Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1H9R5

Protein Details
Accession A0A2I1H9R5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-508KSYYKKTDAKIPSQKTHKKKKKRKPLLPKSYDPSIPPDPERWIPKRERSSFKAKGKRKQQLMKGGSQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-499DAKIPSQKTHKKKKKRKPLLPKSYDPSIPPDPERWIPKRERSSFKAKGKRKQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR011716  TPR-3  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF14938  SNAP  
PF08492  SRP72  
PF07720  TPR_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences EEAYCLYRLNKFDELLNLLRKNKSGNNSELNLRHLEAQMAYKTEDYNTSIEIYYALLQEANKNDDVYNDILTNFNAAKAALLFSDGHLDEKYAMTDSLNTYELAYNTACTYIGQKDYKKAEKLFNMAKNICKKSLLSEDYTEDKIEIELGTINTQLGYVYQLQGRISEAIEIYQNILKAKGMDTTVSAIASNNLVAAKKDSELFDSARKLRIASSKHLDTKLFRGQKRVIAMNEALLSLYMHKASKSTSTSYLQKKINKSISDLQEFAKLKPESLHINFALMQLQLITSNPNNALETFEKYLLTIKEDKERYKPGYVGLLVWLYEQSGMHEKAIKTLEDAGTFWKNNSSSSESTLILKQTAAFKIKTGHYQEAAQYYEQLVKVDPLDTQAIAGLVSAYSHYDIEKAEQYESSLPEVNSGEGTVPMDIDVDSIERIVPGVKKSYYKKTDAKIPSQKTHKKKKKRKPLLPKSYDPSIPPDPERWIPKRERSSFKAKGKRKQQLMKGGSQGTAVAGGGIGGTGSANIGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.44
4 0.44
5 0.45
6 0.46
7 0.45
8 0.46
9 0.47
10 0.49
11 0.48
12 0.5
13 0.53
14 0.54
15 0.6
16 0.57
17 0.53
18 0.48
19 0.41
20 0.37
21 0.3
22 0.29
23 0.23
24 0.25
25 0.24
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.2
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.17
38 0.16
39 0.14
40 0.13
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.15
46 0.18
47 0.21
48 0.2
49 0.21
50 0.2
51 0.2
52 0.23
53 0.2
54 0.19
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.14
61 0.12
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.14
72 0.13
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.14
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.15
85 0.15
86 0.14
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.14
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.09
97 0.12
98 0.13
99 0.2
100 0.25
101 0.27
102 0.34
103 0.42
104 0.48
105 0.52
106 0.53
107 0.54
108 0.53
109 0.58
110 0.59
111 0.57
112 0.58
113 0.55
114 0.57
115 0.58
116 0.57
117 0.51
118 0.44
119 0.39
120 0.36
121 0.43
122 0.4
123 0.34
124 0.33
125 0.35
126 0.37
127 0.37
128 0.32
129 0.22
130 0.19
131 0.15
132 0.13
133 0.1
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.11
188 0.13
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.22
193 0.22
194 0.24
195 0.24
196 0.22
197 0.23
198 0.28
199 0.28
200 0.29
201 0.34
202 0.36
203 0.4
204 0.42
205 0.4
206 0.35
207 0.38
208 0.41
209 0.42
210 0.38
211 0.4
212 0.4
213 0.42
214 0.44
215 0.42
216 0.33
217 0.29
218 0.28
219 0.24
220 0.21
221 0.18
222 0.14
223 0.09
224 0.09
225 0.06
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.12
233 0.14
234 0.16
235 0.19
236 0.22
237 0.29
238 0.34
239 0.4
240 0.41
241 0.44
242 0.46
243 0.49
244 0.52
245 0.46
246 0.45
247 0.45
248 0.45
249 0.42
250 0.4
251 0.33
252 0.34
253 0.34
254 0.29
255 0.3
256 0.25
257 0.23
258 0.23
259 0.24
260 0.23
261 0.23
262 0.27
263 0.18
264 0.2
265 0.2
266 0.19
267 0.18
268 0.12
269 0.1
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.12
282 0.12
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.17
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.17
293 0.25
294 0.28
295 0.3
296 0.32
297 0.38
298 0.38
299 0.37
300 0.37
301 0.3
302 0.31
303 0.29
304 0.24
305 0.2
306 0.16
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.07
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.17
318 0.17
319 0.21
320 0.23
321 0.21
322 0.17
323 0.2
324 0.21
325 0.17
326 0.18
327 0.17
328 0.19
329 0.19
330 0.18
331 0.19
332 0.18
333 0.18
334 0.22
335 0.24
336 0.21
337 0.24
338 0.27
339 0.23
340 0.25
341 0.26
342 0.22
343 0.17
344 0.16
345 0.14
346 0.16
347 0.19
348 0.2
349 0.19
350 0.19
351 0.24
352 0.26
353 0.31
354 0.32
355 0.32
356 0.3
357 0.32
358 0.33
359 0.32
360 0.31
361 0.24
362 0.2
363 0.18
364 0.2
365 0.18
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.1
373 0.11
374 0.11
375 0.1
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.08
390 0.11
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.16
395 0.18
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.2
400 0.18
401 0.2
402 0.21
403 0.19
404 0.16
405 0.15
406 0.13
407 0.09
408 0.1
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.06
422 0.09
423 0.11
424 0.13
425 0.18
426 0.21
427 0.28
428 0.35
429 0.45
430 0.48
431 0.54
432 0.59
433 0.59
434 0.67
435 0.67
436 0.71
437 0.71
438 0.72
439 0.73
440 0.77
441 0.81
442 0.81
443 0.85
444 0.86
445 0.87
446 0.9
447 0.92
448 0.93
449 0.95
450 0.96
451 0.96
452 0.96
453 0.96
454 0.94
455 0.92
456 0.86
457 0.82
458 0.74
459 0.64
460 0.6
461 0.56
462 0.52
463 0.46
464 0.43
465 0.42
466 0.46
467 0.53
468 0.5
469 0.52
470 0.56
471 0.63
472 0.7
473 0.74
474 0.76
475 0.73
476 0.79
477 0.8
478 0.83
479 0.83
480 0.82
481 0.83
482 0.85
483 0.88
484 0.88
485 0.87
486 0.86
487 0.87
488 0.83
489 0.81
490 0.77
491 0.7
492 0.6
493 0.51
494 0.42
495 0.31
496 0.26
497 0.18
498 0.1
499 0.07
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.04