FuNGI

A0A2I1H2J3

Protein Details

Accession

A0A2I1H2J3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
75-104	LDSSKRPAYRPLPKRPVKPQIEKKLVKEFI	Hydrophilic
185-204	AGARHNKKNLFKKRTTQIYL	Hydrophilic
725-745	TIIKAFRKRIHEDARNKERLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
65-97	PVPRGIPRKPLDSSKRPAYRPLPKRPVKPQIEK
468-505	PAGKALTKPKTSTKGKTPAKSTAEKPKGKIATASKTKS

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTNMENQQSSQPSMINSIYSSGSAWASRSINPNQFTSDFPKYFKSPADEARNKSIQDKEYEAKHPVPRGIPRKPLDSSKRPAYRPLPKRPVKPQIEKKLVKEFIITGSMINAVKKVNLMRLHRGNNVLDKFQAPVKLHRRDPEAPSSGTGNTRQNEIVIAPTLKTTQQHTGPTTGADTSKIAPFAGARHNKKNLFKKRTTQIYLADDRQRQLKAEERLPWVLEDYDGTNTWVGHFEETDAKYGFLIKDKQDENKLRFLPSHRWYAFRPQIKYKTLTIEEAEEEMARAKKRDNDRWMMRRWGKQNDNEKKIADEEGGIVELKSVMKTVENEEDLFGSDDEGLRRPRRGIESDEEMEFEQVFEDDEEELPDDANPIDEENAEVVKLKKKAIHKPTSLEGEDENEDSFKLTQEGMQLKKLVRKFDDNEAYDDSDQESNPYASEIEESEEELSSESPAITPIIGAAGTKPSPAGKALTKPKTSTKGKTPAKSTAEKPKGKIATASKTKSTAAKPIKSLSNLSASEEVPVKQKLKGSDIPAAKVPSKSHVKNMTAIPMSSTPEDSTKKPSSKPKSVKSVSPTSSKTSASQSQIALKKQKPATTVRQPVSEMATSFGKKSSAHDSFVSDDDKSIKRTKQSETSTATASINRSANANISSTVRTSNGGVVKRVREGEDSTSFTGKKVRTDKQVSGPQTSTAAQGTDSSNSRLISEREVRQIINKNSELTVTTIIKAFRKRIHEDARNKERLLEITKNIAVLKNGYLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.22
3	0.19
4	0.19
5	0.18
6	0.16
7	0.16
8	0.13
9	0.14
10	0.14
11	0.14
12	0.17
13	0.19
14	0.23
15	0.29
16	0.35
17	0.41
18	0.43
19	0.44
20	0.44
21	0.43
22	0.43
23	0.44
24	0.46
25	0.4
26	0.4
27	0.44
28	0.41
29	0.43
30	0.44
31	0.43
32	0.4
33	0.47
34	0.56
35	0.58
36	0.6
37	0.65
38	0.65
39	0.6
40	0.6
41	0.57
42	0.5
43	0.48
44	0.49
45	0.46
46	0.47
47	0.51
48	0.5
49	0.5
50	0.51
51	0.51
52	0.49
53	0.51
54	0.55
55	0.59
56	0.62
57	0.65
58	0.63
59	0.64
60	0.64
61	0.67
62	0.67
63	0.67
64	0.67
65	0.68
66	0.73
67	0.68
68	0.73
69	0.72
70	0.73
71	0.74
72	0.77
73	0.78
74	0.77
75	0.84
76	0.86
77	0.87
78	0.86
79	0.87
80	0.86
81	0.86
82	0.89
83	0.86
84	0.81
85	0.81
86	0.73
87	0.63
88	0.55
89	0.45
90	0.38
91	0.35
92	0.29
93	0.19
94	0.17
95	0.19
96	0.17
97	0.16
98	0.14
99	0.12
100	0.12
101	0.15
102	0.17
103	0.2
104	0.27
105	0.32
106	0.39
107	0.47
108	0.52
109	0.53
110	0.55
111	0.52
112	0.53
113	0.51
114	0.43
115	0.36
116	0.32
117	0.3
118	0.28
119	0.31
120	0.25
121	0.32
122	0.39
123	0.46
124	0.5
125	0.54
126	0.59
127	0.59
128	0.62
129	0.61
130	0.57
131	0.5
132	0.47
133	0.44
134	0.38
135	0.35
136	0.34
137	0.31
138	0.27
139	0.29
140	0.27
141	0.25
142	0.24
143	0.21
144	0.19
145	0.15
146	0.15
147	0.13
148	0.13
149	0.14
150	0.15
151	0.16
152	0.18
153	0.21
154	0.25
155	0.3
156	0.32
157	0.33
158	0.32
159	0.31
160	0.29
161	0.24
162	0.19
163	0.16
164	0.15
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.14
172	0.23
173	0.3
174	0.34
175	0.42
176	0.49
177	0.55
178	0.64
179	0.71
180	0.72
181	0.72
182	0.74
183	0.75
184	0.77
185	0.8
186	0.76
187	0.7
188	0.65
189	0.63
190	0.61
191	0.58
192	0.56
193	0.49
194	0.45
195	0.45
196	0.39
197	0.33
198	0.31
199	0.33
200	0.32
201	0.36
202	0.4
203	0.4
204	0.41
205	0.41
206	0.37
207	0.31
208	0.25
209	0.2
210	0.15
211	0.12
212	0.12
213	0.11
214	0.12
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.13
219	0.12
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.16
224	0.17
225	0.19
226	0.17
227	0.17
228	0.16
229	0.18
230	0.17
231	0.16
232	0.19
233	0.18
234	0.24
235	0.26
236	0.3
237	0.37
238	0.44
239	0.43
240	0.47
241	0.47
242	0.42
243	0.43
244	0.43
245	0.43
246	0.4
247	0.46
248	0.39
249	0.41
250	0.41
251	0.48
252	0.52
253	0.5
254	0.5
255	0.49
256	0.55
257	0.56
258	0.58
259	0.5
260	0.48
261	0.43
262	0.41
263	0.33
264	0.27
265	0.24
266	0.21
267	0.19
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.2
276	0.29
277	0.38
278	0.43
279	0.49
280	0.58
281	0.64
282	0.66
283	0.7
284	0.67
285	0.65
286	0.64
287	0.64
288	0.61
289	0.63
290	0.69
291	0.69
292	0.68
293	0.64
294	0.58
295	0.49
296	0.44
297	0.37
298	0.26
299	0.17
300	0.12
301	0.09
302	0.1
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.1
314	0.13
315	0.14
316	0.14
317	0.14
318	0.14
319	0.13
320	0.13
321	0.1
322	0.07
323	0.06
324	0.07
325	0.08
326	0.1
327	0.14
328	0.14
329	0.16
330	0.16
331	0.19
332	0.23
333	0.25
334	0.27
335	0.28
336	0.32
337	0.33
338	0.32
339	0.29
340	0.25
341	0.22
342	0.17
343	0.13
344	0.07
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.07
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.18
373	0.25
374	0.34
375	0.43
376	0.5
377	0.49
378	0.5
379	0.53
380	0.54
381	0.48
382	0.39
383	0.29
384	0.23
385	0.21
386	0.18
387	0.14
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.11
397	0.16
398	0.17
399	0.18
400	0.21
401	0.21
402	0.26
403	0.28
404	0.27
405	0.25
406	0.3
407	0.31
408	0.38
409	0.44
410	0.4
411	0.4
412	0.38
413	0.38
414	0.31
415	0.29
416	0.22
417	0.15
418	0.13
419	0.12
420	0.11
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.06
426	0.07
427	0.07
428	0.07
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.09
456	0.12
457	0.12
458	0.2
459	0.3
460	0.36
461	0.38
462	0.4
463	0.45
464	0.52
465	0.55
466	0.52
467	0.52
468	0.56
469	0.61
470	0.64
471	0.63
472	0.62
473	0.62
474	0.61
475	0.57
476	0.58
477	0.6
478	0.58
479	0.55
480	0.54
481	0.51
482	0.47
483	0.48
484	0.43
485	0.43
486	0.48
487	0.49
488	0.42
489	0.42
490	0.43
491	0.42
492	0.38
493	0.38
494	0.38
495	0.4
496	0.4
497	0.43
498	0.45
499	0.42
500	0.42
501	0.34
502	0.33
503	0.29
504	0.29
505	0.27
506	0.23
507	0.23
508	0.22
509	0.2
510	0.17
511	0.2
512	0.19
513	0.19
514	0.22
515	0.23
516	0.28
517	0.32
518	0.33
519	0.37
520	0.38
521	0.37
522	0.38
523	0.38
524	0.34
525	0.32
526	0.28
527	0.28
528	0.35
529	0.34
530	0.39
531	0.44
532	0.44
533	0.46
534	0.47
535	0.46
536	0.39
537	0.37
538	0.32
539	0.26
540	0.26
541	0.22
542	0.21
543	0.16
544	0.2
545	0.23
546	0.22
547	0.28
548	0.33
549	0.37
550	0.42
551	0.51
552	0.55
553	0.63
554	0.71
555	0.71
556	0.74
557	0.74
558	0.74
559	0.7
560	0.71
561	0.64
562	0.61
563	0.56
564	0.5
565	0.5
566	0.45
567	0.4
568	0.37
569	0.4
570	0.36
571	0.37
572	0.33
573	0.38
574	0.42
575	0.45
576	0.48
577	0.44
578	0.49
579	0.5
580	0.52
581	0.48
582	0.5
583	0.54
584	0.56
585	0.63
586	0.57
587	0.56
588	0.53
589	0.51
590	0.48
591	0.4
592	0.3
593	0.23
594	0.25
595	0.22
596	0.22
597	0.21
598	0.19
599	0.17
600	0.21
601	0.27
602	0.26
603	0.29
604	0.29
605	0.31
606	0.32
607	0.34
608	0.32
609	0.23
610	0.21
611	0.23
612	0.24
613	0.25
614	0.29
615	0.31
616	0.36
617	0.42
618	0.47
619	0.52
620	0.56
621	0.59
622	0.58
623	0.57
624	0.52
625	0.49
626	0.43
627	0.36
628	0.32
629	0.29
630	0.25
631	0.23
632	0.22
633	0.2
634	0.22
635	0.21
636	0.21
637	0.16
638	0.17
639	0.18
640	0.18
641	0.19
642	0.17
643	0.17
644	0.16
645	0.21
646	0.24
647	0.25
648	0.29
649	0.32
650	0.34
651	0.37
652	0.39
653	0.35
654	0.33
655	0.34
656	0.36
657	0.36
658	0.38
659	0.36
660	0.38
661	0.36
662	0.33
663	0.36
664	0.31
665	0.35
666	0.39
667	0.43
668	0.5
669	0.57
670	0.63
671	0.66
672	0.73
673	0.68
674	0.66
675	0.6
676	0.51
677	0.47
678	0.41
679	0.33
680	0.25
681	0.21
682	0.15
683	0.17
684	0.17
685	0.19
686	0.2
687	0.21
688	0.23
689	0.23
690	0.24
691	0.26
692	0.25
693	0.29
694	0.35
695	0.37
696	0.41
697	0.43
698	0.43
699	0.47
700	0.55
701	0.53
702	0.54
703	0.51
704	0.46
705	0.44
706	0.44
707	0.38
708	0.31
709	0.3
710	0.23
711	0.23
712	0.23
713	0.26
714	0.3
715	0.35
716	0.39
717	0.39
718	0.46
719	0.51
720	0.58
721	0.66
722	0.7
723	0.75
724	0.79
725	0.83
726	0.82
727	0.75
728	0.68
729	0.62
730	0.58
731	0.55
732	0.51
733	0.44
734	0.45
735	0.45
736	0.44
737	0.42
738	0.38
739	0.32
740	0.27
741	0.26
742	0.22

A0A2I1H2J3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer