Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NRT8

Protein Details
Accession J3NRT8    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-107GAPILKRATLQSRRRRREGRREDATRTANHydrophilic
163-184SQAERQKSRKFHKQDAYHLPELHydrophilic
1032-1057DAEPERSTFRRKFRKSQGKRLFLPPGHydrophilic
1215-1237ERSGRTTKGKSGQKRKARASAVPHydrophilic
1266-1287VDSGSTRKATRGRKRGRRGGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-99SRRRRREGRR
1045-1045R
1222-1232KGKSGQKRKAR
1272-1287RKATRGRKRGRRGGGA
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 8, cyto 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR003903  UIM_dom  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR001044  XPG/Rad2_eukaryotes  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02809  UIM  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50330  UIM  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09904  H3TH_XPG  
cd09868  PIN_XPG_RAD2  
Amino Acid Sequences MGVNGLWQVLQPCARPTNLATLNRKRLAVDASIWIYQFLKAVRDKEGNALRSSHVVGFFRRICKLLWFGIQPVFVFDGGAPILKRATLQSRRRRREGRREDATRTANKLLAVQMQRLAEGEADRHRRKTAAIAAPAEAEDGVAEGEVMPAAENLVYADEQFLSQAERQKSRKFHKQDAYHLPELDKSMHEMGVPNDPRVMSIDELENYARQFHRGEDVNLYDFSKIDFDGDFFKSLPPADRFNILNAARIRSRLRMGLSKEQLDRMFPDRRAFSRFQIERVQERNRLTQRLMVELGMGESADLTVGGRINSEKDREYILVKNDGAEGGWALGVVSRQNEGVASNPIDVDAPSRFAANLDDEDEEWEDEDDFEDVPIEGLNRLPTGKLAAGHEDESMFVAQENDMDDLFEEQTQENLGLEADEDEDISRAIALSLKTQHGHDQVQQATDMSQEGVETTEAEQRPEWEQKAAEAPKPIPGFSGKAIARLVNNRSSRLVPRPRVAAAAAAGNDSDSDEDLQAALASARRKRRQQVATTETAESEKPVTSTSLKNPFSGPLPFEKLDWRAASSAKPSPVVTRGGISLTTEPAGEESAAHEPEDEDDFAGGFETAAEPERPLPLPPWLQDDQGDIRDSVRNQVEAHAEMNAQDRQHALEERLRFQREQRNKLVVIESSSEDEDDEVEIIEAPPPQPTSASQQTTKATPLGRPDVLGETLAEVQSKLGSGEEPGPETAPAAEPATTVPATSSPPSSPDVSFEDVNIAEARTIVAEPLAALEPEDQGQEDDAAFEDVPIPDLEDGIERDNQDVAPAGDNFAAGGDLDEFSDSDDGELLIQMAEEAEAHARFASTLNNNVPSGSTAQHEVRDPLLYEQELRQLRAQQKRDLRDADEVSQVMVAECQQLLRLFGIPYITAPMEAEAQCAELVQLGLVDGIVTDDSDTFLFGGTRVYKNMFNGNKFVECYLSSDLEGDLSLGRPQLIALAQLLGSDYTEGLPGIGPVTAVEILSEFPGEDGLKQFAEWWHDVQSVTHLNPRDAEPERSTFRRKFRKSQGKRLFLPPGFPSPAVPEAYMQPEVDSDPQPFQWGAPDLRGLRTFLMSTVGWGEERTDEILVPVIRDMNKREAEGTQSNITRYFSGTVGAGARAVAPGPMTAVGGESAGDRGREAFAPRRQAARGSKRMAVAVSRLKAQAGASDNSSERAAASEDGSREGEGGVDAVERSGRTTKGKSGQKRKARASAVPTRDDLEGMDGEAAAGDFSDDGGGDDGEFVDSGSTRKATRGRKRGRRGGGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.27
3 0.28
4 0.35
5 0.4
6 0.47
7 0.52
8 0.58
9 0.67
10 0.68
11 0.67
12 0.57
13 0.53
14 0.49
15 0.43
16 0.35
17 0.32
18 0.32
19 0.33
20 0.32
21 0.29
22 0.26
23 0.22
24 0.22
25 0.17
26 0.2
27 0.24
28 0.26
29 0.32
30 0.36
31 0.37
32 0.43
33 0.5
34 0.47
35 0.44
36 0.44
37 0.39
38 0.38
39 0.39
40 0.33
41 0.29
42 0.28
43 0.28
44 0.34
45 0.38
46 0.39
47 0.39
48 0.37
49 0.34
50 0.37
51 0.39
52 0.36
53 0.36
54 0.34
55 0.35
56 0.38
57 0.38
58 0.32
59 0.3
60 0.27
61 0.21
62 0.19
63 0.15
64 0.13
65 0.12
66 0.15
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.15
73 0.26
74 0.33
75 0.44
76 0.53
77 0.64
78 0.73
79 0.82
80 0.88
81 0.88
82 0.89
83 0.9
84 0.9
85 0.89
86 0.87
87 0.84
88 0.82
89 0.79
90 0.74
91 0.68
92 0.61
93 0.52
94 0.46
95 0.42
96 0.35
97 0.36
98 0.33
99 0.29
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.26
104 0.24
105 0.18
106 0.16
107 0.18
108 0.22
109 0.32
110 0.36
111 0.38
112 0.39
113 0.39
114 0.39
115 0.43
116 0.44
117 0.43
118 0.46
119 0.45
120 0.44
121 0.43
122 0.42
123 0.34
124 0.24
125 0.15
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.12
151 0.2
152 0.25
153 0.33
154 0.39
155 0.47
156 0.56
157 0.62
158 0.69
159 0.7
160 0.74
161 0.76
162 0.79
163 0.81
164 0.82
165 0.82
166 0.75
167 0.69
168 0.59
169 0.51
170 0.45
171 0.37
172 0.27
173 0.22
174 0.2
175 0.19
176 0.18
177 0.18
178 0.18
179 0.26
180 0.27
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.23
185 0.24
186 0.25
187 0.16
188 0.16
189 0.19
190 0.17
191 0.19
192 0.2
193 0.18
194 0.16
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.22
201 0.24
202 0.26
203 0.27
204 0.3
205 0.3
206 0.3
207 0.3
208 0.23
209 0.2
210 0.18
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.16
222 0.17
223 0.22
224 0.21
225 0.24
226 0.24
227 0.27
228 0.28
229 0.29
230 0.36
231 0.3
232 0.33
233 0.31
234 0.34
235 0.31
236 0.34
237 0.34
238 0.3
239 0.33
240 0.3
241 0.32
242 0.35
243 0.4
244 0.47
245 0.49
246 0.5
247 0.5
248 0.5
249 0.47
250 0.41
251 0.38
252 0.34
253 0.35
254 0.32
255 0.36
256 0.36
257 0.38
258 0.43
259 0.42
260 0.42
261 0.46
262 0.45
263 0.43
264 0.47
265 0.49
266 0.49
267 0.53
268 0.55
269 0.5
270 0.52
271 0.58
272 0.55
273 0.55
274 0.49
275 0.47
276 0.42
277 0.39
278 0.37
279 0.27
280 0.22
281 0.18
282 0.17
283 0.12
284 0.1
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.11
297 0.14
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.23
304 0.25
305 0.25
306 0.28
307 0.27
308 0.26
309 0.24
310 0.22
311 0.19
312 0.14
313 0.11
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.12
336 0.09
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.12
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.07
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.15
376 0.17
377 0.17
378 0.17
379 0.15
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.04
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.06
418 0.07
419 0.09
420 0.12
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.21
425 0.22
426 0.24
427 0.25
428 0.29
429 0.28
430 0.28
431 0.27
432 0.23
433 0.19
434 0.17
435 0.14
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.12
445 0.13
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.19
450 0.23
451 0.23
452 0.19
453 0.19
454 0.19
455 0.27
456 0.28
457 0.26
458 0.25
459 0.25
460 0.28
461 0.29
462 0.28
463 0.21
464 0.2
465 0.19
466 0.17
467 0.24
468 0.18
469 0.2
470 0.21
471 0.21
472 0.21
473 0.24
474 0.27
475 0.27
476 0.28
477 0.27
478 0.29
479 0.3
480 0.32
481 0.37
482 0.43
483 0.4
484 0.41
485 0.43
486 0.41
487 0.4
488 0.36
489 0.28
490 0.19
491 0.16
492 0.13
493 0.1
494 0.1
495 0.08
496 0.08
497 0.06
498 0.06
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.06
509 0.1
510 0.14
511 0.23
512 0.29
513 0.34
514 0.41
515 0.5
516 0.55
517 0.6
518 0.65
519 0.63
520 0.62
521 0.59
522 0.53
523 0.44
524 0.37
525 0.3
526 0.2
527 0.15
528 0.1
529 0.08
530 0.08
531 0.1
532 0.11
533 0.14
534 0.2
535 0.28
536 0.29
537 0.29
538 0.29
539 0.29
540 0.29
541 0.27
542 0.23
543 0.17
544 0.21
545 0.2
546 0.2
547 0.22
548 0.21
549 0.23
550 0.22
551 0.19
552 0.16
553 0.17
554 0.17
555 0.18
556 0.2
557 0.18
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.2
562 0.21
563 0.17
564 0.15
565 0.14
566 0.13
567 0.13
568 0.12
569 0.1
570 0.08
571 0.08
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.07
576 0.05
577 0.05
578 0.06
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.09
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.09
605 0.12
606 0.14
607 0.15
608 0.2
609 0.2
610 0.2
611 0.2
612 0.21
613 0.19
614 0.19
615 0.19
616 0.13
617 0.13
618 0.14
619 0.14
620 0.16
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.16
625 0.16
626 0.15
627 0.15
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.12
632 0.12
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.11
639 0.11
640 0.14
641 0.16
642 0.2
643 0.25
644 0.26
645 0.25
646 0.29
647 0.37
648 0.41
649 0.46
650 0.47
651 0.47
652 0.46
653 0.47
654 0.43
655 0.34
656 0.27
657 0.22
658 0.17
659 0.14
660 0.13
661 0.12
662 0.1
663 0.09
664 0.07
665 0.06
666 0.05
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.07
677 0.07
678 0.08
679 0.14
680 0.2
681 0.23
682 0.23
683 0.27
684 0.28
685 0.28
686 0.28
687 0.24
688 0.18
689 0.17
690 0.2
691 0.21
692 0.2
693 0.19
694 0.19
695 0.18
696 0.17
697 0.16
698 0.11
699 0.08
700 0.09
701 0.09
702 0.08
703 0.06
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.05
711 0.08
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.09
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.09
726 0.08
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.09
731 0.1
732 0.11
733 0.09
734 0.11
735 0.14
736 0.15
737 0.14
738 0.15
739 0.18
740 0.19
741 0.19
742 0.17
743 0.16
744 0.14
745 0.15
746 0.12
747 0.09
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.05
752 0.05
753 0.04
754 0.04
755 0.03
756 0.03
757 0.05
758 0.05
759 0.04
760 0.05
761 0.05
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.05
767 0.06
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.06
773 0.05
774 0.05
775 0.06
776 0.06
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.06
781 0.06
782 0.06
783 0.06
784 0.07
785 0.08
786 0.1
787 0.09
788 0.1
789 0.11
790 0.1
791 0.09
792 0.1
793 0.08
794 0.09
795 0.08
796 0.09
797 0.08
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.06
802 0.04
803 0.04
804 0.04
805 0.04
806 0.04
807 0.04
808 0.04
809 0.05
810 0.05
811 0.05
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.04
816 0.04
817 0.04
818 0.03
819 0.03
820 0.03
821 0.03
822 0.03
823 0.03
824 0.03
825 0.05
826 0.05
827 0.05
828 0.05
829 0.05
830 0.06
831 0.06
832 0.11
833 0.11
834 0.15
835 0.17
836 0.2
837 0.2
838 0.2
839 0.2
840 0.16
841 0.16
842 0.13
843 0.12
844 0.13
845 0.14
846 0.16
847 0.16
848 0.16
849 0.16
850 0.16
851 0.16
852 0.14
853 0.15
854 0.13
855 0.14
856 0.13
857 0.2
858 0.2
859 0.21
860 0.22
861 0.26
862 0.34
863 0.42
864 0.45
865 0.45
866 0.52
867 0.55
868 0.59
869 0.55
870 0.51
871 0.48
872 0.47
873 0.41
874 0.36
875 0.31
876 0.25
877 0.22
878 0.19
879 0.12
880 0.1
881 0.08
882 0.06
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.07
887 0.08
888 0.09
889 0.1
890 0.09
891 0.1
892 0.11
893 0.09
894 0.09
895 0.11
896 0.1
897 0.08
898 0.08
899 0.08
900 0.11
901 0.11
902 0.11
903 0.09
904 0.1
905 0.09
906 0.09
907 0.08
908 0.05
909 0.05
910 0.04
911 0.04
912 0.04
913 0.04
914 0.03
915 0.03
916 0.02
917 0.03
918 0.03
919 0.03
920 0.03
921 0.03
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.09
930 0.11
931 0.13
932 0.14
933 0.17
934 0.18
935 0.2
936 0.29
937 0.31
938 0.3
939 0.32
940 0.33
941 0.33
942 0.32
943 0.3
944 0.23
945 0.19
946 0.2
947 0.2
948 0.18
949 0.16
950 0.16
951 0.15
952 0.13
953 0.12
954 0.09
955 0.07
956 0.06
957 0.07
958 0.07
959 0.07
960 0.07
961 0.06
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.07
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.08
970 0.06
971 0.06
972 0.05
973 0.05
974 0.05
975 0.05
976 0.05
977 0.05
978 0.05
979 0.05
980 0.05
981 0.05
982 0.05
983 0.04
984 0.06
985 0.06
986 0.06
987 0.06
988 0.06
989 0.06
990 0.07
991 0.07
992 0.05
993 0.04
994 0.06
995 0.06
996 0.07
997 0.09
998 0.1
999 0.1
1000 0.1
1001 0.12
1002 0.13
1003 0.18
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.22
1009 0.2
1010 0.23
1011 0.22
1012 0.21
1013 0.25
1014 0.23
1015 0.22
1016 0.24
1017 0.25
1018 0.27
1019 0.27
1020 0.31
1021 0.3
1022 0.34
1023 0.39
1024 0.42
1025 0.48
1026 0.49
1027 0.55
1028 0.61
1029 0.65
1030 0.69
1031 0.75
1032 0.81
1033 0.83
1034 0.88
1035 0.88
1036 0.86
1037 0.84
1038 0.81
1039 0.8
1040 0.69
1041 0.65
1042 0.57
1043 0.53
1044 0.47
1045 0.42
1046 0.36
1047 0.3
1048 0.32
1049 0.29
1050 0.26
1051 0.2
1052 0.2
1053 0.24
1054 0.24
1055 0.19
1056 0.16
1057 0.15
1058 0.17
1059 0.19
1060 0.18
1061 0.16
1062 0.17
1063 0.17
1064 0.19
1065 0.19
1066 0.17
1067 0.18
1068 0.21
1069 0.2
1070 0.2
1071 0.25
1072 0.24
1073 0.28
1074 0.29
1075 0.26
1076 0.23
1077 0.23
1078 0.21
1079 0.16
1080 0.18
1081 0.14
1082 0.14
1083 0.15
1084 0.14
1085 0.13
1086 0.12
1087 0.13
1088 0.1
1089 0.12
1090 0.12
1091 0.11
1092 0.1
1093 0.1
1094 0.15
1095 0.14
1096 0.13
1097 0.13
1098 0.15
1099 0.18
1100 0.21
1101 0.25
1102 0.29
1103 0.31
1104 0.31
1105 0.33
1106 0.31
1107 0.35
1108 0.35
1109 0.36
1110 0.34
1111 0.33
1112 0.34
1113 0.34
1114 0.33
1115 0.27
1116 0.25
1117 0.23
1118 0.17
1119 0.16
1120 0.15
1121 0.15
1122 0.14
1123 0.14
1124 0.12
1125 0.1
1126 0.1
1127 0.09
1128 0.09
1129 0.07
1130 0.06
1131 0.06
1132 0.07
1133 0.07
1134 0.07
1135 0.07
1136 0.07
1137 0.07
1138 0.07
1139 0.07
1140 0.06
1141 0.08
1142 0.09
1143 0.09
1144 0.08
1145 0.09
1146 0.11
1147 0.14
1148 0.18
1149 0.26
1150 0.31
1151 0.4
1152 0.43
1153 0.46
1154 0.46
1155 0.52
1156 0.57
1157 0.59
1158 0.62
1159 0.58
1160 0.59
1161 0.57
1162 0.57
1163 0.51
1164 0.43
1165 0.4
1166 0.39
1167 0.36
1168 0.35
1169 0.33
1170 0.32
1171 0.31
1172 0.29
1173 0.27
1174 0.23
1175 0.23
1176 0.22
1177 0.25
1178 0.26
1179 0.26
1180 0.26
1181 0.2
1182 0.15
1183 0.15
1184 0.15
1185 0.12
1186 0.13
1187 0.16
1188 0.17
1189 0.19
1190 0.2
1191 0.19
1192 0.17
1193 0.16
1194 0.14
1195 0.1
1196 0.09
1197 0.07
1198 0.07
1199 0.07
1200 0.07
1201 0.08
1202 0.08
1203 0.11
1204 0.15
1205 0.18
1206 0.23
1207 0.27
1208 0.35
1209 0.43
1210 0.53
1211 0.61
1212 0.68
1213 0.75
1214 0.8
1215 0.86
1216 0.86
1217 0.86
1218 0.82
1219 0.79
1220 0.77
1221 0.77
1222 0.74
1223 0.68
1224 0.61
1225 0.54
1226 0.48
1227 0.41
1228 0.32
1229 0.25
1230 0.19
1231 0.15
1232 0.14
1233 0.11
1234 0.1
1235 0.1
1236 0.09
1237 0.05
1238 0.05
1239 0.04
1240 0.04
1241 0.04
1242 0.04
1243 0.04
1244 0.05
1245 0.06
1246 0.07
1247 0.06
1248 0.07
1249 0.07
1250 0.07
1251 0.07
1252 0.06
1253 0.06
1254 0.07
1255 0.08
1256 0.11
1257 0.13
1258 0.13
1259 0.2
1260 0.28
1261 0.38
1262 0.49
1263 0.59
1264 0.67
1265 0.76
1266 0.86
1267 0.9