Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TPD2

Protein Details
Accession A0A2J6TPD2    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-305TTTTNGGRRRKRKGALTNPSSYHydrophilic
369-389SNYTMSGKKHVKKGKYQSGMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-296RRRKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKKWIDKKTATHFTLVHRPQTDPLIHDESASAMVLNPTPLPNSNKVKKLDDLASELGSDVEKIRENEGEAANYGIYYDDSEYDYMQHMRDLGSGSGEAYFVEAPAPKNKGKGKQSLEDALKDANLEDRTGPLLDEEILPSKNLRKVTYQAQQNIPDALAGFQPDMDPRIREVLEALEDEAYVDEDEDIFGELAKDGEEVEEVEFEQGAWDDEDGGWESDDTAKPAKEYKDAPELTAEMVDDEREDHGDGSWMEDFSKFKKDQKAKATPMAPFQSDLQSSIMTTTTNGGRRRKRKGALTNPSSYSMTSSSMFRTEGLTTLDARFEKIEEQYNEDFDDMASVSAASSTVSSVQGPVRGDFDSIIDDFLSNYTMSGKKHVKKGKYQSGMEQLDEVRKGLGPARIRSQKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.62
3 0.63
4 0.58
5 0.56
6 0.48
7 0.48
8 0.46
9 0.49
10 0.45
11 0.37
12 0.39
13 0.37
14 0.35
15 0.33
16 0.3
17 0.25
18 0.23
19 0.21
20 0.14
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.11
27 0.13
28 0.18
29 0.23
30 0.3
31 0.39
32 0.46
33 0.52
34 0.56
35 0.58
36 0.57
37 0.57
38 0.54
39 0.48
40 0.46
41 0.4
42 0.36
43 0.32
44 0.28
45 0.22
46 0.17
47 0.14
48 0.1
49 0.1
50 0.13
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.2
55 0.24
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.19
60 0.17
61 0.15
62 0.13
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.06
90 0.07
91 0.09
92 0.1
93 0.16
94 0.2
95 0.2
96 0.27
97 0.33
98 0.41
99 0.45
100 0.53
101 0.54
102 0.56
103 0.59
104 0.61
105 0.57
106 0.5
107 0.44
108 0.35
109 0.3
110 0.23
111 0.19
112 0.16
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.15
130 0.18
131 0.2
132 0.21
133 0.22
134 0.25
135 0.33
136 0.39
137 0.42
138 0.43
139 0.46
140 0.47
141 0.45
142 0.42
143 0.34
144 0.26
145 0.2
146 0.15
147 0.1
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.07
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.29
219 0.29
220 0.29
221 0.26
222 0.25
223 0.22
224 0.2
225 0.16
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.19
246 0.19
247 0.23
248 0.33
249 0.4
250 0.47
251 0.56
252 0.64
253 0.62
254 0.68
255 0.66
256 0.59
257 0.58
258 0.53
259 0.43
260 0.34
261 0.31
262 0.27
263 0.23
264 0.23
265 0.17
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.13
274 0.19
275 0.25
276 0.33
277 0.42
278 0.51
279 0.6
280 0.67
281 0.69
282 0.73
283 0.78
284 0.81
285 0.82
286 0.8
287 0.77
288 0.7
289 0.66
290 0.57
291 0.46
292 0.37
293 0.28
294 0.23
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.2
309 0.18
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.25
316 0.23
317 0.29
318 0.3
319 0.3
320 0.3
321 0.28
322 0.25
323 0.16
324 0.16
325 0.1
326 0.08
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.16
341 0.17
342 0.17
343 0.18
344 0.18
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.14
360 0.15
361 0.24
362 0.33
363 0.38
364 0.48
365 0.57
366 0.61
367 0.68
368 0.78
369 0.8
370 0.8
371 0.77
372 0.76
373 0.77
374 0.72
375 0.63
376 0.55
377 0.47
378 0.43
379 0.41
380 0.33
381 0.24
382 0.21
383 0.22
384 0.23
385 0.27
386 0.28
387 0.33
388 0.43