Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TJD9

Protein Details
Accession A0A2J6TJD9    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-161LKAGKRKRADKDGDGRKPKEAKRDKKKKSRRDDDEDPDGELVDGKRVKKPKRIDGERKDRDKAKBasic
188-209MDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-128KAGKRKRADKDGDGRKPKEAKRDKKKKSRR
141-167GKRVKKPKRIDGERKDRDKAKERRPAT
178-202ERRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKK
455-458GKKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSDADSQPTTPLPEAGDDLGDPNRPMSEDRDTPPPPAVNPDLDMDNAENDNDDDLSDNESELSEVDEAEFAEFDPTTVALEDRPLVGIDEDIARTLKAGKRKRADKDGDGRKPKEAKRDKKKKSRRDDDEDPDGELVDGKRVKKPKRIDGERKDRDKAKERRPATPENEENLTPEERRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKIRMEQACEADNSAREKGQPAIHKLKMLPEVVALLNRNTVQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDLFSALTRLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKKPEIGIKRTAERLLGEWSRPILKRSDDYKKRKVITKEFDHQAAQLALRPSGISSSQMPSSQRAGLSQRDIERERILAQPIRSNRARMETANTSYTIAPRSNFDASKGLDPASRPIGAGGMEAFRKMTAKQGKKRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.19
4 0.18
5 0.18
6 0.14
7 0.16
8 0.17
9 0.18
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.26
17 0.29
18 0.32
19 0.41
20 0.41
21 0.42
22 0.46
23 0.43
24 0.36
25 0.37
26 0.38
27 0.31
28 0.31
29 0.31
30 0.27
31 0.25
32 0.25
33 0.19
34 0.18
35 0.16
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.06
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.14
85 0.17
86 0.24
87 0.32
88 0.41
89 0.5
90 0.59
91 0.67
92 0.72
93 0.76
94 0.75
95 0.77
96 0.79
97 0.8
98 0.8
99 0.74
100 0.72
101 0.73
102 0.68
103 0.69
104 0.69
105 0.7
106 0.72
107 0.81
108 0.84
109 0.87
110 0.93
111 0.93
112 0.93
113 0.94
114 0.92
115 0.9
116 0.89
117 0.85
118 0.83
119 0.73
120 0.63
121 0.52
122 0.42
123 0.33
124 0.25
125 0.17
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.22
130 0.31
131 0.37
132 0.43
133 0.52
134 0.56
135 0.63
136 0.73
137 0.78
138 0.81
139 0.86
140 0.87
141 0.85
142 0.81
143 0.76
144 0.73
145 0.73
146 0.72
147 0.71
148 0.71
149 0.68
150 0.71
151 0.7
152 0.71
153 0.66
154 0.66
155 0.6
156 0.53
157 0.53
158 0.44
159 0.39
160 0.34
161 0.29
162 0.21
163 0.22
164 0.28
165 0.27
166 0.3
167 0.33
168 0.34
169 0.37
170 0.45
171 0.45
172 0.4
173 0.41
174 0.4
175 0.37
176 0.33
177 0.3
178 0.3
179 0.28
180 0.29
181 0.35
182 0.43
183 0.52
184 0.61
185 0.69
186 0.71
187 0.78
188 0.8
189 0.82
190 0.83
191 0.8
192 0.77
193 0.67
194 0.58
195 0.47
196 0.4
197 0.29
198 0.18
199 0.11
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.05
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.15
223 0.18
224 0.2
225 0.25
226 0.31
227 0.32
228 0.34
229 0.33
230 0.34
231 0.33
232 0.3
233 0.23
234 0.16
235 0.17
236 0.15
237 0.16
238 0.13
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.13
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.08
257 0.09
258 0.07
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.11
265 0.12
266 0.13
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.1
284 0.09
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.1
306 0.15
307 0.2
308 0.28
309 0.31
310 0.32
311 0.35
312 0.39
313 0.47
314 0.5
315 0.54
316 0.55
317 0.56
318 0.59
319 0.58
320 0.54
321 0.45
322 0.37
323 0.29
324 0.28
325 0.27
326 0.23
327 0.21
328 0.22
329 0.27
330 0.27
331 0.27
332 0.24
333 0.25
334 0.31
335 0.38
336 0.47
337 0.52
338 0.6
339 0.67
340 0.72
341 0.73
342 0.75
343 0.76
344 0.75
345 0.75
346 0.74
347 0.74
348 0.69
349 0.67
350 0.6
351 0.51
352 0.44
353 0.36
354 0.27
355 0.22
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.16
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.13
365 0.16
366 0.18
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.26
371 0.27
372 0.24
373 0.25
374 0.28
375 0.3
376 0.33
377 0.35
378 0.36
379 0.4
380 0.42
381 0.42
382 0.4
383 0.36
384 0.34
385 0.32
386 0.34
387 0.32
388 0.32
389 0.36
390 0.39
391 0.45
392 0.45
393 0.45
394 0.43
395 0.44
396 0.45
397 0.4
398 0.43
399 0.42
400 0.43
401 0.42
402 0.4
403 0.35
404 0.32
405 0.33
406 0.29
407 0.24
408 0.21
409 0.22
410 0.27
411 0.31
412 0.3
413 0.3
414 0.33
415 0.33
416 0.37
417 0.35
418 0.31
419 0.28
420 0.29
421 0.31
422 0.29
423 0.27
424 0.22
425 0.21
426 0.21
427 0.19
428 0.19
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.15
433 0.15
434 0.14
435 0.15
436 0.15
437 0.23
438 0.3
439 0.4