Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1HTJ4

Protein Details
Accession A0A2I1HTJ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-401GNIQNPPKAKTKGRPPTKRYRSSIEHEKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-391KAKTKGRPPTKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 8.833, mito 7.5, cyto_mito 5.833, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031052  FHY3/FAR1  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MHIFYKCRNSLCKPLFFSRWTSLLENFPLAKDYLLRVLWPSNKSWARCYLKQIFTAGIESTSRVEGMNAIIKKTVRSNSTLYQLVDQLSERLISEIQWGRFHEYRSSTTSSISVSIGEDLFPSVIKIMEKYLCINTITAIKVEMAQCLYLQATIVLFSELDFTQEQGMVLVYGTGLGCVIFVRLGYGLWVREGFIEDSYDAQQITLQSIIDEIGKEDVKEIWEICDIRPAGKKDHMHYIVISNEISFLCTCLTTISRGIICRHYFHVMMFSKVAGFHISMIPERWYQDVYQGKPLTQETGLIFLHENENLENNTNNDLEIRIPTSIEKRKKYGKLWGMAREATLLALESNDNEMEQNHINESTNIGNEFQVLGNIQNPPKAKTKGRPPTKRYRSSIEHEKGESSKSGCSSRNTYKCRICEQCGHNAAYHKNDKLKERQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.63
4 0.63
5 0.57
6 0.53
7 0.49
8 0.45
9 0.41
10 0.4
11 0.39
12 0.37
13 0.32
14 0.29
15 0.27
16 0.24
17 0.21
18 0.18
19 0.18
20 0.19
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.26
25 0.32
26 0.32
27 0.32
28 0.37
29 0.43
30 0.45
31 0.47
32 0.51
33 0.52
34 0.55
35 0.61
36 0.61
37 0.59
38 0.6
39 0.57
40 0.49
41 0.42
42 0.39
43 0.31
44 0.23
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.21
58 0.21
59 0.23
60 0.28
61 0.31
62 0.27
63 0.3
64 0.34
65 0.36
66 0.41
67 0.43
68 0.37
69 0.34
70 0.33
71 0.29
72 0.26
73 0.22
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.15
82 0.2
83 0.22
84 0.25
85 0.26
86 0.31
87 0.34
88 0.35
89 0.34
90 0.32
91 0.34
92 0.36
93 0.39
94 0.33
95 0.32
96 0.31
97 0.26
98 0.23
99 0.2
100 0.15
101 0.11
102 0.12
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.03
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.04
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.1
210 0.11
211 0.1
212 0.15
213 0.14
214 0.16
215 0.21
216 0.22
217 0.23
218 0.28
219 0.31
220 0.28
221 0.37
222 0.37
223 0.32
224 0.31
225 0.3
226 0.25
227 0.23
228 0.21
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.2
247 0.21
248 0.21
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.21
253 0.27
254 0.22
255 0.22
256 0.2
257 0.18
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.2
275 0.25
276 0.25
277 0.32
278 0.32
279 0.31
280 0.32
281 0.33
282 0.28
283 0.21
284 0.22
285 0.14
286 0.18
287 0.17
288 0.15
289 0.15
290 0.13
291 0.14
292 0.12
293 0.13
294 0.09
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.1
309 0.1
310 0.12
311 0.2
312 0.29
313 0.36
314 0.4
315 0.44
316 0.53
317 0.6
318 0.63
319 0.65
320 0.64
321 0.64
322 0.67
323 0.68
324 0.63
325 0.56
326 0.52
327 0.43
328 0.34
329 0.26
330 0.19
331 0.11
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.11
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.16
348 0.18
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.11
361 0.16
362 0.17
363 0.2
364 0.22
365 0.25
366 0.32
367 0.38
368 0.43
369 0.48
370 0.58
371 0.64
372 0.74
373 0.81
374 0.81
375 0.86
376 0.89
377 0.9
378 0.84
379 0.82
380 0.79
381 0.77
382 0.8
383 0.76
384 0.71
385 0.63
386 0.62
387 0.55
388 0.5
389 0.45
390 0.36
391 0.32
392 0.3
393 0.34
394 0.34
395 0.37
396 0.43
397 0.5
398 0.58
399 0.6
400 0.66
401 0.68
402 0.7
403 0.74
404 0.74
405 0.69
406 0.69
407 0.68
408 0.69
409 0.67
410 0.63
411 0.57
412 0.56
413 0.54
414 0.54
415 0.56
416 0.51
417 0.53
418 0.56
419 0.6