FuNGI

A0A2J6T6Y7

Protein Details

Accession

A0A2J6T6Y7

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
119-138	KTTESRFKPKNIRRDARELE	Hydrophilic
440-460	AAKAKKERKARTFIKKKDTKP	Basic
532-553	LYNPKHPKPKTKAEIRAENEKV	Hydrophilic
590-610	LGPDGKPKKEEEKRKRDEVVH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-22	KAARGAGRGRGRGRGKAPA
115-196	GSRVKTTESRFKPKNIRRDARELEDMRKKEKARLDALAAEEASREAFKARAMGRGRGMRGRGDAMGRGAGKGAGKGAGRGRG
305-322	PNGRGKSTNKRGLKPVRL
442-456	KAKKERKARTFIKKK
595-604	KPKKEEEKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAARGAGRGRGRGRGKAPAPPAAEQPAVSQPNPQNDMGSQSAMAPSSPSEPPAPKMTTPQNELLDDTGPSPNSSPATVWTETPAPTPIRPSTLRPEPPPILPPTRGGIASRGSRVKTTESRFKPKNIRRDARELEDMRKKEKARLDALAAEEASREAFKARAMGRGRGMRGRGDAMGRGAGKGAGKGAGRGRGGTASGIFGVVPEALQKNPEFLASKASGAGGSSRSGGSGPGGPKTFKGEGAGASRGDYTSSGMALSKDFIPDPQYPDEDLDAPRVDIEHINLVSDDSDDDVIFTGSRKVPNGRGKSTNKRGLKPVRLHREEHKERLTLVNTEPAIKIQSDSDEEFPAIDELRSSRAPAKEKEFTGTYEDFEANTRIKVEPGLELTFNGTRPPPATSTDPQRQVKDRTSSPESKRKTKDQLANSAIDLGGPEDDAAAKAKKERKARTFIKKKDTKPVIQTEEDRAEYERHLEDVAILANELGGLQGNLGAQPQDAEGDVAMDGGVNQYRDNKAGRLYLFQFPPVLPELYNPKHPKPKTKAEIRAENEKVKAEQDVQMGGMSAKAKGKMKDATVDATAIKVEEEVVLGPDGKPKKEEEKRKRDEVVHEEGWIGKLVVRESGRVELCWGGTNLLVGRGVDAGFLTTGVMVDMIEKGPPGGGAPEGKAMSMGQVMGKFVVTPDWEKMV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.64
3	0.6
4	0.61
5	0.57
6	0.58
7	0.6
8	0.58
9	0.57
10	0.52
11	0.52
12	0.47
13	0.45
14	0.36
15	0.35
16	0.36
17	0.36
18	0.33
19	0.37
20	0.37
21	0.44
22	0.48
23	0.45
24	0.38
25	0.35
26	0.4
27	0.34
28	0.3
29	0.22
30	0.19
31	0.2
32	0.17
33	0.17
34	0.12
35	0.11
36	0.14
37	0.15
38	0.16
39	0.2
40	0.23
41	0.26
42	0.32
43	0.35
44	0.33
45	0.4
46	0.47
47	0.49
48	0.51
49	0.54
50	0.51
51	0.48
52	0.48
53	0.42
54	0.34
55	0.27
56	0.24
57	0.2
58	0.17
59	0.17
60	0.17
61	0.18
62	0.18
63	0.19
64	0.17
65	0.18
66	0.24
67	0.24
68	0.23
69	0.23
70	0.25
71	0.24
72	0.25
73	0.25
74	0.22
75	0.23
76	0.28
77	0.27
78	0.3
79	0.32
80	0.35
81	0.4
82	0.47
83	0.52
84	0.51
85	0.57
86	0.54
87	0.55
88	0.55
89	0.52
90	0.48
91	0.43
92	0.42
93	0.36
94	0.36
95	0.33
96	0.29
97	0.26
98	0.26
99	0.28
100	0.31
101	0.33
102	0.32
103	0.33
104	0.34
105	0.38
106	0.4
107	0.44
108	0.49
109	0.52
110	0.61
111	0.63
112	0.7
113	0.74
114	0.74
115	0.77
116	0.77
117	0.79
118	0.75
119	0.81
120	0.78
121	0.73
122	0.75
123	0.67
124	0.65
125	0.64
126	0.6
127	0.54
128	0.55
129	0.5
130	0.48
131	0.51
132	0.5
133	0.46
134	0.47
135	0.47
136	0.43
137	0.44
138	0.39
139	0.32
140	0.25
141	0.2
142	0.16
143	0.13
144	0.09
145	0.08
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.14
150	0.14
151	0.22
152	0.25
153	0.29
154	0.34
155	0.39
156	0.42
157	0.4
158	0.41
159	0.36
160	0.35
161	0.33
162	0.29
163	0.25
164	0.23
165	0.19
166	0.21
167	0.19
168	0.17
169	0.15
170	0.14
171	0.13
172	0.12
173	0.11
174	0.11
175	0.11
176	0.14
177	0.17
178	0.2
179	0.2
180	0.2
181	0.21
182	0.18
183	0.19
184	0.16
185	0.14
186	0.09
187	0.09
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.07
196	0.07
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.11
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.18
205	0.17
206	0.17
207	0.16
208	0.16
209	0.13
210	0.12
211	0.13
212	0.08
213	0.08
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.12
221	0.12
222	0.15
223	0.16
224	0.17
225	0.17
226	0.23
227	0.22
228	0.19
229	0.2
230	0.17
231	0.18
232	0.21
233	0.23
234	0.17
235	0.17
236	0.16
237	0.14
238	0.13
239	0.11
240	0.09
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.12
253	0.14
254	0.18
255	0.19
256	0.2
257	0.2
258	0.21
259	0.21
260	0.19
261	0.17
262	0.16
263	0.13
264	0.12
265	0.11
266	0.1
267	0.1
268	0.09
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.08
277	0.08
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.08
287	0.09
288	0.1
289	0.12
290	0.14
291	0.23
292	0.31
293	0.36
294	0.38
295	0.45
296	0.51
297	0.6
298	0.66
299	0.67
300	0.64
301	0.61
302	0.65
303	0.65
304	0.66
305	0.65
306	0.65
307	0.66
308	0.65
309	0.65
310	0.64
311	0.66
312	0.63
313	0.61
314	0.55
315	0.45
316	0.42
317	0.44
318	0.38
319	0.29
320	0.24
321	0.22
322	0.19
323	0.2
324	0.19
325	0.15
326	0.14
327	0.12
328	0.12
329	0.07
330	0.09
331	0.09
332	0.11
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.13
347	0.17
348	0.22
349	0.24
350	0.3
351	0.32
352	0.32
353	0.34
354	0.31
355	0.28
356	0.29
357	0.26
358	0.21
359	0.18
360	0.18
361	0.15
362	0.15
363	0.16
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.1
381	0.1
382	0.1
383	0.12
384	0.12
385	0.14
386	0.19
387	0.22
388	0.29
389	0.36
390	0.43
391	0.44
392	0.46
393	0.48
394	0.48
395	0.51
396	0.48
397	0.44
398	0.43
399	0.47
400	0.52
401	0.54
402	0.58
403	0.57
404	0.6
405	0.63
406	0.63
407	0.65
408	0.66
409	0.67
410	0.64
411	0.69
412	0.63
413	0.59
414	0.51
415	0.43
416	0.34
417	0.25
418	0.19
419	0.09
420	0.06
421	0.04
422	0.04
423	0.03
424	0.04
425	0.04
426	0.06
427	0.07
428	0.07
429	0.13
430	0.2
431	0.26
432	0.35
433	0.44
434	0.49
435	0.58
436	0.67
437	0.73
438	0.77
439	0.79
440	0.81
441	0.81
442	0.78
443	0.79
444	0.76
445	0.71
446	0.68
447	0.69
448	0.63
449	0.58
450	0.57
451	0.52
452	0.49
453	0.43
454	0.36
455	0.29
456	0.25
457	0.22
458	0.22
459	0.17
460	0.14
461	0.13
462	0.12
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.07
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.04
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.03
476	0.04
477	0.04
478	0.04
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.05
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.11
499	0.12
500	0.15
501	0.17
502	0.18
503	0.19
504	0.24
505	0.24
506	0.26
507	0.29
508	0.33
509	0.32
510	0.31
511	0.29
512	0.24
513	0.26
514	0.23
515	0.2
516	0.14
517	0.16
518	0.24
519	0.25
520	0.35
521	0.37
522	0.42
523	0.51
524	0.55
525	0.62
526	0.62
527	0.7
528	0.7
529	0.76
530	0.79
531	0.78
532	0.84
533	0.78
534	0.8
535	0.74
536	0.69
537	0.61
538	0.53
539	0.45
540	0.36
541	0.34
542	0.26
543	0.26
544	0.23
545	0.21
546	0.19
547	0.18
548	0.18
549	0.15
550	0.14
551	0.11
552	0.11
553	0.13
554	0.17
555	0.22
556	0.24
557	0.29
558	0.32
559	0.34
560	0.38
561	0.37
562	0.36
563	0.32
564	0.32
565	0.26
566	0.22
567	0.2
568	0.14
569	0.11
570	0.08
571	0.07
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.07
576	0.08
577	0.08
578	0.09
579	0.15
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.24
584	0.34
585	0.44
586	0.55
587	0.59
588	0.67
589	0.74
590	0.8
591	0.83
592	0.78
593	0.78
594	0.73
595	0.71
596	0.61
597	0.54
598	0.46
599	0.4
600	0.35
601	0.26
602	0.19
603	0.13
604	0.14
605	0.14
606	0.19
607	0.19
608	0.2
609	0.22
610	0.28
611	0.27
612	0.25
613	0.27
614	0.23
615	0.23
616	0.24
617	0.22
618	0.16
619	0.15
620	0.16
621	0.15
622	0.14
623	0.14
624	0.11
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.04
639	0.05
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.08
648	0.08
649	0.11
650	0.13
651	0.14
652	0.19
653	0.19
654	0.19
655	0.19
656	0.17
657	0.16
658	0.15
659	0.14
660	0.12
661	0.13
662	0.14
663	0.14
664	0.14
665	0.12
666	0.11
667	0.14
668	0.15
669	0.17

A0A2J6T6Y7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer