Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PDL9

Protein Details
Accession J3PDL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23AVKSSIAKPKKRKADAIADDHydrophilic
26-56AGAPRTAPLGRDKKKRRKKTRRTGEDEDSLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-17KPKKRKA
28-47APRTAPLGRDKKKRRKKTRR
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
Amino Acid Sequences MSAAVKSSIAKPKKRKADAIADDGDAGAPRTAPLGRDKKKRRKKTRRTGEDEDSLDLDAGLNLALASMDGQLLSDHLAQQVSRFGADLSSVELADLHVPAGAIRDSSSFDKGPRSLENLPAFLEAFASGGVAELGAAPKDKGAPHTIVVAGAGLRAADLTRALRKYQKKGNTVAKLFAKHIKMEEAVSFLQKNHTGVAVGTPVRLMDLLDNGALSVKNLKRIVVDASHIDQKKRGVMDMRETALPLARWLARPEFKERYVDDVNPLHLLFY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.79
3 0.78
4 0.81
5 0.78
6 0.75
7 0.68
8 0.58
9 0.5
10 0.42
11 0.34
12 0.23
13 0.17
14 0.1
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.1
19 0.11
20 0.21
21 0.3
22 0.39
23 0.5
24 0.61
25 0.7
26 0.8
27 0.9
28 0.92
29 0.92
30 0.95
31 0.96
32 0.96
33 0.96
34 0.94
35 0.92
36 0.87
37 0.83
38 0.74
39 0.64
40 0.54
41 0.43
42 0.33
43 0.24
44 0.17
45 0.09
46 0.07
47 0.05
48 0.04
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.08
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.17
98 0.17
99 0.19
100 0.18
101 0.22
102 0.21
103 0.28
104 0.28
105 0.25
106 0.25
107 0.23
108 0.22
109 0.16
110 0.14
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.05
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.21
151 0.27
152 0.34
153 0.41
154 0.48
155 0.49
156 0.56
157 0.64
158 0.64
159 0.6
160 0.59
161 0.55
162 0.49
163 0.47
164 0.44
165 0.36
166 0.29
167 0.29
168 0.25
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.14
203 0.14
204 0.22
205 0.22
206 0.23
207 0.23
208 0.25
209 0.29
210 0.23
211 0.25
212 0.21
213 0.24
214 0.32
215 0.33
216 0.32
217 0.32
218 0.32
219 0.34
220 0.32
221 0.33
222 0.32
223 0.35
224 0.42
225 0.44
226 0.44
227 0.4
228 0.39
229 0.35
230 0.31
231 0.27
232 0.19
233 0.18
234 0.18
235 0.2
236 0.23
237 0.31
238 0.34
239 0.37
240 0.44
241 0.47
242 0.47
243 0.51
244 0.49
245 0.48
246 0.48
247 0.46
248 0.45
249 0.41
250 0.4
251 0.36