Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1FYQ8

Protein Details
Accession A0A2I1FYQ8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
415-439GYDQGYRRQNKQDDRQDRRENSRYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
307-323RARGRSSRGRGFSRGIR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034870  TET_fam  
IPR001876  Znf_RanBP2  
IPR036443  Znf_RanBP2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
PS50199  ZF_RANBP2_2  
Amino Acid Sequences MDQYSNYGGQQDPSSGNYNSSYQYNDSYNQGGYTAPTSSSDYYYSGSNPQTGGNNSSSSSSTQQPPVTPATTQGYTSQRNDNYEGSGYSSGYNSYGNYPTSTASGSYQTGQNSPSGSSTATPYNSAGGSGSYNGASKTGYTDRGSDYGDSSSYGGNKNPYGDSYSYKPRENSRESGYSGPPTKEDSYDNYGNRSESGYKDNYAGDSVVQTISDTIYISNLSKDVTEEKLAEKFGSLGMLKIDRKTQKPKIWIYYDKVTRLPKGDATLTYEDPDSTAAAIKYFDNQKFLDQIIKVEMSVRKVPISGFRARGRSSRGRGFSRGIRGSGSGGGPPPRDGDWACESCNANNFARRMECYKCHVPRSNAPGDGGYSGGRYSGAPRGGYRGRRGGPSYGRYADDDRGYGSGSYRNSDSSHGYDQGYRRQNKQDDRQDRRENSRYLPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.26
4 0.26
5 0.27
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.23
10 0.26
11 0.27
12 0.27
13 0.28
14 0.28
15 0.27
16 0.24
17 0.22
18 0.18
19 0.16
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.17
25 0.18
26 0.2
27 0.2
28 0.2
29 0.2
30 0.21
31 0.2
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.22
37 0.26
38 0.27
39 0.29
40 0.26
41 0.25
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.3
50 0.32
51 0.31
52 0.34
53 0.35
54 0.34
55 0.29
56 0.29
57 0.29
58 0.27
59 0.27
60 0.29
61 0.31
62 0.34
63 0.37
64 0.42
65 0.39
66 0.42
67 0.44
68 0.4
69 0.36
70 0.33
71 0.3
72 0.25
73 0.23
74 0.2
75 0.17
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.13
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.16
100 0.16
101 0.15
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.14
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.16
112 0.15
113 0.12
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.11
125 0.13
126 0.16
127 0.17
128 0.19
129 0.2
130 0.22
131 0.23
132 0.2
133 0.18
134 0.15
135 0.14
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.16
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.19
150 0.21
151 0.3
152 0.32
153 0.34
154 0.36
155 0.39
156 0.45
157 0.47
158 0.47
159 0.43
160 0.44
161 0.43
162 0.45
163 0.4
164 0.36
165 0.34
166 0.31
167 0.26
168 0.26
169 0.25
170 0.23
171 0.22
172 0.22
173 0.26
174 0.31
175 0.3
176 0.28
177 0.28
178 0.27
179 0.25
180 0.23
181 0.18
182 0.14
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.18
188 0.16
189 0.15
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.07
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.18
229 0.21
230 0.26
231 0.35
232 0.43
233 0.45
234 0.52
235 0.57
236 0.59
237 0.61
238 0.62
239 0.58
240 0.58
241 0.55
242 0.5
243 0.49
244 0.44
245 0.39
246 0.37
247 0.34
248 0.27
249 0.26
250 0.25
251 0.21
252 0.24
253 0.25
254 0.22
255 0.21
256 0.2
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.09
261 0.06
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.12
268 0.18
269 0.19
270 0.2
271 0.21
272 0.22
273 0.23
274 0.23
275 0.24
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.17
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.19
284 0.21
285 0.21
286 0.19
287 0.19
288 0.2
289 0.23
290 0.27
291 0.28
292 0.31
293 0.34
294 0.39
295 0.4
296 0.43
297 0.43
298 0.47
299 0.49
300 0.51
301 0.53
302 0.53
303 0.55
304 0.55
305 0.54
306 0.54
307 0.5
308 0.43
309 0.37
310 0.34
311 0.31
312 0.29
313 0.24
314 0.16
315 0.16
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.19
320 0.17
321 0.19
322 0.18
323 0.21
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.29
328 0.3
329 0.29
330 0.33
331 0.32
332 0.27
333 0.3
334 0.3
335 0.29
336 0.3
337 0.32
338 0.31
339 0.33
340 0.35
341 0.37
342 0.47
343 0.5
344 0.56
345 0.61
346 0.63
347 0.65
348 0.69
349 0.68
350 0.6
351 0.54
352 0.47
353 0.4
354 0.34
355 0.27
356 0.19
357 0.13
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.11
363 0.16
364 0.19
365 0.2
366 0.21
367 0.28
368 0.35
369 0.4
370 0.44
371 0.46
372 0.46
373 0.51
374 0.54
375 0.54
376 0.56
377 0.55
378 0.55
379 0.5
380 0.49
381 0.46
382 0.46
383 0.43
384 0.37
385 0.33
386 0.27
387 0.24
388 0.24
389 0.21
390 0.19
391 0.19
392 0.18
393 0.21
394 0.2
395 0.22
396 0.22
397 0.25
398 0.28
399 0.28
400 0.32
401 0.32
402 0.32
403 0.36
404 0.39
405 0.45
406 0.5
407 0.5
408 0.52
409 0.58
410 0.66
411 0.7
412 0.77
413 0.78
414 0.79
415 0.84
416 0.88
417 0.89
418 0.88
419 0.87
420 0.85
421 0.79