Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PFM1

Protein Details
Accession J3PFM1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
320-343LKALEDKKNKEKPNVGRKRKALEABasic
379-407NDDKLDKQIKERKDKLKKQKKAAKLAMEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-214PRKPKSDKSQQQQPKKKGSGKKEKG
326-339KKNKEKPNVGRKRK
363-374AKKPAKKKAKVP
384-402DKQIKERKDKLKKQKKAAK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MTKSLSVPKAEDASVFPIASEQIVKASKALLSHMRKAAKEASASASKKNLLEDDEGSDMAQEPIWLNLTTKRNVRDDNSLKPGRVAVPHPLIPADSEATICLVVADPQRAYKDIVASDEFPAALAKRITRVVDVTHLQAKFRTFEAQRQLFASHDVFLADDRIINRLPKCLGKTFYRSTAKRPIPVYLAPRKPKSDKSQQQQPKKKGSGKKEKGDEANARPAAEIAAEVQAATGAALVHLSPSTSTAVKVGFGGWTADQLAENAAAVARALVERHIPRKWANVRSVFLKGTTTAALPLWQTDELWLDGAKDVLPEGSEELKALEDKKNKEKPNVGRKRKALEAAAEDAAADGEEVEEVAAAEAKKPAKKKAKVPVVESNDDKLDKQIKERKDKLKKQKKAAKLAMEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.11
9 0.14
10 0.16
11 0.17
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.17
16 0.22
17 0.26
18 0.3
19 0.37
20 0.44
21 0.47
22 0.46
23 0.5
24 0.51
25 0.46
26 0.42
27 0.37
28 0.36
29 0.4
30 0.41
31 0.4
32 0.39
33 0.38
34 0.37
35 0.37
36 0.33
37 0.28
38 0.3
39 0.28
40 0.27
41 0.26
42 0.25
43 0.22
44 0.19
45 0.17
46 0.13
47 0.11
48 0.08
49 0.07
50 0.08
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.18
55 0.23
56 0.28
57 0.33
58 0.37
59 0.4
60 0.44
61 0.47
62 0.5
63 0.51
64 0.54
65 0.58
66 0.56
67 0.51
68 0.47
69 0.46
70 0.38
71 0.36
72 0.31
73 0.29
74 0.31
75 0.33
76 0.32
77 0.3
78 0.27
79 0.24
80 0.24
81 0.17
82 0.12
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.05
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.2
102 0.2
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.16
107 0.13
108 0.13
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.12
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.15
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.23
123 0.23
124 0.22
125 0.23
126 0.23
127 0.2
128 0.19
129 0.23
130 0.19
131 0.25
132 0.34
133 0.34
134 0.34
135 0.34
136 0.34
137 0.27
138 0.29
139 0.23
140 0.14
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.09
150 0.1
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.17
155 0.19
156 0.22
157 0.25
158 0.28
159 0.29
160 0.35
161 0.35
162 0.42
163 0.47
164 0.45
165 0.46
166 0.53
167 0.51
168 0.5
169 0.48
170 0.41
171 0.37
172 0.4
173 0.41
174 0.4
175 0.45
176 0.46
177 0.48
178 0.5
179 0.5
180 0.54
181 0.54
182 0.56
183 0.57
184 0.58
185 0.66
186 0.7
187 0.77
188 0.79
189 0.78
190 0.77
191 0.75
192 0.75
193 0.72
194 0.74
195 0.74
196 0.73
197 0.74
198 0.69
199 0.67
200 0.62
201 0.61
202 0.57
203 0.49
204 0.49
205 0.42
206 0.37
207 0.32
208 0.3
209 0.23
210 0.17
211 0.13
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.07
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.1
260 0.13
261 0.18
262 0.2
263 0.23
264 0.24
265 0.34
266 0.41
267 0.43
268 0.47
269 0.48
270 0.49
271 0.5
272 0.52
273 0.43
274 0.36
275 0.3
276 0.23
277 0.19
278 0.17
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.19
311 0.25
312 0.31
313 0.41
314 0.5
315 0.54
316 0.61
317 0.67
318 0.71
319 0.75
320 0.8
321 0.8
322 0.81
323 0.82
324 0.8
325 0.77
326 0.72
327 0.65
328 0.6
329 0.54
330 0.49
331 0.43
332 0.37
333 0.3
334 0.24
335 0.2
336 0.13
337 0.08
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.13
350 0.17
351 0.23
352 0.27
353 0.37
354 0.45
355 0.53
356 0.61
357 0.67
358 0.74
359 0.76
360 0.79
361 0.79
362 0.76
363 0.75
364 0.68
365 0.61
366 0.55
367 0.5
368 0.43
369 0.4
370 0.4
371 0.36
372 0.43
373 0.47
374 0.52
375 0.62
376 0.71
377 0.75
378 0.78
379 0.87
380 0.88
381 0.91
382 0.92
383 0.92
384 0.92
385 0.91
386 0.91
387 0.9