Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R7W4

Protein Details
Accession C4R7W4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-66SNVITSVKKQNLKRNPKSNRSIRRNRYNDLRVQHydrophilic
75-96LEKNKKSSLKSPHDKYNRLKIKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9.5, cyto_nucl 5.5, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr4_0961  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
Amino Acid Sequences MFLNSSIRRTSINGLGVCSRWIHQSFQRDAVSESNVITSVKKQNLKRNPKSNRSIRRNRYNDLRVQVERDVIESLEKNKKSSLKSPHDKYNRLKIKFDPRFEGSFKDFGISSRLDRQLHEKLDISRPTDNQRRILSILCSGISVLAVASQRSGSSTCLLLYALSIRGRSLLLAPTTLALLQLQKLCHSLEVQDVAFLYRSSEEDELNQEKQLDLKTPQVMVATPQRMLDLISKNNSDPLYMRLHELKFLGVDDADIQLLNDNKKVVHERPAQILINYIMKLKETISSTKNIQPLQFGFIETLDISNKLLNMIEENKWNVSRTLLPIGLLAKGDVLARARINQSARLSIVIGDSRKVLDFKLPPLSTGMEVLSKIRSPIGKEFDENAKKHLTTQLQKDKTLSQLISDEILDALPTVSAKLRKKKSLLICPDSITIRTIMEQLTKLGYSSKQLSSSTANFFNDENEQSQFLVSTPSQLPGLNLEGLASVICLGLHALKDAKTLVLIAGKSQSPRVTLILSKSKTTLVERFMIERILLKSGVASLTPLIGETDNYDEKAYQVLFSDIHGETSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.37
3 0.35
4 0.33
5 0.3
6 0.24
7 0.24
8 0.26
9 0.28
10 0.32
11 0.41
12 0.44
13 0.5
14 0.5
15 0.45
16 0.45
17 0.43
18 0.4
19 0.31
20 0.27
21 0.21
22 0.2
23 0.19
24 0.18
25 0.21
26 0.26
27 0.32
28 0.39
29 0.45
30 0.55
31 0.65
32 0.76
33 0.8
34 0.82
35 0.85
36 0.87
37 0.91
38 0.91
39 0.91
40 0.91
41 0.91
42 0.91
43 0.92
44 0.88
45 0.85
46 0.85
47 0.82
48 0.79
49 0.74
50 0.71
51 0.62
52 0.6
53 0.54
54 0.47
55 0.39
56 0.33
57 0.28
58 0.21
59 0.22
60 0.19
61 0.24
62 0.3
63 0.31
64 0.31
65 0.35
66 0.41
67 0.43
68 0.5
69 0.54
70 0.56
71 0.65
72 0.7
73 0.75
74 0.78
75 0.81
76 0.8
77 0.8
78 0.79
79 0.73
80 0.7
81 0.68
82 0.7
83 0.7
84 0.68
85 0.64
86 0.59
87 0.6
88 0.58
89 0.55
90 0.48
91 0.41
92 0.36
93 0.31
94 0.26
95 0.22
96 0.24
97 0.2
98 0.19
99 0.24
100 0.3
101 0.3
102 0.31
103 0.37
104 0.4
105 0.41
106 0.41
107 0.37
108 0.35
109 0.43
110 0.45
111 0.42
112 0.38
113 0.39
114 0.45
115 0.51
116 0.51
117 0.49
118 0.47
119 0.47
120 0.44
121 0.44
122 0.37
123 0.31
124 0.28
125 0.22
126 0.19
127 0.16
128 0.14
129 0.11
130 0.09
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.09
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.07
186 0.07
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.17
192 0.19
193 0.19
194 0.19
195 0.17
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.13
201 0.17
202 0.18
203 0.18
204 0.19
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.22
209 0.19
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.2
216 0.17
217 0.19
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.25
222 0.23
223 0.19
224 0.15
225 0.15
226 0.18
227 0.17
228 0.19
229 0.21
230 0.21
231 0.22
232 0.21
233 0.18
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.15
252 0.15
253 0.22
254 0.28
255 0.3
256 0.33
257 0.37
258 0.35
259 0.31
260 0.3
261 0.23
262 0.18
263 0.16
264 0.14
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.09
269 0.11
270 0.11
271 0.14
272 0.15
273 0.18
274 0.2
275 0.24
276 0.28
277 0.26
278 0.24
279 0.23
280 0.22
281 0.22
282 0.2
283 0.16
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.07
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.16
305 0.14
306 0.13
307 0.14
308 0.14
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.12
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.11
325 0.12
326 0.15
327 0.16
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.21
332 0.19
333 0.18
334 0.15
335 0.15
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.11
343 0.1
344 0.14
345 0.15
346 0.18
347 0.26
348 0.26
349 0.25
350 0.27
351 0.27
352 0.22
353 0.21
354 0.18
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.15
364 0.21
365 0.26
366 0.26
367 0.27
368 0.3
369 0.38
370 0.43
371 0.41
372 0.37
373 0.35
374 0.33
375 0.33
376 0.36
377 0.35
378 0.33
379 0.43
380 0.51
381 0.51
382 0.52
383 0.53
384 0.48
385 0.44
386 0.43
387 0.33
388 0.24
389 0.22
390 0.22
391 0.21
392 0.18
393 0.14
394 0.09
395 0.09
396 0.07
397 0.06
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.08
403 0.15
404 0.22
405 0.31
406 0.38
407 0.45
408 0.49
409 0.56
410 0.63
411 0.66
412 0.69
413 0.66
414 0.62
415 0.57
416 0.57
417 0.5
418 0.41
419 0.32
420 0.23
421 0.17
422 0.15
423 0.14
424 0.13
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.15
432 0.14
433 0.16
434 0.2
435 0.22
436 0.23
437 0.23
438 0.26
439 0.29
440 0.32
441 0.32
442 0.32
443 0.3
444 0.28
445 0.28
446 0.27
447 0.26
448 0.24
449 0.21
450 0.19
451 0.19
452 0.18
453 0.17
454 0.15
455 0.12
456 0.14
457 0.12
458 0.15
459 0.15
460 0.16
461 0.17
462 0.17
463 0.18
464 0.16
465 0.19
466 0.14
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.07
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.13
485 0.13
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.14
490 0.13
491 0.14
492 0.17
493 0.19
494 0.2
495 0.23
496 0.24
497 0.21
498 0.24
499 0.24
500 0.24
501 0.25
502 0.32
503 0.38
504 0.38
505 0.37
506 0.37
507 0.37
508 0.37
509 0.39
510 0.37
511 0.32
512 0.35
513 0.35
514 0.37
515 0.36
516 0.33
517 0.28
518 0.27
519 0.25
520 0.23
521 0.21
522 0.18
523 0.17
524 0.17
525 0.18
526 0.13
527 0.12
528 0.09
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.09
534 0.1
535 0.11
536 0.17
537 0.18
538 0.19
539 0.2
540 0.18
541 0.18
542 0.22
543 0.2
544 0.15
545 0.15
546 0.16
547 0.15
548 0.16
549 0.2
550 0.16