FuNGI

A0A2I1GDH7

Protein Details

Accession

A0A2I1GDH7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
73-103	VKTSSNSIKGKTKSKKKKSLLSSNRKKSLES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
81-98	KGKTKSKKKKSLLSSNRK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 11.833, mito 2.5, cyto_mito 2.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MSQTKDNVRMRDRAETEEELLKLQEEFLANKPKAAATVIRKSKPPTVISSSSQFENNNVNVVEKDIVTLDDNVKTSSNSIKGKTKSKKKKSLLSSNRKKSLESDGGAQRFEIDLDQEIENTTEQEEHVPAVKKVLDMHSYQTGAVGMVTEKFATEPVLPPNITNNNDTSSDGGFPKPVHRSLFKRRRQALDEESKSNIDNLQNQQINNENTTKDIKNLPTTTAVSSTSLNTLNKDTKIFNSDYLEIDRENVEKISNMSEEEILKTVEMLRQTLSPKLVEKLSKNKPLVERIPEESNEGFNGTEEKEIKHVHFEENKMNYEEEDDDSLPLKMKEKYFPNVPIEPEKIEWMGVEFKKDESTTTKDQGMVKDYSSPYIPKSSDPPAAFYRFDFHGNIMEKDADVPTYMGLHHHGDNPDQAGYTSSELLHLSRSRVSSQRIIPLNVIGRIMRKVRKGHYGIEKCKGITEWMIKMKLPIYLRTALDDTAESVIVAAVDAISALIIGGTEGLDVEEEIWDRSGRLYRGYESVALQDVPETKVKKHFGMDIALQDENEEDVNTTEYHVRLASKDLIAGLISMDILYRFRYLLEKLRLPYITNEQIILMLIRFARHSHKSAMFIFECPQLVDVIHKKFLCVAWPVIYNNGDDALSQFPSLSAVKLFRLLCQSSGQSIIQNYIETFLRYIVVNPSTISNEFEMNLGYKILQETLRIYQTLAAHGLYHGILSQAYSVFGGYLSKEIIYSLSPPWQWKGDNIPQMKHKLDIAISFFRLLEIWIRTSKKDTGTDVESGAQPSEFINDSVELLDKFVSSFPFEIDNKIENSREFEKALILISSIARYIASWYQYLGGYPLKDTSQIKNIWERLKFDSWQSSKIGIYLSNRLPACLNAYYVSKKDIWQLSNLPGAYYPITFEHISKSITMSVLYDLYLSYISLIHQISNLFSGDKEFSINSLSVITTFVPIDLIKNHIIKFPPKRNWLDFFDRTRTYLLYEWMCAISSLIDKIGDDKFQSQYSKKLLQVALIIMSHLLPGDENISLNILNRIFDGITALSPDPKRAEEIKKSLRFFYKNRIITSNTKEEIYSFSGQQEEDPTLLWNLTRNNSHGGLPLSRAWVWTPIDVLYSKRSDVIMDEEVRFEVVRDCLEFGWEIMETCQDVARSTESFGHKSFAQCIIVPLSTIYPFDFKLLVWGDLFEVLSTINIKYEEVICLNPSFNEGLKSYFWPLENNKALIQSYVNSIIHLKLTSEKTPFLYWIVIHHLNGFVFWNIQEGENQDEIKKDHGKVQMRIDIAKAIVKGAKSDIVKDWIRYTEKNFGDDVKELMKMPQCFKDIDDLKLKSRLEWLNNVNINIDENLIY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.5
3	0.49
4	0.47
5	0.43
6	0.35
7	0.32
8	0.27
9	0.21
10	0.17
11	0.17
12	0.14
13	0.16
14	0.22
15	0.32
16	0.31
17	0.32
18	0.33
19	0.3
20	0.3
21	0.3
22	0.32
23	0.3
24	0.41
25	0.48
26	0.51
27	0.55
28	0.59
29	0.63
30	0.63
31	0.58
32	0.55
33	0.55
34	0.56
35	0.56
36	0.57
37	0.52
38	0.47
39	0.46
40	0.39
41	0.34
42	0.35
43	0.31
44	0.3
45	0.27
46	0.27
47	0.23
48	0.25
49	0.24
50	0.17
51	0.17
52	0.13
53	0.14
54	0.14
55	0.17
56	0.17
57	0.19
58	0.2
59	0.2
60	0.21
61	0.2
62	0.2
63	0.24
64	0.29
65	0.3
66	0.34
67	0.42
68	0.48
69	0.58
70	0.66
71	0.71
72	0.74
73	0.81
74	0.87
75	0.87
76	0.9
77	0.9
78	0.91
79	0.91
80	0.91
81	0.92
82	0.91
83	0.91
84	0.82
85	0.73
86	0.65
87	0.64
88	0.61
89	0.52
90	0.49
91	0.49
92	0.5
93	0.48
94	0.44
95	0.35
96	0.27
97	0.26
98	0.18
99	0.11
100	0.12
101	0.14
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.15
106	0.14
107	0.13
108	0.11
109	0.09
110	0.1
111	0.12
112	0.12
113	0.12
114	0.18
115	0.21
116	0.2
117	0.23
118	0.24
119	0.22
120	0.26
121	0.29
122	0.27
123	0.25
124	0.29
125	0.31
126	0.3
127	0.29
128	0.26
129	0.21
130	0.17
131	0.16
132	0.12
133	0.07
134	0.08
135	0.09
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.1
141	0.11
142	0.13
143	0.17
144	0.23
145	0.23
146	0.23
147	0.3
148	0.35
149	0.36
150	0.34
151	0.32
152	0.3
153	0.32
154	0.32
155	0.27
156	0.21
157	0.21
158	0.21
159	0.2
160	0.19
161	0.18
162	0.24
163	0.27
164	0.3
165	0.33
166	0.38
167	0.46
168	0.55
169	0.65
170	0.67
171	0.72
172	0.75
173	0.78
174	0.76
175	0.76
176	0.75
177	0.75
178	0.72
179	0.64
180	0.59
181	0.52
182	0.47
183	0.4
184	0.33
185	0.26
186	0.27
187	0.29
188	0.35
189	0.38
190	0.37
191	0.39
192	0.42
193	0.41
194	0.38
195	0.36
196	0.27
197	0.26
198	0.32
199	0.3
200	0.26
201	0.3
202	0.31
203	0.36
204	0.37
205	0.37
206	0.36
207	0.37
208	0.36
209	0.32
210	0.29
211	0.22
212	0.22
213	0.2
214	0.18
215	0.21
216	0.2
217	0.2
218	0.24
219	0.27
220	0.27
221	0.29
222	0.28
223	0.27
224	0.32
225	0.31
226	0.3
227	0.3
228	0.3
229	0.3
230	0.31
231	0.29
232	0.23
233	0.23
234	0.21
235	0.17
236	0.16
237	0.14
238	0.12
239	0.11
240	0.13
241	0.14
242	0.14
243	0.14
244	0.14
245	0.15
246	0.16
247	0.16
248	0.16
249	0.13
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.12
257	0.15
258	0.17
259	0.2
260	0.21
261	0.2
262	0.22
263	0.24
264	0.27
265	0.29
266	0.33
267	0.39
268	0.47
269	0.54
270	0.54
271	0.57
272	0.57
273	0.61
274	0.61
275	0.58
276	0.53
277	0.49
278	0.52
279	0.46
280	0.45
281	0.37
282	0.32
283	0.25
284	0.22
285	0.17
286	0.13
287	0.14
288	0.11
289	0.14
290	0.14
291	0.14
292	0.18
293	0.2
294	0.21
295	0.25
296	0.26
297	0.29
298	0.34
299	0.36
300	0.4
301	0.42
302	0.45
303	0.4
304	0.38
305	0.31
306	0.28
307	0.26
308	0.2
309	0.19
310	0.16
311	0.15
312	0.16
313	0.16
314	0.16
315	0.15
316	0.16
317	0.17
318	0.2
319	0.26
320	0.3
321	0.35
322	0.39
323	0.44
324	0.47
325	0.46
326	0.47
327	0.46
328	0.43
329	0.4
330	0.35
331	0.3
332	0.25
333	0.21
334	0.18
335	0.14
336	0.19
337	0.18
338	0.19
339	0.18
340	0.18
341	0.21
342	0.21
343	0.21
344	0.19
345	0.25
346	0.27
347	0.3
348	0.31
349	0.32
350	0.35
351	0.35
352	0.35
353	0.3
354	0.25
355	0.28
356	0.27
357	0.25
358	0.24
359	0.23
360	0.2
361	0.24
362	0.24
363	0.2
364	0.24
365	0.27
366	0.33
367	0.32
368	0.34
369	0.34
370	0.36
371	0.35
372	0.31
373	0.3
374	0.24
375	0.26
376	0.22
377	0.18
378	0.22
379	0.23
380	0.24
381	0.21
382	0.2
383	0.18
384	0.18
385	0.17
386	0.11
387	0.09
388	0.08
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.09
394	0.11
395	0.12
396	0.16
397	0.17
398	0.17
399	0.18
400	0.19
401	0.17
402	0.15
403	0.14
404	0.11
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.13
413	0.13
414	0.13
415	0.16
416	0.17
417	0.19
418	0.24
419	0.28
420	0.3
421	0.32
422	0.38
423	0.38
424	0.38
425	0.35
426	0.34
427	0.32
428	0.27
429	0.25
430	0.18
431	0.16
432	0.19
433	0.23
434	0.24
435	0.28
436	0.32
437	0.36
438	0.44
439	0.45
440	0.49
441	0.54
442	0.59
443	0.59
444	0.6
445	0.58
446	0.48
447	0.47
448	0.4
449	0.3
450	0.26
451	0.24
452	0.24
453	0.27
454	0.28
455	0.27
456	0.27
457	0.27
458	0.26
459	0.24
460	0.21
461	0.2
462	0.24
463	0.24
464	0.25
465	0.25
466	0.21
467	0.2
468	0.17
469	0.14
470	0.1
471	0.1
472	0.07
473	0.06
474	0.06
475	0.05
476	0.05
477	0.03
478	0.02
479	0.02
480	0.02
481	0.02
482	0.02
483	0.02
484	0.02
485	0.02
486	0.02
487	0.02
488	0.02
489	0.02
490	0.02
491	0.02
492	0.02
493	0.02
494	0.03
495	0.03
496	0.03
497	0.04
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.07
503	0.11
504	0.11
505	0.14
506	0.15
507	0.16
508	0.19
509	0.2
510	0.2
511	0.16
512	0.17
513	0.15
514	0.13
515	0.11
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.14
520	0.15
521	0.15
522	0.22
523	0.25
524	0.25
525	0.26
526	0.27
527	0.25
528	0.27
529	0.27
530	0.22
531	0.22
532	0.2
533	0.19
534	0.15
535	0.13
536	0.1
537	0.09
538	0.06
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.06
543	0.07
544	0.08
545	0.08
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.12
551	0.13
552	0.11
553	0.12
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.09
558	0.06
559	0.04
560	0.04
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.04
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.08
570	0.1
571	0.18
572	0.23
573	0.25
574	0.26
575	0.3
576	0.3
577	0.29
578	0.29
579	0.27
580	0.26
581	0.23
582	0.22
583	0.18
584	0.18
585	0.17
586	0.14
587	0.08
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.07
593	0.12
594	0.15
595	0.18
596	0.21
597	0.23
598	0.27
599	0.27
600	0.31
601	0.27
602	0.25
603	0.24
604	0.21
605	0.19
606	0.15
607	0.14
608	0.09
609	0.09
610	0.11
611	0.14
612	0.15
613	0.18
614	0.18
615	0.18
616	0.19
617	0.19
618	0.18
619	0.16
620	0.15
621	0.13
622	0.15
623	0.15
624	0.16
625	0.16
626	0.14
627	0.12
628	0.11
629	0.09
630	0.07
631	0.08
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.06
637	0.08
638	0.08
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.16
647	0.16
648	0.17
649	0.18
650	0.18
651	0.14
652	0.16
653	0.15
654	0.12
655	0.12
656	0.12
657	0.11
658	0.1
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.08
663	0.08
664	0.06
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.11
674	0.11
675	0.12
676	0.1
677	0.09
678	0.09
679	0.09
680	0.09
681	0.08
682	0.08
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.11
695	0.13
696	0.13
697	0.14
698	0.12
699	0.1
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.06
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.07
726	0.07
727	0.11
728	0.12
729	0.13
730	0.14
731	0.16
732	0.16
733	0.16
734	0.23
735	0.26
736	0.33
737	0.34
738	0.35
739	0.37
740	0.41
741	0.4
742	0.34
743	0.27
744	0.22
745	0.2
746	0.2
747	0.2
748	0.17
749	0.17
750	0.16
751	0.16
752	0.14
753	0.13
754	0.11
755	0.1
756	0.09
757	0.11
758	0.15
759	0.17
760	0.17
761	0.21
762	0.24
763	0.24
764	0.26
765	0.26
766	0.25
767	0.27
768	0.27
769	0.25
770	0.23
771	0.19
772	0.17
773	0.15
774	0.11
775	0.08
776	0.07
777	0.08
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.08
784	0.09
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.08
795	0.12
796	0.13
797	0.14
798	0.16
799	0.17
800	0.18
801	0.19
802	0.2
803	0.15
804	0.2
805	0.21
806	0.21
807	0.19
808	0.18
809	0.16
810	0.16
811	0.16
812	0.11
813	0.08
814	0.07
815	0.07
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.05
820	0.05
821	0.07
822	0.09
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.12
827	0.12
828	0.12
829	0.11
830	0.11
831	0.1
832	0.1
833	0.11
834	0.1
835	0.14
836	0.16
837	0.17
838	0.22
839	0.24
840	0.25
841	0.31
842	0.36
843	0.38
844	0.38
845	0.38
846	0.37
847	0.39
848	0.38
849	0.34
850	0.38
851	0.34
852	0.35
853	0.33
854	0.29
855	0.26
856	0.25
857	0.24
858	0.17
859	0.17
860	0.21
861	0.2
862	0.25
863	0.24
864	0.24
865	0.24
866	0.21
867	0.23
868	0.18
869	0.17
870	0.13
871	0.16
872	0.17
873	0.18
874	0.2
875	0.17
876	0.17
877	0.22
878	0.26
879	0.24
880	0.26
881	0.28
882	0.29
883	0.32
884	0.31
885	0.25
886	0.2
887	0.2
888	0.17
889	0.14
890	0.12
891	0.08
892	0.12
893	0.12
894	0.12
895	0.14
896	0.15
897	0.16
898	0.15
899	0.16
900	0.14
901	0.14
902	0.13
903	0.11
904	0.1
905	0.1
906	0.09
907	0.08
908	0.06
909	0.07
910	0.06
911	0.06
912	0.05
913	0.05
914	0.05
915	0.08
916	0.09
917	0.08
918	0.09
919	0.1
920	0.1
921	0.11
922	0.11
923	0.08
924	0.08
925	0.1
926	0.1
927	0.1
928	0.11
929	0.09
930	0.09
931	0.11
932	0.11
933	0.09
934	0.09
935	0.09
936	0.08
937	0.09
938	0.08
939	0.08
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.07
944	0.08
945	0.08
946	0.11
947	0.14
948	0.17
949	0.17
950	0.2
951	0.23
952	0.29
953	0.38
954	0.45
955	0.5
956	0.55
957	0.61
958	0.63
959	0.66
960	0.65
961	0.64
962	0.61
963	0.58
964	0.57
965	0.52
966	0.48
967	0.43
968	0.37
969	0.31
970	0.26
971	0.25
972	0.2
973	0.19
974	0.19
975	0.18
976	0.17
977	0.14
978	0.12
979	0.09
980	0.08
981	0.08
982	0.08
983	0.07
984	0.07
985	0.1
986	0.11
987	0.11
988	0.12
989	0.14
990	0.16
991	0.2
992	0.24
993	0.23
994	0.28
995	0.33
996	0.37
997	0.36
998	0.4
999	0.37
1000	0.35
1001	0.35
1002	0.3
1003	0.25
1004	0.2
1005	0.18
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.09
1009	0.07
1010	0.06
1011	0.04
1012	0.04
1013	0.06
1014	0.06
1015	0.06
1016	0.06
1017	0.08
1018	0.08
1019	0.09
1020	0.12
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.11
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.15
1033	0.15
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.23
1038	0.27
1039	0.35
1040	0.38
1041	0.47
1042	0.55
1043	0.6
1044	0.62
1045	0.63
1046	0.65
1047	0.63
1048	0.58
1049	0.59
1050	0.59
1051	0.57
1052	0.58
1053	0.56
1054	0.53
1055	0.55
1056	0.59
1057	0.56
1058	0.48
1059	0.43
1060	0.4
1061	0.36
1062	0.35
1063	0.33
1064	0.28
1065	0.2
1066	0.2
1067	0.21
1068	0.21
1069	0.21
1070	0.19
1071	0.15
1072	0.13
1073	0.13
1074	0.13
1075	0.12
1076	0.12
1077	0.11
1078	0.12
1079	0.15
1080	0.19
1081	0.21
1082	0.22
1083	0.25
1084	0.27
1085	0.27
1086	0.28
1087	0.27
1088	0.24
1089	0.25
1090	0.24
1091	0.24
1092	0.22
1093	0.22
1094	0.19
1095	0.22
1096	0.22
1097	0.2
1098	0.19
1099	0.16
1100	0.18
1101	0.18
1102	0.19
1103	0.19
1104	0.19
1105	0.19
1106	0.19
1107	0.19
1108	0.18
1109	0.18
1110	0.22
1111	0.22
1112	0.23
1113	0.24
1114	0.23
1115	0.23
1116	0.23
1117	0.21
1118	0.16
1119	0.13
1120	0.11
1121	0.12
1122	0.12
1123	0.14
1124	0.13
1125	0.15
1126	0.14
1127	0.11
1128	0.12
1129	0.1
1130	0.1
1131	0.09
1132	0.1
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.11
1136	0.09
1137	0.1
1138	0.11
1139	0.14
1140	0.13
1141	0.15
1142	0.21
1143	0.23
1144	0.27
1145	0.27
1146	0.28
1147	0.27
1148	0.29
1149	0.31
1150	0.28
1151	0.26
1152	0.23
1153	0.25
1154	0.25
1155	0.23
1156	0.21
1157	0.18
1158	0.16
1159	0.14
1160	0.15
1161	0.14
1162	0.12
1163	0.13
1164	0.14
1165	0.14
1166	0.12
1167	0.17
1168	0.19
1169	0.19
1170	0.17
1171	0.17
1172	0.16
1173	0.17
1174	0.17
1175	0.1
1176	0.08
1177	0.07
1178	0.07
1179	0.08
1180	0.08
1181	0.09
1182	0.09
1183	0.09
1184	0.11
1185	0.12
1186	0.14
1187	0.15
1188	0.16
1189	0.16
1190	0.17
1191	0.18
1192	0.16
1193	0.17
1194	0.16
1195	0.15
1196	0.17
1197	0.16
1198	0.17
1199	0.19
1200	0.22
1201	0.23
1202	0.25
1203	0.25
1204	0.28
1205	0.31
1206	0.38
1207	0.41
1208	0.41
1209	0.38
1210	0.38
1211	0.37
1212	0.32
1213	0.29
1214	0.21
1215	0.2
1216	0.24
1217	0.22
1218	0.2
1219	0.21
1220	0.21
1221	0.22
1222	0.21
1223	0.18
1224	0.19
1225	0.24
1226	0.28
1227	0.3
1228	0.31
1229	0.32
1230	0.34
1231	0.34
1232	0.29
1233	0.26
1234	0.22
1235	0.22
1236	0.28
1237	0.27
1238	0.26
1239	0.26
1240	0.26
1241	0.23
1242	0.23
1243	0.22
1244	0.14
1245	0.13
1246	0.12
1247	0.14
1248	0.13
1249	0.14
1250	0.15
1251	0.15
1252	0.2
1253	0.21
1254	0.23
1255	0.2
1256	0.23
1257	0.23
1258	0.28
1259	0.32
1260	0.29
1261	0.33
1262	0.41
1263	0.48
1264	0.51
1265	0.59
1266	0.58
1267	0.54
1268	0.54
1269	0.48
1270	0.42
1271	0.35
1272	0.33
1273	0.24
1274	0.21
1275	0.22
1276	0.21
1277	0.21
1278	0.21
1279	0.26
1280	0.23
1281	0.27
1282	0.28
1283	0.32
1284	0.35
1285	0.36
1286	0.38
1287	0.39
1288	0.43
1289	0.43
1290	0.44
1291	0.47
1292	0.46
1293	0.46
1294	0.43
1295	0.39
1296	0.38
1297	0.36
1298	0.33
1299	0.26
1300	0.25
1301	0.24
1302	0.28
1303	0.31
1304	0.32
1305	0.35
1306	0.39
1307	0.39
1308	0.38
1309	0.39
1310	0.44
1311	0.4
1312	0.42
1313	0.46
1314	0.43
1315	0.45
1316	0.52
1317	0.5
1318	0.42
1319	0.47
1320	0.48
1321	0.44
1322	0.5
1323	0.5
1324	0.53
1325	0.56
1326	0.55
1327	0.48
1328	0.41
1329	0.38
1330	0.29

A0A2I1GDH7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer