Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PIP1

Protein Details
Accession J3PIP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-191GKHRVPEAENPRPRKQRRIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-54KRPAKK
159-191KPRDERVPRAAESGKHRVPEAENPRPRKQRRIR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
Amino Acid Sequences MTEVHERTKAQLERARERMKHWADKRRGPLPVLTEGQLVMLNARHVKTKRPAKKLDAKILGPFRVAKVISPTAVRLTLPKAWRIHDAFHVLREAPPVETEYGVQEIEDSMVNPRGRVLYRVRWEGYPKEEDKTWEPWDNFVGDGAKAEVISLHQRHPDKPRDERVPRAAESGKHRVPEAENPRPRKQRRIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.67
3 0.59
4 0.6
5 0.63
6 0.66
7 0.68
8 0.68
9 0.69
10 0.69
11 0.76
12 0.8
13 0.76
14 0.71
15 0.63
16 0.59
17 0.52
18 0.5
19 0.44
20 0.37
21 0.31
22 0.26
23 0.25
24 0.21
25 0.16
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.19
32 0.19
33 0.26
34 0.35
35 0.45
36 0.53
37 0.59
38 0.66
39 0.68
40 0.78
41 0.79
42 0.79
43 0.74
44 0.66
45 0.64
46 0.62
47 0.53
48 0.44
49 0.37
50 0.27
51 0.25
52 0.23
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.16
61 0.15
62 0.11
63 0.13
64 0.17
65 0.18
66 0.22
67 0.23
68 0.24
69 0.29
70 0.29
71 0.28
72 0.26
73 0.31
74 0.26
75 0.25
76 0.24
77 0.19
78 0.18
79 0.17
80 0.15
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.18
104 0.21
105 0.24
106 0.29
107 0.34
108 0.35
109 0.35
110 0.39
111 0.39
112 0.38
113 0.36
114 0.33
115 0.31
116 0.31
117 0.32
118 0.32
119 0.34
120 0.34
121 0.34
122 0.33
123 0.32
124 0.33
125 0.3
126 0.26
127 0.22
128 0.18
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.14
138 0.16
139 0.18
140 0.24
141 0.27
142 0.33
143 0.41
144 0.49
145 0.49
146 0.57
147 0.63
148 0.67
149 0.71
150 0.75
151 0.75
152 0.72
153 0.65
154 0.63
155 0.57
156 0.52
157 0.54
158 0.55
159 0.5
160 0.45
161 0.44
162 0.41
163 0.42
164 0.47
165 0.49
166 0.5
167 0.55
168 0.61
169 0.71
170 0.78
171 0.8