Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2I1HAV0

Protein Details
Accession A0A2I1HAV0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-93SNYGAPSKPSAKPRKRNPLQMQLSDHydrophilic
106-135SSPLPFSTQKRQTKRIRQNLRKNNNFHNKEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences IYFKNKQRVLPNSSKNLLIYNGNTCKAYQEIIRLYNLQGNLIFNHIKRSILNHINDPFQPDGLNIYTSSNYGAPSKPSAKPRKRNPLQMQLSDISSNIPSNLPLNSSPLPFSTQKRQTKRIRQNLRKNNNFHNKENIQIPTNNTQFILPSLKKPKLTEYIEYNFDEVDELEPLEDELNIDQMKETCPFCDEILPDPMSDRMKLALDRINNKQGKISASDWMDFCFIHFAELSIIPSGIANKYPFIINFDELPCRINRFKDDLTEIINGNTHSYYLSFTKQVYQEVGHKKAAAPMMLMNRFQSLRPEYYGTKDALLIANTLIDFFITTKILTPVNSYPLQTANYIQEVLVPETVMRLIFEDIGGNSSLETAQNIMIASSDFGDYVHSCDNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.57
3 0.51
4 0.45
5 0.38
6 0.33
7 0.33
8 0.36
9 0.36
10 0.36
11 0.33
12 0.33
13 0.29
14 0.29
15 0.22
16 0.25
17 0.29
18 0.31
19 0.34
20 0.33
21 0.33
22 0.35
23 0.32
24 0.26
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.22
29 0.24
30 0.19
31 0.26
32 0.25
33 0.25
34 0.24
35 0.29
36 0.33
37 0.38
38 0.41
39 0.42
40 0.44
41 0.46
42 0.46
43 0.45
44 0.37
45 0.29
46 0.26
47 0.19
48 0.2
49 0.17
50 0.17
51 0.13
52 0.14
53 0.14
54 0.14
55 0.16
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.22
62 0.27
63 0.31
64 0.41
65 0.51
66 0.59
67 0.68
68 0.75
69 0.81
70 0.83
71 0.89
72 0.87
73 0.87
74 0.85
75 0.77
76 0.72
77 0.62
78 0.56
79 0.45
80 0.36
81 0.26
82 0.19
83 0.17
84 0.12
85 0.11
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.11
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.22
97 0.23
98 0.27
99 0.32
100 0.4
101 0.49
102 0.55
103 0.64
104 0.69
105 0.77
106 0.84
107 0.84
108 0.86
109 0.87
110 0.91
111 0.92
112 0.93
113 0.9
114 0.85
115 0.85
116 0.84
117 0.79
118 0.71
119 0.69
120 0.6
121 0.54
122 0.54
123 0.45
124 0.37
125 0.34
126 0.35
127 0.33
128 0.33
129 0.3
130 0.26
131 0.23
132 0.21
133 0.2
134 0.23
135 0.16
136 0.22
137 0.29
138 0.32
139 0.35
140 0.36
141 0.39
142 0.41
143 0.43
144 0.4
145 0.4
146 0.4
147 0.41
148 0.4
149 0.35
150 0.26
151 0.22
152 0.19
153 0.12
154 0.09
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.08
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.16
180 0.17
181 0.15
182 0.15
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.12
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.14
192 0.16
193 0.21
194 0.24
195 0.32
196 0.33
197 0.32
198 0.32
199 0.31
200 0.29
201 0.28
202 0.26
203 0.21
204 0.21
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.19
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.15
235 0.16
236 0.17
237 0.17
238 0.19
239 0.15
240 0.18
241 0.2
242 0.2
243 0.22
244 0.27
245 0.28
246 0.3
247 0.33
248 0.29
249 0.31
250 0.3
251 0.27
252 0.21
253 0.21
254 0.17
255 0.15
256 0.13
257 0.1
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.21
269 0.21
270 0.28
271 0.34
272 0.37
273 0.34
274 0.33
275 0.32
276 0.34
277 0.34
278 0.26
279 0.2
280 0.2
281 0.26
282 0.28
283 0.27
284 0.24
285 0.24
286 0.24
287 0.24
288 0.26
289 0.24
290 0.24
291 0.26
292 0.3
293 0.29
294 0.33
295 0.36
296 0.3
297 0.26
298 0.24
299 0.22
300 0.2
301 0.19
302 0.15
303 0.11
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.07
313 0.08
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.18
319 0.19
320 0.24
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.26
325 0.27
326 0.23
327 0.23
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.19
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.19
336 0.15
337 0.13
338 0.14
339 0.15
340 0.11
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.12
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.07
367 0.07
368 0.11
369 0.11
370 0.14