Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1HVK6

Protein Details
Accession A0A2I1HVK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-260NQEHVLHNPKKRRGKGRPLGTKRFKSSQETKNKEKHQRRCKKCGNVGHYQKNCNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-244PKKRRGKGRPLGTKRFKSSQETKNKEKHQRR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences SSDDCNIEIRDASEAEVQQITLKQIIALVDLINITEIWSIIVNNTTAIKHYIVLLKNNSHICSCLSTIQQGVVCRHYFQVMLTTSNAKFHIRLISSRWYYKDLDGSNEPFFTADKFCKENDGIIQESPVHIDYLCAYGQDKDFLEEGLNTYQQRLVYGELHGMYKKALHKALQNKSSSQQLIDLLKEFTEETDEPSEDENFSDKENQEHVLHNPKKRRGKGRPLGTKRFKSSQETKNKEKHQRRCKKCGNVGHYQKNCNNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.15
9 0.15
10 0.12
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.1
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.14
38 0.19
39 0.21
40 0.26
41 0.29
42 0.29
43 0.34
44 0.36
45 0.35
46 0.29
47 0.28
48 0.24
49 0.22
50 0.22
51 0.2
52 0.18
53 0.18
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.21
61 0.21
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.14
66 0.18
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.2
71 0.19
72 0.21
73 0.22
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.21
78 0.18
79 0.2
80 0.21
81 0.29
82 0.31
83 0.33
84 0.33
85 0.31
86 0.31
87 0.31
88 0.33
89 0.25
90 0.26
91 0.27
92 0.28
93 0.25
94 0.24
95 0.22
96 0.16
97 0.16
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.16
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.1
116 0.07
117 0.05
118 0.06
119 0.05
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.1
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.1
134 0.09
135 0.11
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.19
155 0.2
156 0.27
157 0.36
158 0.45
159 0.48
160 0.46
161 0.44
162 0.44
163 0.48
164 0.42
165 0.32
166 0.26
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.13
175 0.09
176 0.12
177 0.11
178 0.14
179 0.16
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.13
189 0.17
190 0.16
191 0.18
192 0.2
193 0.22
194 0.22
195 0.24
196 0.27
197 0.33
198 0.39
199 0.44
200 0.51
201 0.57
202 0.66
203 0.72
204 0.78
205 0.78
206 0.83
207 0.86
208 0.87
209 0.89
210 0.89
211 0.91
212 0.9
213 0.88
214 0.84
215 0.81
216 0.75
217 0.72
218 0.73
219 0.71
220 0.73
221 0.72
222 0.74
223 0.77
224 0.82
225 0.84
226 0.85
227 0.86
228 0.86
229 0.89
230 0.9
231 0.91
232 0.91
233 0.91
234 0.91
235 0.9
236 0.86
237 0.86
238 0.87
239 0.87
240 0.83
241 0.81