Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2J6SPW6

Protein Details
Accession A0A2J6SPW6    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
386-405REKMRAEKRREEERKLRQSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-239PKFKHKKIPRGPPSPP
352-356AGGRR
386-405REKMRAEKRREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MTSIAASLSRALPKPKYTGEEEEIPQHAQQRGPRIVGAGTIDDTQIVLKKSGPPPYGKRSGWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGKKGQSSSNALAVQVDAEGKVKYDAIARQGHNDQRIVHASFKDLIPLRQRADAGDIDLDRPSEEEVKASTERTRDALAKLVSGAVAAQKPKNVNVGSRKDPTYVRYTPANQMGDNTRKNDRIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKAQKEDHLRMLAQKAREERAGAAGGRRASRTSRSRSGSYSESESERSGSDDEEVREREKMRAEKRREEERKLRQSRMGAERRVQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSSEGMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAQDAISSIYRPRANMDDGDDEEAAEAEMGKIQRSNRFEALGKGTFKGSADVEAREGPVQFEKDTGDVFNVDEFLSKVGETSNKREYGLQESDDRKAKRARVDEDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.47
4 0.48
5 0.52
6 0.52
7 0.53
8 0.51
9 0.5
10 0.47
11 0.44
12 0.39
13 0.37
14 0.34
15 0.32
16 0.34
17 0.38
18 0.4
19 0.4
20 0.39
21 0.35
22 0.33
23 0.31
24 0.28
25 0.21
26 0.18
27 0.16
28 0.16
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.15
36 0.23
37 0.29
38 0.38
39 0.4
40 0.44
41 0.51
42 0.59
43 0.66
44 0.6
45 0.62
46 0.64
47 0.71
48 0.74
49 0.74
50 0.72
51 0.69
52 0.75
53 0.7
54 0.62
55 0.56
56 0.49
57 0.41
58 0.35
59 0.27
60 0.2
61 0.18
62 0.15
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.27
80 0.25
81 0.3
82 0.32
83 0.37
84 0.32
85 0.29
86 0.28
87 0.25
88 0.21
89 0.15
90 0.13
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.19
101 0.27
102 0.27
103 0.32
104 0.38
105 0.42
106 0.42
107 0.41
108 0.36
109 0.34
110 0.38
111 0.35
112 0.32
113 0.28
114 0.27
115 0.27
116 0.26
117 0.27
118 0.24
119 0.26
120 0.29
121 0.34
122 0.33
123 0.34
124 0.34
125 0.29
126 0.31
127 0.27
128 0.22
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.19
147 0.2
148 0.22
149 0.2
150 0.2
151 0.25
152 0.22
153 0.21
154 0.2
155 0.18
156 0.15
157 0.12
158 0.12
159 0.08
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.17
165 0.19
166 0.25
167 0.23
168 0.27
169 0.34
170 0.4
171 0.43
172 0.46
173 0.46
174 0.43
175 0.43
176 0.4
177 0.39
178 0.34
179 0.31
180 0.32
181 0.33
182 0.36
183 0.41
184 0.39
185 0.31
186 0.31
187 0.35
188 0.37
189 0.37
190 0.35
191 0.32
192 0.33
193 0.35
194 0.39
195 0.35
196 0.34
197 0.36
198 0.38
199 0.41
200 0.46
201 0.51
202 0.45
203 0.46
204 0.4
205 0.39
206 0.36
207 0.38
208 0.36
209 0.31
210 0.31
211 0.4
212 0.46
213 0.44
214 0.52
215 0.53
216 0.59
217 0.67
218 0.76
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.76
224 0.71
225 0.65
226 0.56
227 0.52
228 0.48
229 0.49
230 0.49
231 0.49
232 0.47
233 0.48
234 0.5
235 0.45
236 0.42
237 0.42
238 0.41
239 0.39
240 0.36
241 0.34
242 0.32
243 0.32
244 0.3
245 0.28
246 0.21
247 0.16
248 0.18
249 0.19
250 0.27
251 0.3
252 0.38
253 0.42
254 0.47
255 0.52
256 0.49
257 0.49
258 0.42
259 0.41
260 0.37
261 0.4
262 0.37
263 0.37
264 0.39
265 0.35
266 0.32
267 0.32
268 0.28
269 0.19
270 0.17
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.15
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.12
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.16
300 0.25
301 0.3
302 0.32
303 0.33
304 0.32
305 0.38
306 0.41
307 0.41
308 0.34
309 0.33
310 0.32
311 0.36
312 0.38
313 0.32
314 0.3
315 0.35
316 0.38
317 0.39
318 0.36
319 0.37
320 0.41
321 0.46
322 0.46
323 0.4
324 0.35
325 0.33
326 0.37
327 0.34
328 0.29
329 0.26
330 0.26
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.2
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.24
346 0.3
347 0.35
348 0.41
349 0.44
350 0.46
351 0.47
352 0.49
353 0.44
354 0.39
355 0.35
356 0.29
357 0.26
358 0.26
359 0.24
360 0.2
361 0.18
362 0.17
363 0.13
364 0.11
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.21
372 0.22
373 0.23
374 0.27
375 0.34
376 0.39
377 0.48
378 0.54
379 0.6
380 0.66
381 0.74
382 0.74
383 0.75
384 0.76
385 0.76
386 0.81
387 0.78
388 0.75
389 0.68
390 0.66
391 0.65
392 0.65
393 0.63
394 0.56
395 0.54
396 0.54
397 0.51
398 0.49
399 0.41
400 0.32
401 0.33
402 0.37
403 0.37
404 0.37
405 0.36
406 0.39
407 0.4
408 0.41
409 0.34
410 0.27
411 0.24
412 0.19
413 0.19
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.14
418 0.13
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.17
427 0.17
428 0.17
429 0.18
430 0.2
431 0.21
432 0.23
433 0.21
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.22
438 0.22
439 0.22
440 0.21
441 0.23
442 0.28
443 0.27
444 0.26
445 0.22
446 0.18
447 0.18
448 0.17
449 0.19
450 0.14
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.14
456 0.15
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.15
461 0.14
462 0.14
463 0.15
464 0.18
465 0.2
466 0.18
467 0.21
468 0.23
469 0.26
470 0.27
471 0.3
472 0.29
473 0.29
474 0.32
475 0.29
476 0.24
477 0.21
478 0.19
479 0.14
480 0.09
481 0.08
482 0.04
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.12
487 0.16
488 0.23
489 0.27
490 0.33
491 0.33
492 0.37
493 0.38
494 0.4
495 0.44
496 0.42
497 0.4
498 0.35
499 0.33
500 0.31
501 0.3
502 0.27
503 0.2
504 0.2
505 0.21
506 0.21
507 0.22
508 0.22
509 0.23
510 0.22
511 0.22
512 0.18
513 0.21
514 0.22
515 0.2
516 0.19
517 0.19
518 0.19
519 0.2
520 0.19
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.13
525 0.13
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.09
533 0.11
534 0.19
535 0.22
536 0.29
537 0.36
538 0.37
539 0.39
540 0.43
541 0.43
542 0.44
543 0.45
544 0.41
545 0.41
546 0.43
547 0.48
548 0.53
549 0.51
550 0.49
551 0.52
552 0.54
553 0.55
554 0.61
555 0.61