FuNGI

A0A2J6TS94

Protein Details

Accession

A0A2J6TS94

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
8-62	EPPVSKMGPEKHKPRSDKKHKTTHGEKRKRDHGEDGLKAKSKKHKSDKAASQASA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-54	KMGPEKHKPRSDKKHKTTHGEKRKRDHGEDGLKAKSKKHKSD

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 10.333, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025533 DUF4419 IPR000614 FRMsr_CS IPR003018 GAF IPR029016 GAF-like_dom_sf IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex
Pfam	View protein in Pfam PF14388 DUF4419 PF13185 GAF_2 PF17875 RPA43_OB
PROSITE	View protein in PROSITE PS01320 UPF0067
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSIEKAAEPPVSKMGPEKHKPRSDKKHKTTHGEKRKRDHGEDGLKAKSKKHKSDKAASQASALDITAPASPFHIQTASLYLPLAPVSQKYPLEGLCAEHISPLILTYYPPLSGVLLSYSNPRLSEKPFKDDGESVLLRNIDEYAVSWAWVTAEFLLFKPEKGALLEGYINLQNQGHLGIVCWNLFNASIESKRLPSEWKWKDVSDMKNRRNAEQGETYAEEGPGFWVDGEGNKVEGMVKFRVREIESSHDRERGFLSIEGTMLSEGDEEELVESERVGAQTARDTAGRRLGGSKALGATSLGVIVETDMMDVDPTASKVLPTTLLSLQDPSKFMTSTSNSPPRQHPSIQRKRTMAVLIRLRTNKAGANGDAAFQSGKEVLKKNISLWSIPYELPATANEGPPTEPVVIRHSFDDLPNGVEVVSYGNCFVTGLIRAYHQGLHLRLRPEDVWLSILSQLRVYAYRQPNSIPGLSSSHNFNVDLSIDLETDPGTIDSTYLEEKISGLSHTLMSNDADLRHWILPNFSSTTTTDRTVASVVMMGQVRKSTKPDYDSRLRIGLSSVKLLGEKSDWEEILRRVTERVPTFGSKATEWFKFLDPVIKGIILSFDSPDLPQTKEFWGQACHFDGANLGVDRETITGWITAFCFWSDSGDCLHPDFIDGNALHHHRNPIEQPGRGDARSILWDQDRDNWIVTNLIDRKNIFIGGVKCPHILPENIPNGTATALTYVRDYSNRVAYSVTIVAGSMGAVPTAVGYLHDETVLQPWSGWFLLEDGLKAMPPLQQHRVLNENGHETGSEFFCIFLTMNGTLRAIMESGWIKGPPYEDFKHLILLEVHADASKFASNVTKEEAYKQSLPAPSSEVNWAGFYVLDPSTPNQLILGPFHGKVACQTIRFGKGVCGAAAEKMETQLVPDVEAFPGHIACDGDSKSEIVVPILVKGKVMAIIDIDCAEIQGFDEVDKRELEELAELLAHSCNW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.43
3	0.51
4	0.58
5	0.62
6	0.71
7	0.8
8	0.84
9	0.86
10	0.87
11	0.9
12	0.9
13	0.91
14	0.9
15	0.91
16	0.91
17	0.91
18	0.91
19	0.9
20	0.89
21	0.88
22	0.89
23	0.87
24	0.82
25	0.79
26	0.78
27	0.77
28	0.76
29	0.71
30	0.69
31	0.67
32	0.63
33	0.62
34	0.62
35	0.63
36	0.65
37	0.71
38	0.74
39	0.76
40	0.85
41	0.88
42	0.88
43	0.86
44	0.75
45	0.67
46	0.58
47	0.5
48	0.4
49	0.3
50	0.2
51	0.12
52	0.13
53	0.12
54	0.12
55	0.11
56	0.12
57	0.14
58	0.13
59	0.15
60	0.15
61	0.13
62	0.14
63	0.19
64	0.17
65	0.17
66	0.16
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.1
72	0.11
73	0.13
74	0.19
75	0.2
76	0.21
77	0.24
78	0.22
79	0.25
80	0.24
81	0.24
82	0.21
83	0.23
84	0.21
85	0.19
86	0.18
87	0.15
88	0.14
89	0.12
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.11
100	0.11
101	0.11
102	0.11
103	0.12
104	0.16
105	0.18
106	0.19
107	0.2
108	0.23
109	0.24
110	0.3
111	0.4
112	0.4
113	0.44
114	0.48
115	0.49
116	0.5
117	0.48
118	0.44
119	0.41
120	0.38
121	0.31
122	0.29
123	0.27
124	0.23
125	0.21
126	0.19
127	0.11
128	0.1
129	0.1
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.11
138	0.07
139	0.09
140	0.09
141	0.1
142	0.16
143	0.16
144	0.15
145	0.17
146	0.17
147	0.16
148	0.17
149	0.18
150	0.13
151	0.15
152	0.16
153	0.14
154	0.16
155	0.16
156	0.15
157	0.14
158	0.14
159	0.11
160	0.1
161	0.11
162	0.09
163	0.07
164	0.08
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.12
173	0.11
174	0.13
175	0.14
176	0.17
177	0.19
178	0.2
179	0.21
180	0.21
181	0.24
182	0.27
183	0.36
184	0.39
185	0.44
186	0.46
187	0.45
188	0.52
189	0.55
190	0.57
191	0.58
192	0.62
193	0.61
194	0.65
195	0.67
196	0.61
197	0.61
198	0.54
199	0.49
200	0.45
201	0.41
202	0.38
203	0.38
204	0.37
205	0.3
206	0.27
207	0.21
208	0.15
209	0.14
210	0.1
211	0.08
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.1
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.14
224	0.17
225	0.19
226	0.2
227	0.21
228	0.26
229	0.26
230	0.27
231	0.27
232	0.32
233	0.36
234	0.41
235	0.43
236	0.42
237	0.41
238	0.39
239	0.36
240	0.29
241	0.25
242	0.2
243	0.19
244	0.15
245	0.15
246	0.14
247	0.13
248	0.11
249	0.08
250	0.07
251	0.05
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.07
267	0.1
268	0.12
269	0.12
270	0.13
271	0.15
272	0.17
273	0.23
274	0.23
275	0.2
276	0.22
277	0.21
278	0.23
279	0.21
280	0.2
281	0.15
282	0.14
283	0.13
284	0.11
285	0.1
286	0.07
287	0.07
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.12
310	0.12
311	0.14
312	0.15
313	0.17
314	0.18
315	0.18
316	0.18
317	0.16
318	0.16
319	0.15
320	0.15
321	0.19
322	0.2
323	0.23
324	0.3
325	0.38
326	0.38
327	0.42
328	0.46
329	0.46
330	0.48
331	0.49
332	0.5
333	0.53
334	0.62
335	0.66
336	0.67
337	0.63
338	0.59
339	0.58
340	0.53
341	0.46
342	0.43
343	0.43
344	0.39
345	0.43
346	0.43
347	0.41
348	0.36
349	0.33
350	0.27
351	0.23
352	0.24
353	0.18
354	0.2
355	0.19
356	0.19
357	0.17
358	0.15
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.07
363	0.08
364	0.11
365	0.13
366	0.16
367	0.2
368	0.21
369	0.21
370	0.25
371	0.26
372	0.23
373	0.22
374	0.23
375	0.21
376	0.2
377	0.2
378	0.15
379	0.14
380	0.14
381	0.12
382	0.14
383	0.13
384	0.14
385	0.13
386	0.13
387	0.14
388	0.13
389	0.15
390	0.11
391	0.1
392	0.11
393	0.15
394	0.16
395	0.16
396	0.16
397	0.17
398	0.16
399	0.16
400	0.18
401	0.13
402	0.13
403	0.12
404	0.12
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.12
426	0.13
427	0.17
428	0.2
429	0.21
430	0.21
431	0.22
432	0.21
433	0.2
434	0.19
435	0.16
436	0.13
437	0.12
438	0.12
439	0.13
440	0.14
441	0.12
442	0.11
443	0.11
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.17
448	0.21
449	0.23
450	0.23
451	0.24
452	0.26
453	0.28
454	0.27
455	0.18
456	0.14
457	0.16
458	0.16
459	0.16
460	0.15
461	0.14
462	0.14
463	0.14
464	0.12
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.1
507	0.1
508	0.12
509	0.13
510	0.11
511	0.12
512	0.13
513	0.16
514	0.17
515	0.18
516	0.17
517	0.15
518	0.15
519	0.14
520	0.13
521	0.09
522	0.07
523	0.06
524	0.08
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.1
529	0.12
530	0.12
531	0.15
532	0.16
533	0.18
534	0.23
535	0.28
536	0.33
537	0.39
538	0.41
539	0.4
540	0.4
541	0.36
542	0.31
543	0.28
544	0.26
545	0.19
546	0.17
547	0.15
548	0.13
549	0.13
550	0.13
551	0.12
552	0.08
553	0.08
554	0.1
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.14
559	0.14
560	0.17
561	0.17
562	0.15
563	0.14
564	0.16
565	0.22
566	0.2
567	0.22
568	0.22
569	0.22
570	0.23
571	0.25
572	0.25
573	0.19
574	0.22
575	0.23
576	0.2
577	0.21
578	0.21
579	0.19
580	0.19
581	0.19
582	0.21
583	0.18
584	0.18
585	0.17
586	0.15
587	0.14
588	0.12
589	0.13
590	0.08
591	0.08
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.1
597	0.1
598	0.11
599	0.12
600	0.13
601	0.16
602	0.19
603	0.2
604	0.19
605	0.21
606	0.21
607	0.23
608	0.23
609	0.22
610	0.18
611	0.17
612	0.16
613	0.13
614	0.14
615	0.11
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.09
620	0.08
621	0.08
622	0.05
623	0.06
624	0.06
625	0.07
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.08
631	0.08
632	0.07
633	0.1
634	0.1
635	0.1
636	0.12
637	0.13
638	0.13
639	0.13
640	0.14
641	0.11
642	0.11
643	0.11
644	0.09
645	0.12
646	0.11
647	0.11
648	0.15
649	0.17
650	0.17
651	0.19
652	0.22
653	0.18
654	0.21
655	0.22
656	0.28
657	0.31
658	0.33
659	0.32
660	0.35
661	0.38
662	0.34
663	0.33
664	0.24
665	0.21
666	0.22
667	0.21
668	0.18
669	0.17
670	0.18
671	0.18
672	0.24
673	0.25
674	0.23
675	0.23
676	0.2
677	0.19
678	0.19
679	0.18
680	0.19
681	0.2
682	0.22
683	0.24
684	0.24
685	0.26
686	0.25
687	0.25
688	0.18
689	0.19
690	0.19
691	0.22
692	0.26
693	0.25
694	0.25
695	0.24
696	0.26
697	0.23
698	0.22
699	0.2
700	0.25
701	0.29
702	0.29
703	0.29
704	0.27
705	0.25
706	0.24
707	0.2
708	0.12
709	0.08
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.1
714	0.11
715	0.13
716	0.15
717	0.16
718	0.22
719	0.22
720	0.22
721	0.21
722	0.2
723	0.22
724	0.2
725	0.17
726	0.1
727	0.09
728	0.09
729	0.08
730	0.08
731	0.05
732	0.04
733	0.04
734	0.03
735	0.03
736	0.03
737	0.04
738	0.03
739	0.04
740	0.06
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.09
745	0.09
746	0.12
747	0.13
748	0.11
749	0.09
750	0.09
751	0.12
752	0.12
753	0.11
754	0.08
755	0.08
756	0.1
757	0.11
758	0.11
759	0.09
760	0.09
761	0.09
762	0.09
763	0.09
764	0.09
765	0.13
766	0.19
767	0.23
768	0.3
769	0.31
770	0.35
771	0.38
772	0.38
773	0.37
774	0.35
775	0.34
776	0.28
777	0.27
778	0.23
779	0.19
780	0.2
781	0.18
782	0.15
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.11
787	0.1
788	0.08
789	0.1
790	0.11
791	0.12
792	0.13
793	0.13
794	0.12
795	0.13
796	0.13
797	0.09
798	0.08
799	0.11
800	0.11
801	0.12
802	0.14
803	0.14
804	0.14
805	0.15
806	0.17
807	0.17
808	0.23
809	0.24
810	0.26
811	0.29
812	0.29
813	0.32
814	0.3
815	0.29
816	0.23
817	0.22
818	0.2
819	0.17
820	0.16
821	0.12
822	0.12
823	0.1
824	0.11
825	0.1
826	0.09
827	0.09
828	0.15
829	0.16
830	0.18
831	0.23
832	0.25
833	0.25
834	0.31
835	0.35
836	0.35
837	0.36
838	0.35
839	0.36
840	0.36
841	0.36
842	0.32
843	0.33
844	0.28
845	0.28
846	0.29
847	0.25
848	0.22
849	0.21
850	0.2
851	0.15
852	0.14
853	0.12
854	0.12
855	0.1
856	0.1
857	0.11
858	0.13
859	0.19
860	0.19
861	0.19
862	0.16
863	0.18
864	0.19
865	0.2
866	0.23
867	0.2
868	0.2
869	0.22
870	0.22
871	0.2
872	0.21
873	0.27
874	0.26
875	0.24
876	0.28
877	0.32
878	0.36
879	0.37
880	0.35
881	0.31
882	0.33
883	0.34
884	0.3
885	0.26
886	0.22
887	0.24
888	0.24
889	0.21
890	0.16
891	0.15
892	0.16
893	0.13
894	0.14
895	0.17
896	0.16
897	0.15
898	0.16
899	0.16
900	0.15
901	0.15
902	0.14
903	0.11
904	0.11
905	0.1
906	0.11
907	0.1
908	0.1
909	0.15
910	0.15
911	0.16
912	0.17
913	0.17
914	0.16
915	0.17
916	0.17
917	0.13
918	0.15
919	0.13
920	0.17
921	0.21
922	0.2
923	0.18
924	0.18
925	0.19
926	0.19
927	0.19
928	0.15
929	0.12
930	0.13
931	0.14
932	0.14
933	0.14
934	0.1
935	0.1
936	0.09
937	0.08
938	0.08
939	0.08
940	0.08
941	0.08
942	0.13
943	0.15
944	0.17
945	0.17
946	0.18
947	0.18
948	0.18
949	0.19
950	0.16
951	0.14
952	0.13
953	0.13
954	0.11
955	0.11

A0A2J6TS94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer