Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R667

Protein Details
Accession C4R667    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MIRTIKPKTARAKRELGKRDPKIVEHydrophilic
47-70VDLSSLKKPNMKRFNKKNDILPFEHydrophilic
283-304LSKLQTRKMKGLKKRYDQVEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-19PKTARAKRELGKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG ppa:PAS_chr3_0991  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTIKPKTARAKRELGKRDPKIVENVKNALFVPGKSSNKVLHDVVVDLSSLKKPNMKRFNKKNDILPFEDPSSLEFFSEKNDSSLLVLSSHNKKRPNTLTWIRTFNYKLYDMIELSILNNYKLLNEFKQSRVDVGMKPMFVFNGPIFDSHPVYQHLKSLFLDFYRGEETNLLDLKGLQHVISISAGEIDDVEESISKLPLVHFRVYRLKTYKSPEPKLPRVELDEVGPRLTFKVGRYQSPDPEVEKEALTQPKQQQPKVKKNVQTDIIGDKVAQVHVGSQDLSKLQTRKMKGLKKRYDQVEVDNGDEDFGSNKKAKTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.82
4 0.82
5 0.78
6 0.81
7 0.75
8 0.71
9 0.7
10 0.7
11 0.68
12 0.63
13 0.62
14 0.54
15 0.51
16 0.48
17 0.43
18 0.36
19 0.27
20 0.28
21 0.31
22 0.33
23 0.33
24 0.37
25 0.36
26 0.37
27 0.42
28 0.36
29 0.3
30 0.27
31 0.26
32 0.24
33 0.2
34 0.16
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.15
39 0.15
40 0.2
41 0.26
42 0.37
43 0.48
44 0.56
45 0.64
46 0.73
47 0.83
48 0.87
49 0.85
50 0.83
51 0.81
52 0.77
53 0.71
54 0.65
55 0.57
56 0.49
57 0.45
58 0.36
59 0.29
60 0.26
61 0.2
62 0.16
63 0.13
64 0.11
65 0.14
66 0.17
67 0.16
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.15
77 0.24
78 0.3
79 0.35
80 0.4
81 0.4
82 0.48
83 0.54
84 0.54
85 0.54
86 0.57
87 0.59
88 0.58
89 0.62
90 0.53
91 0.51
92 0.48
93 0.4
94 0.35
95 0.29
96 0.25
97 0.21
98 0.23
99 0.18
100 0.17
101 0.15
102 0.11
103 0.1
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.11
111 0.13
112 0.12
113 0.17
114 0.2
115 0.21
116 0.26
117 0.26
118 0.24
119 0.25
120 0.26
121 0.22
122 0.26
123 0.25
124 0.2
125 0.2
126 0.19
127 0.16
128 0.14
129 0.15
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.16
141 0.16
142 0.19
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.18
147 0.15
148 0.13
149 0.14
150 0.11
151 0.12
152 0.13
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.13
188 0.16
189 0.2
190 0.2
191 0.25
192 0.34
193 0.35
194 0.41
195 0.4
196 0.4
197 0.42
198 0.48
199 0.52
200 0.53
201 0.56
202 0.58
203 0.63
204 0.66
205 0.66
206 0.63
207 0.57
208 0.52
209 0.51
210 0.42
211 0.36
212 0.34
213 0.29
214 0.27
215 0.24
216 0.18
217 0.16
218 0.17
219 0.16
220 0.11
221 0.21
222 0.23
223 0.28
224 0.34
225 0.38
226 0.41
227 0.43
228 0.44
229 0.37
230 0.38
231 0.36
232 0.3
233 0.26
234 0.23
235 0.25
236 0.29
237 0.28
238 0.32
239 0.37
240 0.43
241 0.5
242 0.54
243 0.57
244 0.61
245 0.71
246 0.74
247 0.75
248 0.75
249 0.76
250 0.8
251 0.74
252 0.67
253 0.59
254 0.53
255 0.46
256 0.38
257 0.3
258 0.23
259 0.2
260 0.17
261 0.14
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.16
271 0.2
272 0.21
273 0.26
274 0.33
275 0.37
276 0.45
277 0.53
278 0.61
279 0.65
280 0.74
281 0.78
282 0.8
283 0.85
284 0.82
285 0.81
286 0.75
287 0.71
288 0.7
289 0.61
290 0.53
291 0.45
292 0.39
293 0.3
294 0.27
295 0.2
296 0.13
297 0.12
298 0.15
299 0.17