Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6TLF1

Protein Details
Accession A0A2J6TLF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-51DNILDSQRPRKRVKQDPQALKLQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
544-594GNARGGRGNNQRGGNQRGGGQQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPG
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 12, nucl 9.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADSLVTTLENIRLSASASDNTADDWIDNILDSQRPRKRVKQDPQALKLQLEEKYLTPSTSFSPEWLNKLQQRWEAPTDYTTLFKIAPTQTRTITRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSFLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGVEAAAALEEQAIRSEAKEQGGKSRLERVINFSGEGGLLEVPPGFERGLDFGKKRKDESDVKEAEELENVLDEEPEDELTQDGAKENGANGADSGDASEEDGEDDIDSLLPVEFPALEPHGVLASSSAKRGGREWAHMVDVKRDITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQVFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKRKDIYVISTPKRPVPLEHYLWADKGIHKIVDSEKRFIEKGWKDANDILSGRDKQKTLPAPEANARGGGNARGGRGNNQRGGNQRGGGQQRGGAQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPGGRTSAAQDKTLWVHLVQYLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMIIEKSIARLKPEDRVLPQIVRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEVVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVAPGGGEAPPVTELRQMILGDPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKVSEADLAKIKREACDTCDNDLDACHQAAQNYKQLTLDLHLGLLATPVGRRMFSPKRLVVYTRDGIRTPGILLREGATSGPAPTVHVLEIKTRRDQRDSTDLLPYLPKFRGLFTRLPLQHKKSIVTKALHIPVSDIVCVTQTVFKGVIPEIFTGGEEHQKARDQLWKVCQSWTSDEWNEMDMSRVKDLQLRDLIAGRLEEMKTAQKVECLKCPQFVKHFAMCHDQWLIKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRLQVLQDLDFIDDSSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELVLDNVLAAYDPAEIVALLSAFVFQEKTDMVPNLTGNLEKGMKAIIEISEKVNERQTYHQVILSSDDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPELFTKMQTCQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.18
4 0.16
5 0.16
6 0.17
7 0.16
8 0.17
9 0.16
10 0.14
11 0.11
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.15
19 0.19
20 0.28
21 0.34
22 0.42
23 0.49
24 0.57
25 0.65
26 0.72
27 0.79
28 0.81
29 0.84
30 0.87
31 0.86
32 0.85
33 0.78
34 0.67
35 0.61
36 0.54
37 0.47
38 0.4
39 0.36
40 0.28
41 0.32
42 0.32
43 0.29
44 0.25
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.26
49 0.21
50 0.29
51 0.31
52 0.36
53 0.4
54 0.45
55 0.45
56 0.51
57 0.56
58 0.54
59 0.56
60 0.57
61 0.57
62 0.52
63 0.49
64 0.44
65 0.41
66 0.35
67 0.32
68 0.26
69 0.22
70 0.19
71 0.17
72 0.22
73 0.24
74 0.3
75 0.33
76 0.37
77 0.4
78 0.47
79 0.49
80 0.5
81 0.5
82 0.48
83 0.47
84 0.45
85 0.46
86 0.41
87 0.42
88 0.4
89 0.38
90 0.32
91 0.31
92 0.33
93 0.28
94 0.26
95 0.24
96 0.21
97 0.17
98 0.19
99 0.2
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.21
111 0.21
112 0.27
113 0.28
114 0.33
115 0.4
116 0.43
117 0.49
118 0.57
119 0.61
120 0.59
121 0.6
122 0.61
123 0.54
124 0.51
125 0.49
126 0.38
127 0.32
128 0.27
129 0.24
130 0.17
131 0.14
132 0.14
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.12
156 0.15
157 0.19
158 0.23
159 0.23
160 0.31
161 0.36
162 0.38
163 0.36
164 0.43
165 0.43
166 0.44
167 0.45
168 0.43
169 0.45
170 0.43
171 0.42
172 0.32
173 0.28
174 0.23
175 0.21
176 0.15
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.11
188 0.17
189 0.21
190 0.23
191 0.29
192 0.39
193 0.42
194 0.44
195 0.43
196 0.46
197 0.51
198 0.55
199 0.59
200 0.53
201 0.52
202 0.52
203 0.49
204 0.41
205 0.33
206 0.26
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.17
268 0.18
269 0.19
270 0.21
271 0.28
272 0.26
273 0.3
274 0.34
275 0.32
276 0.34
277 0.37
278 0.37
279 0.33
280 0.32
281 0.29
282 0.25
283 0.24
284 0.23
285 0.23
286 0.29
287 0.24
288 0.22
289 0.24
290 0.23
291 0.26
292 0.25
293 0.23
294 0.17
295 0.23
296 0.23
297 0.2
298 0.21
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.14
316 0.15
317 0.14
318 0.1
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.1
348 0.11
349 0.18
350 0.19
351 0.21
352 0.23
353 0.26
354 0.26
355 0.3
356 0.38
357 0.38
358 0.47
359 0.47
360 0.52
361 0.53
362 0.55
363 0.61
364 0.52
365 0.45
366 0.42
367 0.41
368 0.34
369 0.3
370 0.29
371 0.17
372 0.17
373 0.15
374 0.08
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.07
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.16
459 0.21
460 0.26
461 0.28
462 0.32
463 0.36
464 0.37
465 0.4
466 0.37
467 0.38
468 0.41
469 0.48
470 0.46
471 0.46
472 0.45
473 0.43
474 0.44
475 0.38
476 0.31
477 0.3
478 0.35
479 0.33
480 0.34
481 0.36
482 0.33
483 0.32
484 0.31
485 0.25
486 0.19
487 0.18
488 0.17
489 0.13
490 0.13
491 0.15
492 0.2
493 0.28
494 0.29
495 0.29
496 0.28
497 0.3
498 0.31
499 0.29
500 0.33
501 0.26
502 0.31
503 0.35
504 0.34
505 0.34
506 0.37
507 0.37
508 0.31
509 0.28
510 0.23
511 0.21
512 0.23
513 0.23
514 0.24
515 0.22
516 0.2
517 0.27
518 0.32
519 0.3
520 0.36
521 0.35
522 0.35
523 0.38
524 0.4
525 0.34
526 0.28
527 0.25
528 0.17
529 0.17
530 0.14
531 0.14
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.14
536 0.19
537 0.27
538 0.3
539 0.32
540 0.32
541 0.35
542 0.38
543 0.42
544 0.38
545 0.31
546 0.29
547 0.3
548 0.31
549 0.29
550 0.24
551 0.22
552 0.23
553 0.27
554 0.26
555 0.24
556 0.22
557 0.24
558 0.27
559 0.27
560 0.25
561 0.26
562 0.27
563 0.29
564 0.3
565 0.34
566 0.34
567 0.37
568 0.37
569 0.35
570 0.4
571 0.36
572 0.36
573 0.31
574 0.28
575 0.25
576 0.3
577 0.28
578 0.21
579 0.21
580 0.2
581 0.19
582 0.19
583 0.18
584 0.14
585 0.22
586 0.22
587 0.22
588 0.21
589 0.21
590 0.21
591 0.22
592 0.19
593 0.1
594 0.1
595 0.11
596 0.16
597 0.15
598 0.17
599 0.18
600 0.18
601 0.18
602 0.18
603 0.17
604 0.15
605 0.17
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.14
612 0.18
613 0.17
614 0.24
615 0.24
616 0.26
617 0.27
618 0.32
619 0.34
620 0.34
621 0.38
622 0.32
623 0.31
624 0.29
625 0.28
626 0.23
627 0.19
628 0.13
629 0.08
630 0.06
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.14
635 0.14
636 0.13
637 0.16
638 0.16
639 0.12
640 0.15
641 0.15
642 0.12
643 0.13
644 0.12
645 0.1
646 0.14
647 0.14
648 0.12
649 0.14
650 0.14
651 0.19
652 0.22
653 0.24
654 0.22
655 0.27
656 0.27
657 0.25
658 0.29
659 0.28
660 0.26
661 0.24
662 0.23
663 0.19
664 0.18
665 0.19
666 0.15
667 0.1
668 0.1
669 0.08
670 0.08
671 0.07
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.04
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.05
690 0.05
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.04
695 0.05
696 0.04
697 0.04
698 0.04
699 0.04
700 0.06
701 0.05
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.06
711 0.06
712 0.07
713 0.07
714 0.07
715 0.08
716 0.1
717 0.13
718 0.19
719 0.23
720 0.28
721 0.28
722 0.29
723 0.34
724 0.36
725 0.38
726 0.41
727 0.41
728 0.36
729 0.41
730 0.4
731 0.34
732 0.29
733 0.25
734 0.19
735 0.15
736 0.15
737 0.09
738 0.1
739 0.1
740 0.1
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.12
745 0.12
746 0.12
747 0.12
748 0.12
749 0.11
750 0.09
751 0.09
752 0.08
753 0.07
754 0.06
755 0.05
756 0.04
757 0.03
758 0.02
759 0.02
760 0.03
761 0.03
762 0.03
763 0.02
764 0.03
765 0.05
766 0.05
767 0.06
768 0.07
769 0.08
770 0.08
771 0.11
772 0.1
773 0.1
774 0.14
775 0.14
776 0.14
777 0.15
778 0.16
779 0.17
780 0.19
781 0.2
782 0.19
783 0.24
784 0.29
785 0.32
786 0.37
787 0.36
788 0.38
789 0.38
790 0.36
791 0.32
792 0.25
793 0.22
794 0.15
795 0.13
796 0.09
797 0.07
798 0.06
799 0.05
800 0.06
801 0.06
802 0.07
803 0.09
804 0.11
805 0.13
806 0.14
807 0.14
808 0.14
809 0.15
810 0.17
811 0.17
812 0.19
813 0.19
814 0.23
815 0.25
816 0.25
817 0.25
818 0.26
819 0.26
820 0.24
821 0.22
822 0.19
823 0.17
824 0.18
825 0.17
826 0.16
827 0.15
828 0.13
829 0.13
830 0.16
831 0.15
832 0.15
833 0.2
834 0.18
835 0.18
836 0.21
837 0.21
838 0.18
839 0.21
840 0.21
841 0.22
842 0.31
843 0.32
844 0.32
845 0.33
846 0.32
847 0.28
848 0.27
849 0.24
850 0.16
851 0.13
852 0.12
853 0.11
854 0.12
855 0.16
856 0.19
857 0.22
858 0.21
859 0.22
860 0.21
861 0.21
862 0.2
863 0.18
864 0.17
865 0.12
866 0.11
867 0.1
868 0.1
869 0.09
870 0.09
871 0.07
872 0.04
873 0.04
874 0.07
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.17
879 0.24
880 0.3
881 0.38
882 0.38
883 0.42
884 0.44
885 0.46
886 0.42
887 0.42
888 0.4
889 0.38
890 0.37
891 0.33
892 0.32
893 0.31
894 0.26
895 0.2
896 0.18
897 0.15
898 0.14
899 0.14
900 0.13
901 0.13
902 0.13
903 0.11
904 0.1
905 0.09
906 0.09
907 0.09
908 0.08
909 0.08
910 0.09
911 0.1
912 0.09
913 0.11
914 0.12
915 0.18
916 0.25
917 0.27
918 0.34
919 0.4
920 0.43
921 0.46
922 0.48
923 0.47
924 0.5
925 0.51
926 0.45
927 0.43
928 0.4
929 0.36
930 0.37
931 0.32
932 0.27
933 0.23
934 0.24
935 0.19
936 0.21
937 0.27
938 0.28
939 0.32
940 0.31
941 0.4
942 0.41
943 0.49
944 0.55
945 0.53
946 0.55
947 0.53
948 0.54
949 0.5
950 0.53
951 0.52
952 0.46
953 0.45
954 0.46
955 0.49
956 0.46
957 0.39
958 0.33
959 0.3
960 0.29
961 0.25
962 0.17
963 0.12
964 0.11
965 0.11
966 0.11
967 0.1
968 0.09
969 0.11
970 0.11
971 0.11
972 0.13
973 0.14
974 0.15
975 0.14
976 0.15
977 0.14
978 0.14
979 0.14
980 0.13
981 0.14
982 0.16
983 0.16
984 0.16
985 0.18
986 0.21
987 0.22
988 0.23
989 0.29
990 0.28
991 0.33
992 0.41
993 0.46
994 0.44
995 0.46
996 0.46
997 0.43
998 0.44
999 0.41
1000 0.39
1001 0.32
1002 0.33
1003 0.31
1004 0.29
1005 0.26
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.18
1009 0.19
1010 0.19
1011 0.19
1012 0.18
1013 0.22
1014 0.23
1015 0.26
1016 0.26
1017 0.25
1018 0.24
1019 0.26
1020 0.26
1021 0.23
1022 0.22
1023 0.16
1024 0.16
1025 0.15
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.18
1029 0.18
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.21
1033 0.29
1034 0.31
1035 0.38
1036 0.41
1037 0.42
1038 0.46
1039 0.49
1040 0.51
1041 0.5
1042 0.54
1043 0.52
1044 0.5
1045 0.5
1046 0.47
1047 0.51
1048 0.45
1049 0.41
1050 0.38
1051 0.33
1052 0.28
1053 0.3
1054 0.29
1055 0.22
1056 0.25
1057 0.26
1058 0.29
1059 0.29
1060 0.3
1061 0.26
1062 0.26
1063 0.26
1064 0.25
1065 0.26
1066 0.22
1067 0.26
1068 0.25
1069 0.27
1070 0.25
1071 0.25
1072 0.24
1073 0.2
1074 0.19
1075 0.19
1076 0.23
1077 0.21
1078 0.23
1079 0.23
1080 0.24
1081 0.23
1082 0.24
1083 0.21
1084 0.16
1085 0.19
1086 0.17
1087 0.18
1088 0.17
1089 0.16
1090 0.13
1091 0.11
1092 0.12
1093 0.13
1094 0.14
1095 0.14
1096 0.16
1097 0.2
1098 0.25
1099 0.31
1100 0.32
1101 0.35
1102 0.33
1103 0.34
1104 0.36
1105 0.34
1106 0.3
1107 0.25
1108 0.24
1109 0.17
1110 0.17
1111 0.16
1112 0.13
1113 0.11
1114 0.09
1115 0.07
1116 0.07
1117 0.07
1118 0.06
1119 0.05
1120 0.04
1121 0.04
1122 0.04
1123 0.04
1124 0.03
1125 0.04
1126 0.04
1127 0.04
1128 0.04
1129 0.04
1130 0.04
1131 0.04
1132 0.05
1133 0.04
1134 0.04
1135 0.04
1136 0.05
1137 0.05
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.05
1141 0.07
1142 0.08
1143 0.09
1144 0.14
1145 0.15
1146 0.16
1147 0.18
1148 0.19
1149 0.19
1150 0.2
1151 0.19
1152 0.15
1153 0.18
1154 0.18
1155 0.15
1156 0.15
1157 0.14
1158 0.13
1159 0.13
1160 0.14
1161 0.12
1162 0.15
1163 0.16
1164 0.18
1165 0.23
1166 0.25
1167 0.27
1168 0.33
1169 0.32
1170 0.32
1171 0.37
1172 0.42
1173 0.43
1174 0.42
1175 0.43
1176 0.37
1177 0.35
1178 0.36
1179 0.32
1180 0.26
1181 0.2
1182 0.19
1183 0.17
1184 0.18
1185 0.18
1186 0.14
1187 0.17
1188 0.19
1189 0.2
1190 0.2
1191 0.21
1192 0.2
1193 0.2
1194 0.26
1195 0.22
1196 0.23
1197 0.21
1198 0.23
1199 0.21
1200 0.21
1201 0.2
1202 0.14
1203 0.13
1204 0.1
1205 0.12
1206 0.16
1207 0.2
1208 0.2
1209 0.25
1210 0.26
1211 0.27
1212 0.29
1213 0.27
1214 0.22
1215 0.21
1216 0.19
1217 0.15
1218 0.15
1219 0.14
1220 0.12
1221 0.14
1222 0.11
1223 0.09
1224 0.1
1225 0.1
1226 0.11
1227 0.16
1228 0.17
1229 0.19
1230 0.24
1231 0.29
1232 0.35
1233 0.38
1234 0.38
1235 0.36
1236 0.39
1237 0.43
1238 0.44
1239 0.42
1240 0.37
1241 0.36
1242 0.38
1243 0.41
1244 0.37
1245 0.29
1246 0.25
1247 0.27
1248 0.25
1249 0.24
1250 0.22
1251 0.19
1252 0.25
1253 0.26
1254 0.26
1255 0.3
1256 0.37
1257 0.43
1258 0.44
1259 0.46
1260 0.4
1261 0.39
1262 0.4
1263 0.34
1264 0.28