Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SIH5

Protein Details
Accession A0A2J6SIH5    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-68SSRASSVKSRGTRTRKRGNLVSENHydrophilic
116-143KDPPRRAAGSRTKRKTHKPANEVRAKRLBasic
536-562HFSTRRQEAKLKKKTARKASEKAQHAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
118-144PPRRAAGSRTKRKTHKPANEVRAKRLK
544-554AKLKKKTARKA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
Amino Acid Sequences MDLEDAEALIEHVIYPDESSASAYETGSEDESSSSHDEQAIIAHSSRASSVKSRGTRTRKRGNLVSENEEISDSGERQSAIGDRASITPSVDHQVFEDAKEWASTFQAPESPGDIKDPPRRAAGSRTKRKTHKPANEVRAKRLKRYYNNDYREILNIDIEDTAAGRIQEDQYPLQESQIGSSIWTSSEKDMFFTALIRLGRDSVRDIAARIRSKSELQVQEYIQLLHQAISERRLHERRLLAPTDMPAAVQISDECNGVLERAGDALAIRQELAEEKIEKIKWGDSWLLTKEVSRFMEKRRKEEGGEEALEEALPAVNLFNLKHWLELSEKIFMNPAAPNEEGNWETLAEAGEKPAIRATAFTDFHSLAVNITKRLVSTTFYCTMSRSRARESNKVKHAEVSPGDVEAAVNILGLKANSNAFWIGSARRCHLKVVDDDAEEEEDEEQEQEDQYMVYNDVEAALSSSIPPRSRSTSRQALSRPSSRSSAHSDLPLSSPSSLDLDISSSDSSVADYPTSTAENSDSSSISSTSSTHFHFSTRRQEAKLKKKTARKASEKAQHAYTEAFDIRASQLEEARLWALLKQDPPFEVEEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.12
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.15
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.13
19 0.15
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.18
24 0.17
25 0.17
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.19
37 0.26
38 0.34
39 0.4
40 0.47
41 0.55
42 0.64
43 0.71
44 0.76
45 0.8
46 0.79
47 0.81
48 0.81
49 0.8
50 0.8
51 0.75
52 0.71
53 0.64
54 0.57
55 0.49
56 0.42
57 0.32
58 0.24
59 0.2
60 0.15
61 0.13
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.16
72 0.18
73 0.16
74 0.14
75 0.13
76 0.15
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.21
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.11
90 0.13
91 0.13
92 0.12
93 0.13
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.2
101 0.22
102 0.27
103 0.35
104 0.38
105 0.38
106 0.4
107 0.42
108 0.41
109 0.48
110 0.51
111 0.54
112 0.6
113 0.66
114 0.71
115 0.76
116 0.84
117 0.85
118 0.85
119 0.84
120 0.83
121 0.85
122 0.87
123 0.89
124 0.82
125 0.8
126 0.79
127 0.72
128 0.7
129 0.69
130 0.68
131 0.67
132 0.73
133 0.75
134 0.75
135 0.78
136 0.74
137 0.67
138 0.59
139 0.53
140 0.45
141 0.35
142 0.25
143 0.2
144 0.15
145 0.13
146 0.12
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.09
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.15
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.16
166 0.15
167 0.11
168 0.12
169 0.12
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.25
196 0.27
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.32
202 0.35
203 0.33
204 0.33
205 0.36
206 0.33
207 0.34
208 0.33
209 0.29
210 0.21
211 0.17
212 0.14
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.15
218 0.17
219 0.18
220 0.25
221 0.27
222 0.28
223 0.31
224 0.35
225 0.35
226 0.39
227 0.38
228 0.32
229 0.3
230 0.29
231 0.26
232 0.21
233 0.16
234 0.11
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.13
265 0.14
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.15
271 0.16
272 0.13
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.16
277 0.16
278 0.15
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.25
284 0.35
285 0.36
286 0.4
287 0.41
288 0.42
289 0.4
290 0.41
291 0.38
292 0.34
293 0.32
294 0.27
295 0.21
296 0.19
297 0.18
298 0.14
299 0.09
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.02
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.16
315 0.17
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.18
320 0.16
321 0.16
322 0.14
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.12
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.16
348 0.17
349 0.18
350 0.2
351 0.19
352 0.2
353 0.2
354 0.17
355 0.1
356 0.14
357 0.14
358 0.12
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.13
363 0.13
364 0.11
365 0.13
366 0.18
367 0.21
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.24
372 0.29
373 0.33
374 0.3
375 0.33
376 0.38
377 0.43
378 0.52
379 0.58
380 0.61
381 0.62
382 0.64
383 0.59
384 0.56
385 0.52
386 0.49
387 0.41
388 0.35
389 0.28
390 0.24
391 0.23
392 0.18
393 0.16
394 0.09
395 0.09
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.12
412 0.17
413 0.2
414 0.21
415 0.27
416 0.28
417 0.29
418 0.31
419 0.32
420 0.3
421 0.35
422 0.36
423 0.31
424 0.32
425 0.3
426 0.28
427 0.23
428 0.2
429 0.12
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.1
453 0.13
454 0.15
455 0.18
456 0.21
457 0.28
458 0.34
459 0.39
460 0.45
461 0.51
462 0.52
463 0.56
464 0.56
465 0.58
466 0.6
467 0.61
468 0.56
469 0.5
470 0.52
471 0.46
472 0.47
473 0.46
474 0.43
475 0.39
476 0.38
477 0.36
478 0.33
479 0.34
480 0.31
481 0.24
482 0.2
483 0.17
484 0.15
485 0.16
486 0.14
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.11
491 0.13
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.09
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.13
511 0.13
512 0.15
513 0.14
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.18
520 0.19
521 0.19
522 0.22
523 0.28
524 0.34
525 0.42
526 0.48
527 0.52
528 0.53
529 0.62
530 0.69
531 0.73
532 0.77
533 0.76
534 0.76
535 0.8
536 0.86
537 0.88
538 0.88
539 0.87
540 0.85
541 0.85
542 0.86
543 0.84
544 0.78
545 0.72
546 0.63
547 0.55
548 0.47
549 0.38
550 0.34
551 0.28
552 0.24
553 0.19
554 0.19
555 0.18
556 0.2
557 0.2
558 0.17
559 0.19
560 0.21
561 0.21
562 0.22
563 0.21
564 0.18
565 0.17
566 0.17
567 0.18
568 0.21
569 0.25
570 0.27
571 0.29
572 0.29
573 0.31