Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J3PDA2

Protein Details
Accession J3PDA2    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-309EEEKPAPAAKRPRGRPKKSEAAAKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-164AKKAPAKRGRKKA
177-186PAKKQARGSR
204-208AKKKA
230-247KPVKKQARGPRKSKASAA
261-337EAKTSKRKRGAAAKKEPESEAEQEEEEKPAPAAKRPRGRPKKSEAAAKPAEVEADEPEPAPKRGRKAKATAVAPEPK
345-378EPKVEAPKRGRKAKAAAAPAAAAPKRAGRPRKST
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR001510  Znf_PARP  
IPR036957  Znf_PARP_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00645  zf-PARP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSSSYRIELSPNNRAGCQDTVCKKSGDKIKKGELRFGTWVTVANTDHASWKYKHWGCVSGYQIEHVRESIDQDGSYNWELIDGYDELNDHPDIQAKIRRVVEQGHIDPEDFNGDPEFNVLGSRGIRGRKKVQKLKEAVEDEEADEDEEAAPAKKAPAKRGRKKAAVAVEDDEEESKPAKKQARGSRKSNVSAAAEDDEEDAKPAKKKATASRKSNASAAAASTDDDEVAKPVKKQARGPRKSKASAAAKDTDEEEAAPAAEAKTSKRKRGAAAKKEPESEAEQEEEEKPAPAAKRPRGRPKKSEAAAKPAEVEADEPEPAPKRGRKAKATAVAPEPKSDEAEESEPKVEAPKRGRKAKAAAAPAAAAPKRAGRPRKST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.45
3 0.42
4 0.39
5 0.38
6 0.4
7 0.43
8 0.44
9 0.44
10 0.41
11 0.45
12 0.51
13 0.52
14 0.53
15 0.57
16 0.65
17 0.71
18 0.72
19 0.73
20 0.67
21 0.63
22 0.59
23 0.52
24 0.44
25 0.36
26 0.37
27 0.3
28 0.29
29 0.24
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.23
34 0.22
35 0.25
36 0.23
37 0.27
38 0.36
39 0.38
40 0.44
41 0.43
42 0.48
43 0.46
44 0.52
45 0.51
46 0.47
47 0.43
48 0.39
49 0.4
50 0.35
51 0.32
52 0.25
53 0.22
54 0.17
55 0.19
56 0.19
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.18
62 0.18
63 0.16
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.13
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.1
73 0.09
74 0.12
75 0.12
76 0.09
77 0.09
78 0.13
79 0.14
80 0.18
81 0.23
82 0.23
83 0.29
84 0.31
85 0.32
86 0.3
87 0.33
88 0.35
89 0.37
90 0.36
91 0.34
92 0.32
93 0.31
94 0.29
95 0.25
96 0.22
97 0.15
98 0.14
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.12
111 0.18
112 0.22
113 0.27
114 0.37
115 0.44
116 0.54
117 0.61
118 0.66
119 0.69
120 0.71
121 0.71
122 0.69
123 0.63
124 0.54
125 0.48
126 0.41
127 0.31
128 0.26
129 0.21
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.1
141 0.13
142 0.21
143 0.31
144 0.42
145 0.52
146 0.62
147 0.68
148 0.71
149 0.71
150 0.68
151 0.65
152 0.56
153 0.49
154 0.4
155 0.33
156 0.27
157 0.25
158 0.19
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.14
165 0.19
166 0.23
167 0.31
168 0.41
169 0.51
170 0.56
171 0.6
172 0.63
173 0.63
174 0.62
175 0.55
176 0.47
177 0.37
178 0.31
179 0.27
180 0.2
181 0.15
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.17
193 0.22
194 0.32
195 0.42
196 0.49
197 0.53
198 0.58
199 0.6
200 0.59
201 0.55
202 0.47
203 0.37
204 0.28
205 0.21
206 0.16
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.09
218 0.16
219 0.22
220 0.25
221 0.33
222 0.43
223 0.52
224 0.59
225 0.64
226 0.67
227 0.7
228 0.7
229 0.65
230 0.64
231 0.61
232 0.57
233 0.56
234 0.51
235 0.43
236 0.41
237 0.39
238 0.3
239 0.21
240 0.17
241 0.13
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.07
248 0.07
249 0.1
250 0.2
251 0.25
252 0.32
253 0.39
254 0.42
255 0.48
256 0.59
257 0.67
258 0.67
259 0.73
260 0.75
261 0.73
262 0.72
263 0.65
264 0.57
265 0.51
266 0.43
267 0.34
268 0.27
269 0.23
270 0.22
271 0.22
272 0.21
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.15
277 0.16
278 0.21
279 0.3
280 0.36
281 0.46
282 0.55
283 0.66
284 0.73
285 0.81
286 0.82
287 0.82
288 0.84
289 0.79
290 0.8
291 0.73
292 0.72
293 0.66
294 0.59
295 0.51
296 0.41
297 0.36
298 0.26
299 0.22
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.12
304 0.15
305 0.18
306 0.19
307 0.25
308 0.27
309 0.35
310 0.44
311 0.53
312 0.57
313 0.62
314 0.7
315 0.72
316 0.71
317 0.68
318 0.66
319 0.66
320 0.59
321 0.54
322 0.47
323 0.4
324 0.38
325 0.33
326 0.27
327 0.23
328 0.27
329 0.28
330 0.28
331 0.28
332 0.25
333 0.25
334 0.29
335 0.29
336 0.32
337 0.39
338 0.46
339 0.54
340 0.64
341 0.69
342 0.7
343 0.74
344 0.75
345 0.74
346 0.7
347 0.64
348 0.56
349 0.51
350 0.45
351 0.45
352 0.36
353 0.29
354 0.24
355 0.27
356 0.34
357 0.42
358 0.51