Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PGH8

Protein Details
Accession J3PGH8    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-319TTTTSGGRRKKRKGALTDKTGHSHydrophilic
384-405GAQPNRGGKRGKKHYKGGLAELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-310RRKKRKG
389-399RGGKRGKKHYK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARGKWIDKKSATHFTLVHRPQNDPLIHDESAPSMVLNPTQLPNASAKGKKLDDLASELGSDALSIRDNEGEAANHGIYFDDTEYDYMQHMRDLGSGEGEVVFVEAKLGQKEGKGKQKQSLEDALREMDLQHRSSDLLDADILPTRDLPRATYQSQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDGDDDIFQALAKDAKELNEHEFEDEFYDDEEGWESDATAKPGKELNDGDGEAPQLVRTGEQSAEGPSQGWMEDFKQFKKDQGSERRPGAAAPRVGAAAPSELQSSLWTTTTSGGRRKKRKGALTDKTGHSMTSASLVRTEGLTLLDARFERIEEEYTTDFGDDELGSVVSGMSTASSVQGPMRSDFDGILDDFLGAQPNRGGKRGKKHYKGGLAELEEIRRGLGPARISTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.58
4 0.58
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.56
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.25
18 0.25
19 0.22
20 0.15
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.19
31 0.23
32 0.28
33 0.29
34 0.31
35 0.36
36 0.37
37 0.37
38 0.38
39 0.37
40 0.32
41 0.34
42 0.33
43 0.26
44 0.25
45 0.23
46 0.19
47 0.15
48 0.13
49 0.08
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.11
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.1
97 0.12
98 0.2
99 0.27
100 0.36
101 0.42
102 0.45
103 0.52
104 0.58
105 0.58
106 0.56
107 0.57
108 0.5
109 0.45
110 0.43
111 0.36
112 0.3
113 0.27
114 0.22
115 0.18
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.16
122 0.17
123 0.12
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.13
134 0.13
135 0.15
136 0.18
137 0.23
138 0.25
139 0.3
140 0.31
141 0.33
142 0.36
143 0.35
144 0.29
145 0.25
146 0.23
147 0.19
148 0.17
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.11
192 0.12
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.14
200 0.12
201 0.09
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.08
248 0.13
249 0.15
250 0.16
251 0.22
252 0.22
253 0.26
254 0.32
255 0.35
256 0.4
257 0.49
258 0.55
259 0.56
260 0.58
261 0.56
262 0.49
263 0.45
264 0.41
265 0.36
266 0.29
267 0.23
268 0.22
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.14
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.13
286 0.18
287 0.22
288 0.28
289 0.36
290 0.45
291 0.55
292 0.63
293 0.69
294 0.73
295 0.77
296 0.8
297 0.82
298 0.82
299 0.81
300 0.8
301 0.72
302 0.67
303 0.59
304 0.48
305 0.37
306 0.29
307 0.2
308 0.18
309 0.17
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.12
322 0.11
323 0.13
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.14
330 0.18
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.12
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.05
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.13
356 0.15
357 0.17
358 0.19
359 0.19
360 0.2
361 0.19
362 0.18
363 0.17
364 0.15
365 0.14
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.15
371 0.12
372 0.13
373 0.15
374 0.22
375 0.24
376 0.29
377 0.36
378 0.38
379 0.49
380 0.59
381 0.67
382 0.7
383 0.77
384 0.82
385 0.84
386 0.81
387 0.77
388 0.74
389 0.66
390 0.62
391 0.56
392 0.49
393 0.4
394 0.35
395 0.28
396 0.21
397 0.19
398 0.16
399 0.18
400 0.2