0.29
276 0.31
277 0.32
278 0.36
279 0.39
280 0.39
281 0.45
282 0.55
283 0.54
284 0.54
285 0.56
286 0.58
287 0.53
288 0.48
289 0.45
290 0.44
291 0.44
292 0.47
293 0.47
294 0.44
295 0.49
296 0.53
297 0.56
298 0.52
299 0.5
300 0.48
301 0.44
302 0.4
303 0.38
304 0.33
305 0.24
306 0.2
307 0.18
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.06
312 0.06
313 0.09
314 0.11
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.23
319 0.25
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.21
324 0.21
325 0.25
326 0.2
327 0.19
328 0.19
329 0.17
330 0.18
331 0.23
332 0.3
333 0.34
334 0.37
335 0.45
336 0.53
337 0.55
338 0.55
339 0.54
340 0.5
341 0.47
342 0.46
343 0.46
344 0.39
345 0.38
346 0.36
347 0.35
348 0.33
349 0.29
350 0.27
351 0.19
352 0.22
353 0.23
354 0.25
355 0.25
356 0.23
357 0.22
358 0.25
359 0.24
360 0.19
361 0.2
362 0.17
363 0.15
364 0.18
365 0.16
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.11
370 0.14
371 0.14
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.11
378 0.09
379 0.09
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.12
384 0.11