Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3NXR3

Protein Details
Accession J3NXR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-125DERISKGKGKKRNGIPRRPVPCLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-120SKGKGKKRNGIPRR
332-340KVKRRKVKS
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MTNSAATNGMATNSKPIPALYTVYILRSTIRRASFYIGSTPNPPRRLKQHNGHAPGGAAKTSRAKLRPWEMIGLVSGFPSMVAALKFEWALTNPHMTLHIPADERISKGKGKKRNGIPRRPVPCLASIISNVDILLRVPSFARWPLKLHCFAPEVYRAWSKNLVSSSAAPGEGNLEVVTDFGPTPGSGNTTTATAAKTPILEDDVTGSGEEEEAIASPWGIHALPLDYSSLKAYVAKGRSVFEFEREGNCVVCKEPQEPGKGLLAICTNEGCEGVGHISCWSRHILGTQGDAEVLPVQGSCPRCQGPVKWCDMMKELTLRTRASADVDKLLKVKRRKVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.24
7 0.19
8 0.22
9 0.22
10 0.23
11 0.24
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.24
16 0.26
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.36
21 0.36
22 0.35
23 0.38
24 0.34
25 0.33
26 0.38
27 0.45
28 0.47
29 0.5
30 0.52
31 0.51
32 0.57
33 0.64
34 0.67
35 0.68
36 0.71
37 0.74
38 0.78
39 0.73
40 0.64
41 0.56
42 0.5
43 0.41
44 0.31
45 0.22
46 0.18
47 0.22
48 0.24
49 0.3
50 0.29
51 0.31
52 0.38
53 0.46
54 0.5
55 0.47
56 0.47
57 0.41
58 0.39
59 0.36
60 0.29
61 0.22
62 0.14
63 0.11
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.15
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.15
86 0.17
87 0.15
88 0.15
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.21
93 0.22
94 0.23
95 0.3
96 0.37
97 0.42
98 0.48
99 0.56
100 0.64
101 0.72
102 0.77
103 0.8
104 0.82
105 0.83
106 0.81
107 0.77
108 0.69
109 0.6
110 0.53
111 0.45
112 0.36
113 0.28
114 0.23
115 0.2
116 0.18
117 0.15
118 0.13
119 0.09
120 0.09
121 0.07
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.08
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.19
132 0.23
133 0.28
134 0.3
135 0.29
136 0.28
137 0.27
138 0.26
139 0.25
140 0.25
141 0.21
142 0.21
143 0.24
144 0.21
145 0.22
146 0.25
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.2
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.14
155 0.14
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.16
222 0.17
223 0.2
224 0.2
225 0.21
226 0.22
227 0.26
228 0.25
229 0.21
230 0.24
231 0.22
232 0.23
233 0.24
234 0.24
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.15
239 0.17
240 0.17
241 0.16
242 0.21
243 0.25
244 0.29
245 0.3
246 0.31
247 0.31
248 0.3
249 0.28
250 0.25
251 0.23
252 0.19
253 0.18
254 0.16
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.15
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.2
273 0.2
274 0.23
275 0.22
276 0.2
277 0.19
278 0.18
279 0.17
280 0.13
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.11
286 0.14
287 0.15
288 0.2
289 0.22
290 0.25
291 0.3
292 0.36
293 0.41
294 0.47
295 0.51
296 0.51
297 0.51
298 0.5
299 0.5
300 0.46
301 0.4
302 0.38
303 0.35
304 0.36
305 0.39
306 0.37
307 0.35
308 0.34
309 0.31
310 0.3
311 0.33
312 0.3
313 0.34
314 0.35
315 0.35
316 0.38
317 0.43
318 0.46
319 0.48
320 0.55