Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NUP2

Protein Details
Accession J3NUP2    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-108AKSLKASKRKRPAGETARKPKEGRRDKKRRTADQDDDQDGBasic
168-191MDAATKNPTKRRRKKDEVDLEEQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
72-98LKASKRKRPAGETARKPKEGRRDKKRR
121-143RRNKGRAARTAGESVRRTKPKEK
159-182RRKRALMRAMDAATKNPTKRRRKK
436-443KGKGGRRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDAGSEKAASPPPARDNDEETNSPAAAAAAADNDNDSDVLSDIDEDVFEEEYNPDTARVEERDYEDIAKSLKASKRKRPAGETARKPKEGRRDKKRRTADQDDDQDGGDGSDGEFSGEGRRNKGRAARTAGESVRRTKPKEKSAEPEIDEASLTPEERRKRALMRAMDAATKNPTKRRRKKDEVDLEEQADEEIAELKISMENACVSDNKAREEGKPAVGKLKLLPRVLSMMNRTSIQHAILDPETNFLQSVRFFLEPLNDGSLPAYNVQHDIFSALTRLPIGKEALLSSGIGKVVLFYTKSTRPQPVVKRMAEKLVGEWSRPILKRTDDFRKRSIQTREFDYAAAKNAQELAAYSNSQSSQLPTPSQRGGVSSFEREIQKKLAPENRSSRAQPPGLPQTYTIAPQSNFDVAARAQDYRPIGAGGMEAFRKMTQKGKGGRRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.46
3 0.46
4 0.49
5 0.52
6 0.55
7 0.51
8 0.47
9 0.43
10 0.38
11 0.34
12 0.26
13 0.19
14 0.13
15 0.11
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.1
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.22
49 0.25
50 0.27
51 0.28
52 0.29
53 0.26
54 0.24
55 0.22
56 0.19
57 0.17
58 0.22
59 0.25
60 0.33
61 0.41
62 0.5
63 0.59
64 0.68
65 0.74
66 0.73
67 0.79
68 0.8
69 0.82
70 0.83
71 0.83
72 0.81
73 0.8
74 0.75
75 0.71
76 0.71
77 0.71
78 0.71
79 0.72
80 0.75
81 0.8
82 0.88
83 0.92
84 0.91
85 0.9
86 0.89
87 0.86
88 0.84
89 0.82
90 0.74
91 0.64
92 0.54
93 0.44
94 0.34
95 0.25
96 0.16
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.11
105 0.17
106 0.18
107 0.22
108 0.26
109 0.27
110 0.31
111 0.38
112 0.39
113 0.4
114 0.47
115 0.46
116 0.45
117 0.5
118 0.48
119 0.49
120 0.45
121 0.44
122 0.45
123 0.47
124 0.49
125 0.51
126 0.58
127 0.6
128 0.66
129 0.66
130 0.64
131 0.66
132 0.68
133 0.61
134 0.55
135 0.46
136 0.37
137 0.32
138 0.25
139 0.2
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.15
144 0.19
145 0.21
146 0.24
147 0.25
148 0.29
149 0.35
150 0.41
151 0.4
152 0.4
153 0.43
154 0.4
155 0.41
156 0.37
157 0.31
158 0.28
159 0.27
160 0.27
161 0.3
162 0.39
163 0.47
164 0.57
165 0.66
166 0.72
167 0.79
168 0.84
169 0.88
170 0.88
171 0.84
172 0.8
173 0.72
174 0.62
175 0.52
176 0.43
177 0.31
178 0.2
179 0.13
180 0.07
181 0.06
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.17
199 0.18
200 0.18
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.25
207 0.24
208 0.24
209 0.22
210 0.26
211 0.26
212 0.25
213 0.25
214 0.21
215 0.24
216 0.24
217 0.23
218 0.19
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.07
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.13
288 0.18
289 0.23
290 0.26
291 0.3
292 0.33
293 0.41
294 0.49
295 0.54
296 0.58
297 0.57
298 0.59
299 0.56
300 0.57
301 0.51
302 0.42
303 0.34
304 0.34
305 0.31
306 0.26
307 0.25
308 0.23
309 0.28
310 0.28
311 0.29
312 0.24
313 0.27
314 0.33
315 0.39
316 0.48
317 0.5
318 0.54
319 0.57
320 0.62
321 0.62
322 0.65
323 0.68
324 0.64
325 0.59
326 0.61
327 0.6
328 0.51
329 0.48
330 0.43
331 0.34
332 0.3
333 0.28
334 0.21
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.14
339 0.13
340 0.12
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.16
348 0.15
349 0.18
350 0.2
351 0.25
352 0.26
353 0.31
354 0.31
355 0.33
356 0.3
357 0.28
358 0.28
359 0.29
360 0.29
361 0.28
362 0.27
363 0.3
364 0.34
365 0.34
366 0.34
367 0.33
368 0.34
369 0.34
370 0.41
371 0.44
372 0.44
373 0.5
374 0.56
375 0.57
376 0.59
377 0.59
378 0.56
379 0.57
380 0.56
381 0.51
382 0.5
383 0.55
384 0.52
385 0.49
386 0.44
387 0.4
388 0.39
389 0.37
390 0.32
391 0.27
392 0.25
393 0.25
394 0.28
395 0.25
396 0.24
397 0.21
398 0.22
399 0.16
400 0.22
401 0.22
402 0.21
403 0.2
404 0.24
405 0.26
406 0.24
407 0.25
408 0.2
409 0.18
410 0.16
411 0.17
412 0.13
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.15
418 0.18
419 0.2
420 0.26
421 0.29
422 0.38
423 0.47