FuNGI

A0A2J6STL1

Protein Details

Accession

A0A2J6STL1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-53	VRKAKAADPLRPRKKPVRRPNVPPKQPIGL	Hydrophilic
538-564	ESSGNESSRKKHKNKHPSSSQPTRTST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-48	RKAKAADPLRPRKKPVRRPNVPPK
428-446	EARKRKELGKDLVKALKKR
485-502	KKDEEAKNKAKAESKLPS
507-508	KG
510-534	NTPSGRPKHTDPLKKAKNLKRPGSP
544-552	SSRKKHKNK
634-640	RKNKKIK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGLSNGQTPTPNGGPPQFVRKAKAADPLRPRKKPVRRPNVPPKQPIGLGISAPGSAGRPTPLNGVAPSLGIGSYQTPANGTHNQNLYGGWTHPPPPPSQYQDFPLLTTKRALREGLRYHIARFAAPKKDVDPSNQDDFTRPVVLHRRDPKQPPPGKGIKDEDAVAEEPMDSKEREKQEILKAEKEKQKAADLAQIAPTGNNLSALAAKKTQAFRNEKTTQVHRLDKTEEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNAIFFIDGATFRMIPLEKWYKFTPKGHFKTFTIEEAEAKMSKKHKESRWVMKTNEQKEADRATQDTRKTLNNLYTVKAESNTFKNVGKREVEDMDDLDYDAEDLFQDDDEQATVEPDKDEETKDAQDRIKREQLGANIFDNANEAEVDQELEEEAKEARKRKELGKDLVKALKKRERNLAYESDSDGNPYSETACVMSEDDTSDEEKQKEIDRKKDEEAKNKAKAESKLPSGTSTKGTNTPSGRPKHTDPLKKAKNLKRPGSPNLSESSGNESSRKKHKNKHPSSSQPTRTSTPVPSSRPMSPAPSTSQPAPNSSPRKSSIIKLNVNPNKLSDIQSSPPNPSPVYNAMSDGEATGGEGSDGGRKNKKIKLTIKGQSPTGSRAGSPAPGKAGSVGGSRAGSPAALQNAPATEAGPPRAKSPAVGPIQPHEIVAALPTSGAGIVAGVLMNLFGKRVGDQPNQTPRKDFIQMVKENSKYGPDKLLRRKDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.3
3	0.3
4	0.31
5	0.3
6	0.33
7	0.34
8	0.41
9	0.44
10	0.45
11	0.48
12	0.5
13	0.52
14	0.5
15	0.57
16	0.54
17	0.54
18	0.61
19	0.68
20	0.72
21	0.73
22	0.77
23	0.78
24	0.84
25	0.86
26	0.86
27	0.86
28	0.85
29	0.9
30	0.93
31	0.94
32	0.92
33	0.88
34	0.83
35	0.77
36	0.68
37	0.61
38	0.55
39	0.46
40	0.37
41	0.31
42	0.26
43	0.19
44	0.18
45	0.15
46	0.11
47	0.1
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.14
52	0.18
53	0.2
54	0.21
55	0.21
56	0.22
57	0.21
58	0.19
59	0.18
60	0.14
61	0.12
62	0.09
63	0.09
64	0.08
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.17
71	0.24
72	0.26
73	0.31
74	0.34
75	0.35
76	0.34
77	0.32
78	0.3
79	0.25
80	0.23
81	0.19
82	0.19
83	0.21
84	0.25
85	0.27
86	0.26
87	0.29
88	0.35
89	0.39
90	0.42
91	0.42
92	0.42
93	0.48
94	0.46
95	0.42
96	0.43
97	0.38
98	0.34
99	0.36
100	0.35
101	0.32
102	0.34
103	0.35
104	0.31
105	0.39
106	0.43
107	0.44
108	0.48
109	0.45
110	0.43
111	0.45
112	0.41
113	0.34
114	0.35
115	0.35
116	0.36
117	0.37
118	0.38
119	0.35
120	0.42
121	0.42
122	0.41
123	0.42
124	0.4
125	0.45
126	0.45
127	0.43
128	0.38
129	0.38
130	0.36
131	0.3
132	0.24
133	0.24
134	0.32
135	0.36
136	0.43
137	0.49
138	0.52
139	0.58
140	0.66
141	0.68
142	0.69
143	0.72
144	0.68
145	0.68
146	0.7
147	0.65
148	0.65
149	0.61
150	0.54
151	0.49
152	0.45
153	0.37
154	0.31
155	0.28
156	0.21
157	0.16
158	0.12
159	0.11
160	0.12
161	0.13
162	0.1
163	0.12
164	0.19
165	0.23
166	0.27
167	0.28
168	0.33
169	0.39
170	0.48
171	0.5
172	0.51
173	0.52
174	0.56
175	0.6
176	0.57
177	0.53
178	0.46
179	0.46
180	0.41
181	0.39
182	0.37
183	0.32
184	0.3
185	0.28
186	0.26
187	0.21
188	0.18
189	0.17
190	0.12
191	0.1
192	0.09
193	0.07
194	0.07
195	0.1
196	0.12
197	0.13
198	0.13
199	0.14
200	0.19
201	0.23
202	0.27
203	0.33
204	0.39
205	0.4
206	0.49
207	0.51
208	0.51
209	0.52
210	0.53
211	0.52
212	0.52
213	0.56
214	0.48
215	0.49
216	0.48
217	0.49
218	0.53
219	0.53
220	0.5
221	0.46
222	0.46
223	0.45
224	0.48
225	0.44
226	0.41
227	0.34
228	0.32
229	0.32
230	0.31
231	0.29
232	0.24
233	0.23
234	0.18
235	0.17
236	0.15
237	0.12
238	0.12
239	0.14
240	0.17
241	0.19
242	0.2
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.13
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.15
274	0.23
275	0.22
276	0.26
277	0.29
278	0.34
279	0.39
280	0.44
281	0.46
282	0.49
283	0.54
284	0.56
285	0.57
286	0.51
287	0.53
288	0.49
289	0.42
290	0.35
291	0.3
292	0.24
293	0.22
294	0.23
295	0.18
296	0.16
297	0.18
298	0.19
299	0.23
300	0.29
301	0.36
302	0.4
303	0.48
304	0.56
305	0.63
306	0.68
307	0.7
308	0.65
309	0.65
310	0.68
311	0.61
312	0.61
313	0.52
314	0.44
315	0.4
316	0.42
317	0.36
318	0.29
319	0.27
320	0.23
321	0.26
322	0.26
323	0.26
324	0.24
325	0.25
326	0.26
327	0.28
328	0.27
329	0.28
330	0.29
331	0.27
332	0.27
333	0.26
334	0.23
335	0.21
336	0.18
337	0.15
338	0.16
339	0.17
340	0.17
341	0.18
342	0.21
343	0.22
344	0.25
345	0.24
346	0.23
347	0.24
348	0.23
349	0.23
350	0.19
351	0.18
352	0.15
353	0.13
354	0.12
355	0.08
356	0.07
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.09
379	0.11
380	0.14
381	0.15
382	0.19
383	0.2
384	0.23
385	0.25
386	0.29
387	0.32
388	0.3
389	0.3
390	0.29
391	0.3
392	0.31
393	0.3
394	0.25
395	0.21
396	0.2
397	0.18
398	0.16
399	0.12
400	0.09
401	0.06
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.08
414	0.12
415	0.17
416	0.2
417	0.26
418	0.29
419	0.35
420	0.44
421	0.48
422	0.53
423	0.56
424	0.57
425	0.55
426	0.59
427	0.56
428	0.49
429	0.49
430	0.49
431	0.46
432	0.46
433	0.52
434	0.5
435	0.5
436	0.52
437	0.5
438	0.46
439	0.42
440	0.41
441	0.33
442	0.28
443	0.25
444	0.21
445	0.15
446	0.12
447	0.1
448	0.09
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.08
460	0.1
461	0.11
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.2
467	0.28
468	0.32
469	0.39
470	0.42
471	0.46
472	0.51
473	0.59
474	0.6
475	0.61
476	0.65
477	0.65
478	0.66
479	0.65
480	0.63
481	0.6
482	0.56
483	0.53
484	0.48
485	0.44
486	0.4
487	0.38
488	0.38
489	0.34
490	0.33
491	0.29
492	0.26
493	0.24
494	0.25
495	0.27
496	0.29
497	0.3
498	0.35
499	0.4
500	0.43
501	0.45
502	0.45
503	0.47
504	0.52
505	0.58
506	0.6
507	0.59
508	0.65
509	0.69
510	0.71
511	0.77
512	0.76
513	0.77
514	0.77
515	0.77
516	0.75
517	0.74
518	0.74
519	0.73
520	0.66
521	0.59
522	0.52
523	0.47
524	0.39
525	0.33
526	0.33
527	0.28
528	0.26
529	0.28
530	0.28
531	0.31
532	0.41
533	0.49
534	0.5
535	0.57
536	0.66
537	0.74
538	0.81
539	0.86
540	0.86
541	0.87
542	0.88
543	0.89
544	0.87
545	0.82
546	0.76
547	0.69
548	0.62
549	0.55
550	0.49
551	0.47
552	0.45
553	0.43
554	0.43
555	0.44
556	0.43
557	0.43
558	0.41
559	0.38
560	0.33
561	0.32
562	0.33
563	0.33
564	0.34
565	0.34
566	0.39
567	0.35
568	0.38
569	0.39
570	0.43
571	0.46
572	0.45
573	0.47
574	0.44
575	0.48
576	0.46
577	0.47
578	0.48
579	0.51
580	0.54
581	0.54
582	0.61
583	0.61
584	0.62
585	0.56
586	0.48
587	0.42
588	0.38
589	0.37
590	0.3
591	0.29
592	0.29
593	0.35
594	0.36
595	0.37
596	0.39
597	0.38
598	0.34
599	0.31
600	0.33
601	0.3
602	0.31
603	0.27
604	0.25
605	0.22
606	0.22
607	0.21
608	0.16
609	0.12
610	0.08
611	0.08
612	0.06
613	0.05
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.11
618	0.14
619	0.19
620	0.25
621	0.3
622	0.37
623	0.42
624	0.5
625	0.54
626	0.59
627	0.63
628	0.67
629	0.7
630	0.72
631	0.71
632	0.65
633	0.61
634	0.55
635	0.49
636	0.44
637	0.37
638	0.28
639	0.27
640	0.26
641	0.27
642	0.26
643	0.24
644	0.23
645	0.22
646	0.23
647	0.21
648	0.2
649	0.16
650	0.17
651	0.16
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.14
656	0.13
657	0.11
658	0.1
659	0.13
660	0.15
661	0.15
662	0.15
663	0.16
664	0.16
665	0.18
666	0.17
667	0.13
668	0.13
669	0.16
670	0.2
671	0.25
672	0.25
673	0.26
674	0.3
675	0.29
676	0.27
677	0.29
678	0.33
679	0.32
680	0.35
681	0.35
682	0.35
683	0.4
684	0.39
685	0.34
686	0.25
687	0.21
688	0.17
689	0.16
690	0.12
691	0.07
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.03
699	0.03
700	0.04
701	0.04
702	0.03
703	0.03
704	0.04
705	0.05
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.07
710	0.09
711	0.15
712	0.23
713	0.3
714	0.35
715	0.45
716	0.55
717	0.61
718	0.61
719	0.6
720	0.55
721	0.54
722	0.54
723	0.49
724	0.47
725	0.51
726	0.55
727	0.59
728	0.64
729	0.58
730	0.56
731	0.52
732	0.51
733	0.44
734	0.42
735	0.43
736	0.43
737	0.52
738	0.6

A0A2J6STL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer