Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TPC3

Protein Details
Accession A0A2J6TPC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-299GYGSRSGRTPPRRRDFDGRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-356RGRGRGNSRDRGRGERGRGYR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 12, cyto 8, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MAPSKPALDLNSMINADRARRKHEAIAAEIFGRNRRSSAPGAAAASTRKTGQIGAAPSLASRIGGGIAKRTVSSSARPARASPKPNAGNVDAEWTHDLHTLNNPAADKVTQIPRGPKAGRGSRNDRLYTALNGSASSPALNSQFNIVGSAKTTAGISIRGLAGPYIVIAKNLAVGTTAADIESAMTPVGGVVLGCRLIAERPKVIAELIFESKEGADNVVDTFNNQNADGNILHVYHKAGPVPPRAKLLAAQAAPPERSVTPTGPRADTITERSDDTPSGYGSRSGRTPPRRRDFDGRDDVIDGSYGFDEDRMDTDDRQDGGRGRGLYSDTMIGNRGRGRGNSRDRGRGERGRGYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.27
4 0.33
5 0.34
6 0.36
7 0.41
8 0.45
9 0.49
10 0.53
11 0.52
12 0.48
13 0.5
14 0.44
15 0.4
16 0.39
17 0.34
18 0.32
19 0.31
20 0.27
21 0.24
22 0.25
23 0.28
24 0.3
25 0.34
26 0.33
27 0.33
28 0.34
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.23
34 0.19
35 0.17
36 0.16
37 0.16
38 0.17
39 0.2
40 0.21
41 0.21
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.2
46 0.17
47 0.11
48 0.08
49 0.06
50 0.07
51 0.09
52 0.1
53 0.13
54 0.14
55 0.15
56 0.15
57 0.16
58 0.18
59 0.19
60 0.22
61 0.28
62 0.34
63 0.38
64 0.39
65 0.41
66 0.45
67 0.51
68 0.53
69 0.48
70 0.5
71 0.5
72 0.51
73 0.53
74 0.46
75 0.41
76 0.35
77 0.36
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.19
82 0.18
83 0.18
84 0.18
85 0.13
86 0.17
87 0.18
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.13
95 0.15
96 0.2
97 0.22
98 0.24
99 0.29
100 0.3
101 0.37
102 0.37
103 0.37
104 0.4
105 0.44
106 0.49
107 0.52
108 0.57
109 0.58
110 0.63
111 0.59
112 0.51
113 0.46
114 0.41
115 0.35
116 0.29
117 0.23
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.11
123 0.09
124 0.07
125 0.07
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.12
133 0.11
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.05
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.09
215 0.12
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.19
228 0.27
229 0.3
230 0.3
231 0.32
232 0.31
233 0.31
234 0.29
235 0.3
236 0.27
237 0.25
238 0.25
239 0.24
240 0.26
241 0.26
242 0.24
243 0.22
244 0.15
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.22
249 0.28
250 0.3
251 0.29
252 0.3
253 0.28
254 0.28
255 0.28
256 0.27
257 0.25
258 0.23
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.22
263 0.22
264 0.19
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.19
269 0.19
270 0.21
271 0.21
272 0.25
273 0.34
274 0.43
275 0.52
276 0.59
277 0.68
278 0.72
279 0.77
280 0.81
281 0.79
282 0.79
283 0.78
284 0.7
285 0.61
286 0.55
287 0.49
288 0.38
289 0.31
290 0.21
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.13
300 0.15
301 0.15
302 0.18
303 0.23
304 0.23
305 0.23
306 0.25
307 0.24
308 0.25
309 0.3
310 0.28
311 0.24
312 0.26
313 0.27
314 0.25
315 0.23
316 0.23
317 0.18
318 0.19
319 0.21
320 0.19
321 0.21
322 0.23
323 0.25
324 0.25
325 0.29
326 0.35
327 0.43
328 0.52
329 0.58
330 0.61
331 0.67
332 0.68
333 0.71
334 0.74
335 0.73
336 0.7