Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PFA0

Protein Details
Accession J3PFA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-121EASGPKAKRRKLDHPEKAGEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-43RGRFAPRGGSRGRGSSRGRGGGRGGRGGRGGSKNLMGKRR
106-111KAKRRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR010678  UTP25  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF06862  UTP25  
Amino Acid Sequences MGPRGRFAPRGGSRGRGSSRGRGGGRGGRGGRGGSKNLMGKRRFDSSRVEEKKEDSDDESSQDEPPSEDEESGVGSNSEGEEEEDKTVARPYVALLRSLTEASGPKAKRRKLDHPEKAGEPSSEDEGKDVDVVEETEEVEEDDDEVSDSNDEDTQDGSDPFASHFAAPDEAAVTTRLAAMAKNEWVTKKVATKPSRIIIMAPKTSSDAQATALPSVRDPSALTLKPKLKEAITTQRPEFDASEQALAAPLFQYLDTLYCQRTVANGDSLRRLVCLHALNHIFKTRDRVIKNSAKLAREDANPDLELRDQGFTRPKVLMLLPTRQSCAKMVDMIYSLADVDQQENRKRFNDSYVEKEGFKDDKPADFKDLFDGNSDDMFRLGVKFTRKTIKYFSQFYSSDILIASPLGLRMAIGSTEEKNLDYDFLSSIEMVIVDQADAILMQNWEHVEYIFEHMNLQPKDAHGCDFSRVRSWYLDGQAKHFRQNVVLSAFNTPELSELLHSHCHNWAGRARVQPEYQGLIQQLGGVVPHARQTFSRFDAPSIAAEPDARFEYFTKAVVPALARRAASRDASAGGTLVFVPSYMDFVRVRNYFAADPAAASLSFGAVSDHSGVAETSRARSHFLTGRHRVLLYTERAHHFWRHRIRGVRRVVMYGLPDNPAFYREVAGGYLGRSEQDGIIGSGQGTVRVLFSRYDVMKLERVVGTQRVGKMLTEKGDTFDFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.55
4 0.54
5 0.55
6 0.6
7 0.61
8 0.59
9 0.54
10 0.56
11 0.54
12 0.53
13 0.52
14 0.46
15 0.41
16 0.41
17 0.4
18 0.41
19 0.39
20 0.38
21 0.33
22 0.37
23 0.41
24 0.46
25 0.53
26 0.49
27 0.5
28 0.51
29 0.56
30 0.53
31 0.49
32 0.52
33 0.51
34 0.6
35 0.61
36 0.62
37 0.57
38 0.57
39 0.62
40 0.56
41 0.51
42 0.43
43 0.41
44 0.37
45 0.36
46 0.35
47 0.28
48 0.26
49 0.24
50 0.21
51 0.17
52 0.18
53 0.19
54 0.18
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.16
59 0.15
60 0.13
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.07
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.16
75 0.15
76 0.13
77 0.11
78 0.12
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.23
86 0.21
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.25
91 0.25
92 0.32
93 0.4
94 0.45
95 0.51
96 0.58
97 0.66
98 0.68
99 0.78
100 0.8
101 0.8
102 0.81
103 0.75
104 0.72
105 0.64
106 0.54
107 0.45
108 0.37
109 0.32
110 0.28
111 0.25
112 0.21
113 0.18
114 0.18
115 0.16
116 0.13
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.11
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.27
176 0.32
177 0.4
178 0.42
179 0.47
180 0.51
181 0.53
182 0.53
183 0.46
184 0.41
185 0.39
186 0.42
187 0.38
188 0.33
189 0.3
190 0.29
191 0.3
192 0.29
193 0.22
194 0.15
195 0.14
196 0.17
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.14
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.18
208 0.21
209 0.23
210 0.29
211 0.34
212 0.35
213 0.37
214 0.36
215 0.3
216 0.32
217 0.36
218 0.39
219 0.41
220 0.44
221 0.42
222 0.43
223 0.43
224 0.4
225 0.35
226 0.26
227 0.23
228 0.19
229 0.19
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.13
250 0.14
251 0.18
252 0.2
253 0.2
254 0.22
255 0.23
256 0.22
257 0.19
258 0.18
259 0.12
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.2
264 0.23
265 0.24
266 0.25
267 0.28
268 0.25
269 0.22
270 0.28
271 0.28
272 0.33
273 0.33
274 0.36
275 0.41
276 0.47
277 0.49
278 0.5
279 0.49
280 0.43
281 0.42
282 0.41
283 0.37
284 0.31
285 0.31
286 0.24
287 0.22
288 0.21
289 0.2
290 0.18
291 0.14
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.09
296 0.11
297 0.17
298 0.17
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.22
305 0.19
306 0.24
307 0.26
308 0.27
309 0.28
310 0.27
311 0.27
312 0.22
313 0.22
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.13
320 0.12
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.05
326 0.06
327 0.09
328 0.13
329 0.19
330 0.21
331 0.23
332 0.23
333 0.27
334 0.26
335 0.28
336 0.32
337 0.29
338 0.34
339 0.37
340 0.37
341 0.34
342 0.34
343 0.32
344 0.26
345 0.23
346 0.22
347 0.18
348 0.21
349 0.24
350 0.25
351 0.26
352 0.25
353 0.25
354 0.23
355 0.23
356 0.18
357 0.17
358 0.16
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.08
369 0.12
370 0.13
371 0.16
372 0.25
373 0.26
374 0.29
375 0.34
376 0.39
377 0.41
378 0.44
379 0.43
380 0.41
381 0.4
382 0.38
383 0.35
384 0.27
385 0.22
386 0.17
387 0.15
388 0.09
389 0.08
390 0.07
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.03
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.07
414 0.07
415 0.06
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.03
420 0.03
421 0.03
422 0.03
423 0.02
424 0.03
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.07
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.12
441 0.2
442 0.19
443 0.19
444 0.17
445 0.17
446 0.2
447 0.2
448 0.2
449 0.14
450 0.15
451 0.18
452 0.2
453 0.2
454 0.22
455 0.23
456 0.23
457 0.22
458 0.24
459 0.24
460 0.27
461 0.32
462 0.27
463 0.31
464 0.38
465 0.39
466 0.42
467 0.4
468 0.35
469 0.32
470 0.33
471 0.32
472 0.26
473 0.27
474 0.23
475 0.22
476 0.22
477 0.19
478 0.17
479 0.13
480 0.11
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.11
486 0.15
487 0.15
488 0.16
489 0.17
490 0.2
491 0.2
492 0.22
493 0.24
494 0.25
495 0.29
496 0.34
497 0.35
498 0.36
499 0.36
500 0.35
501 0.33
502 0.32
503 0.27
504 0.24
505 0.21
506 0.17
507 0.17
508 0.14
509 0.12
510 0.08
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.11
516 0.11
517 0.12
518 0.13
519 0.18
520 0.22
521 0.26
522 0.32
523 0.28
524 0.28
525 0.31
526 0.31
527 0.27
528 0.24
529 0.2
530 0.14
531 0.15
532 0.14
533 0.13
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.13
538 0.17
539 0.17
540 0.17
541 0.16
542 0.15
543 0.15
544 0.16
545 0.17
546 0.15
547 0.19
548 0.21
549 0.2
550 0.2
551 0.23
552 0.25
553 0.25
554 0.22
555 0.2
556 0.18
557 0.19
558 0.18
559 0.15
560 0.11
561 0.1
562 0.09
563 0.07
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.05
568 0.08
569 0.08
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.21
574 0.21
575 0.23
576 0.22
577 0.25
578 0.22
579 0.23
580 0.24
581 0.17
582 0.17
583 0.15
584 0.15
585 0.11
586 0.11
587 0.09
588 0.07
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.05
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.08
599 0.08
600 0.12
601 0.11
602 0.12
603 0.16
604 0.17
605 0.2
606 0.21
607 0.26
608 0.28
609 0.35
610 0.43
611 0.47
612 0.51
613 0.51
614 0.5
615 0.44
616 0.43
617 0.42
618 0.38
619 0.37
620 0.38
621 0.39
622 0.41
623 0.44
624 0.48
625 0.48
626 0.52
627 0.56
628 0.59
629 0.63
630 0.7
631 0.75
632 0.77
633 0.79
634 0.77
635 0.68
636 0.63
637 0.57
638 0.5
639 0.45
640 0.4
641 0.33
642 0.28
643 0.26
644 0.24
645 0.23
646 0.22
647 0.19
648 0.15
649 0.15
650 0.13
651 0.14
652 0.13
653 0.14
654 0.13
655 0.12
656 0.14
657 0.12
658 0.11
659 0.11
660 0.12
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.13
669 0.13
670 0.12
671 0.11
672 0.11
673 0.11
674 0.12
675 0.14
676 0.11
677 0.13
678 0.2
679 0.21
680 0.24
681 0.25
682 0.28
683 0.32
684 0.32
685 0.35
686 0.28
687 0.29
688 0.3
689 0.31
690 0.31
691 0.31
692 0.32
693 0.31
694 0.3
695 0.3
696 0.3
697 0.32
698 0.32
699 0.31
700 0.3
701 0.3